1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' |
AACAAGAATCAAGGAGTATCTTCCCATTGTTGGATTGGTTGAGTTCAACAAGTTAAGCGCTAAGCTCATACTAGGCGCTGACAGgtatgcattctctgtttattctttatgttttcatcactttgttttttctttagacaattctttatgattggtgttctcatgtatggtttag
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT5G11520.1 |
intron # | 4 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TTGGTTGAGTTCAACAAGTTAAGCGCTAAGCTCATACTAGGCGCTGACAG TCCTGCTATTCGGGAGAATCGGATTACCACCGTGGAGTGTTTGTCTGGTACEST: gi|301502006|gb|HO207546.1|HO207546
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EST: TTGGTTGAGTTCAACAAGTTAAGCGCTAAGCTCATACTAGGCGCTGACAG TCCTGCTATTCGGGAEST: gi|301501550|gb|HO207090.1|HO207090
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EST: TTGGTTGAGTTCAACAAGTTAAGCGCTAAGCTCATACTAGGCGCTGACAG TCCTGCTATTCGGNAGAATCGGATTACCACCGTGGAGTGTTTGTCTGGTACEST: gi|301501070|gb|HO206610.1|HO206610
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EST: TTGGTTGAGTTCAACAAGTTAAGCGCTAAGCTCATACTAGGCGCTGACAG TCCTGCTATTCGGGAGAATCGGATTACCACCGTGGAGTGTTTGTCTGGTACEST: gi|86054404|gb|DR350161.1|DR350161
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genomic: TTGGTTGAGTTCAACAAGTTAAGCGCTAAGCTCATACTAGGCGCTGACAGgtatgcattc ... tatggtttagTCCTGCTATTCGGGAGAATCGGATTACCACCGTGGAGTGTTTGTCTGGTAC
EST: TTGGTTGAGTTCAACAAGTTAAGCGCTAAGCTCATACTAGGCGCTGACAG TCCTGCTATTCGGGAGAATCGGATTACCACCGEST: gi|116468511|gb|EG511103.1|EG511103
genomic: TTGGTTGAGTTCAACAAGTTAAGCGCTAAGCTCATACTAGGCGCTGACAGgtatgcattc ... tatggtttagTCCTGCTATTCGGGAGAATCGGATTACCACCG
EST: TTGGTTGAGTTCAACAAGTTGAGCGCTAAGCTCATACTAGGCGCTGACAG TCCTGCTATTCGGGAGAATCGGATTACCACCGTGGAGTGTTTGTCTGGTACEST: gi|86054408|gb|DR350165.1|DR350165
genomic: TTGGTTGAGTTCAACAAGTTAAGCGCTAAGCTCATACTAGGCGCTGACAGgtatgcattc ... tatggtttagTCCTGCTATTCGGGAGAATCGGATTACCACCGTGGAGTGTTTGTCTGGTAC
EST: TTGGTTGAGTTCAACAAGTTAAGCGCTAAGCTCATACTAGGCGCTGACAG TCCTGCTATTCGGGAGAATCGGATTACCACCGTGGAGTGTTTGTCTGGTAC
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atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| AACAAGAATCAAGGAGTATCTTCCCATTGTTGGATTGGTTGAGTTCAACAAGTTAAGCGCTAAGCTCATACTAGGCGCTGACAGgtatgcattctctgtttattctttatgttttcatcactttgttttttctttagacaattctttatgattggtgttctcatgtatggtttag
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