Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACATgtaagtttacattttacatcatcactttttctcactaggcagatgagagatcattaaactcggttttatgaaaactacag

Basic information

species Arabidopsis thaliana
transcript AT2G24320.1
intron # 4
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|116451180|gb|EG493772.1|EG493772
EST:     AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCCTACAT                         GGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
genomic: AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACATgtaagtttac ... aaaactacagGGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
EST: gi|116451170|gb|EG493762.1|EG493762
EST:     AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACAT                         GGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
genomic: AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACATgtaagtttac ... aaaactacagGGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
EST: gi|116451184|gb|EG493776.1|EG493776
EST:     AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACAT                         GGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
genomic: AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACATgtaagtttac ... aaaactacagGGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
EST: gi|116451186|gb|EG493778.1|EG493778
EST:     AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACAT                         GGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
genomic: AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACATgtaagtttac ... aaaactacagGGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
EST: gi|116451191|gb|EG493783.1|EG493783
EST:     AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACAT                         GGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
genomic: AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACATgtaagtttac ... aaaactacagGGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
EST: gi|116451174|gb|EG493766.1|EG493766
EST:     AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACAT                         GGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
genomic: AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACATgtaagtttac ... aaaactacagGGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
EST: gi|116451188|gb|EG493780.1|EG493780
EST:     AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACAT                         GGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
genomic: AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACATgtaagtttac ... aaaactacