1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
CCATGCGAGATGGGCTATGTTAGGAGCAGCTGGTTTCATCATTCCTGAAGCTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcctacgtctaatctttatttacattcagacttagattctttagcaaagcaagaatgtgttgatgtgatgagatggttctttttggaatactgattgcag
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT4G10340.1 |
intron # | 4 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: AAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|124996576|gb|EL068845.1|EL068845
genomic: AAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: CTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|86081972|gb|DR377731.1|DR377731
genomic: CTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|125287654|gb|EL301739.1|EL301739
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: AAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGTTAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|124957809|gb|EL032604.1|EL032604
genomic: AAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTG--AAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGEST: gi|125315856|gb|EL329941.1|EL329941
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGG
EST: ATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTAGAACTACTTTGGCAAGAAEST: gi|124999919|gb|EL072188.1|EL072188
genomic: ATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATT-GAACTACTTTGGCAAGAA
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGEST: gi|125288245|gb|EL302330.1|EL302330
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTG
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAEST: gi|125089638|gb|EL147930.1|EL147930
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAA
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTEST: gi|125259643|gb|EL273728.1|EL273728
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCT
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAEST: gi|125008497|gb|EL080766.1|EL080766
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGA
EST: AACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|124727748|gb|EH819150.1|EH819150
genomic: AACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|125166825|gb|EL192437.1|EL192437
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG -CTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACEST: gi|124852042|gb|EH936479.1|EH936479
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACAC
EST: CTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|125071080|gb|EL136259.1|EL136259
genomic: CTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: TTAAACAAATATGGCGCTAACTTGTTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGEST: gi|125253966|gb|EL268051.1|EL268051
genomic: TTAAACAAATATGGCGCTAAC-TG-TGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAG
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATEST: gi|125057435|gb|EL126634.1|EL126634
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGAT
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAAEST: gi|125279786|gb|EL293871.1|EL293871
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAA
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGEST: gi|124824122|gb|EH908988.1|EH908988
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTG
EST: TCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|124754999|gb|EH845129.1|EH845129
genomic: TCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: CTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|125142873|gb|EL179895.1|EL179895
genomic: CTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGEST: gi|125033981|gb|EL106250.1|EL106250
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAG
EST: GGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTCGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|125107617|gb|EL160850.1|EL160850
genomic: GGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACACTGAACTACTTTGGCAAEST: gi|124964246|gb|EL038526.1|EL038526
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAA
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCEST: gi|125041370|gb|EL113639.1|EL113639
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTC
EST: TCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|124764302|gb|EH854432.1|EH854432
genomic: TCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: CTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|47831762|gb|CK121446.1|CK121446
genomic: CTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: C-TTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|125201370|gb|EL216324.1|EL216324
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: CTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|125292759|gb|EL306844.1|EL306844
genomic: CTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: TCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|125313402|gb|EL327487.1|EL327487
genomic: TCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: GTGGCCCTCGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|116402169|gb|EG444761.1|EG444761
genomic: GTGGCCCT-GAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAAC-CATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|125304534|gb|EL318619.1|EL318619
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: TGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|125218595|gb|EL232678.1|EL232678
genomic: TGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTEST: gi|124706583|gb|EH797985.1|EH797985
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTT
EST: AATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|125312186|gb|EL326271.1|EL326271
genomic: AATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: AAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|124811238|gb|EH896104.1|EH896104
genomic: AAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: CTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|116467517|gb|EG510109.1|EG510109
genomic: CTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|125317575|gb|EL331660.1|EL331660
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: CGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|124915047|gb|EH988921.1|EH988921
genomic: CGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: CAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|125100638|gb|EL156016.1|EL156016
genomic: CAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: CTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|125282502|gb|EL296587.1|EL296587
genomic: CTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: AAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|124992584|gb|EL064853.1|EL064853
genomic: AAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: TCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|125275931|gb|EL290016.1|EL290016
genomic: TCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: TTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTAGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTEST: gi|125149713|gb|EL182732.1|EL182732
genomic: TTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCT-GAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTT
EST: GGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|124949308|gb|EL024941.1|EL024941
genomic: GGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: CCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAGCACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|125151207|gb|EL183459.1|EL183459
genomic: CCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGEST: gi|124814931|gb|EH899797.1|EH899797
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGG
EST: GTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGEST: gi|116399289|gb|EG441881.1|EG441881
genomic: GTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAG
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|124941983|gb|EL018289.1|EL018289
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACAEST: gi|125129775|gb|EL173362.1|EL173362
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACA
EST: GCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|125239900|gb|EL253985.1|EL253985
genomic: GCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: CTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|124998160|gb|EL070429.1|EL070429
genomic: CTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: GTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAEST: gi|125206766|gb|EL221720.1|EL221720
genomic: GTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGG-TGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAA
EST: TTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|124825850|gb|EH910716.1|EH910716
genomic: TTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTT-GGCAAGAACEST: gi|125308464|gb|EL322549.1|EL322549
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: TTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTEST: gi|164218088|gb|ES123636.1|ES123636
genomic: TTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTG-AAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACT
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCEST: gi|125243949|gb|EL258034.1|EL258034
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGC
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACCGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGEST: gi|86059765|gb|DR355522.1|DR355522
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGG
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|124993521|gb|EL065790.1|EL065790
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: TGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTTTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAEST: gi|125100183|gb|EL155735.1|EL155735
genomic: TGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGG--TGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGA
EST: CTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|125248888|gb|EL262973.1|EL262973
genomic: CTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGEST: gi|125098098|gb|EL154349.1|EL154349
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGG
EST: TTTAAACAAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTEST: gi|124845525|gb|EH929962.1|EH929962
genomic: TTTAAAC-AAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTT
EST: TGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|125244534|gb|EL258619.1|EL258619
genomic: TGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: ATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|125245531|gb|EL259616.1|EL259616
genomic: ATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: ACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|125035469|gb|EL107738.1|EL107738
genomic: ACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: TGGCCCCGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|124863782|gb|EH948219.1|EH948219
genomic: TGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAAEST: gi|124781821|gb|EH871764.1|EH871764
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAA
EST: TTTAAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGEST: gi|124909832|gb|EH983912.1|EH983912
genomic: TTT-AAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTG
EST: TATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|124821079|gb|EH905945.1|EH905945
genomic: TATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGACCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGEST: gi|86080759|gb|DR376516.1|DR376516
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGG
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|124800547|gb|EH890212.1|EH890212
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: AAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGTCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAEST: gi|124955539|gb|EL030544.1|EL030544
genomic: AAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTG-CTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAA
EST: ATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|125253233|gb|EL267318.1|EL267318
genomic: ATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTEST: gi|125209367|gb|EL224321.1|EL224321
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACT
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATEST: gi|124831518|gb|EH915957.1|EH915957
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACAT
EST: TGGCGCTAACTGTGGCCC-GAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|125293039|gb|EL307124.1|EL307124
genomic: TGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTEST: gi|124726606|gb|EH818008.1|EH818008
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACT
EST: TGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACAACTTTGGCAAGAACEST: gi|125017289|gb|EL089558.1|EL089558
genomic: TGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: CGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|124952255|gb|EL027541.1|EL027541
genomic: CGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: CTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAACEST: gi|125206866|gb|EL221820.1|EL221820
genomic: CTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAACACATTGAACTACTTTGGCAAGAAC
EST: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAG ACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAAC
genomic: CTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcct ... ctgattgcagACTGGTGCTTTGCTTCTTGATGGAAAC
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| CCATGCGAGATGGGCTATGTTAGGAGCAGCTGGTTTCATCATTCCTGAAGCTTTAAACAAATATGGCGCTAACTGTGGCCCTGAAGCTGTCTGGTTTAAGgttcttgcctacgtctaatctttatttacattcagacttagattctttagcaaagcaagaatgtgttgatgtgatgagatggttctttttggaatactgattgcag
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CTGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGAAGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGCTG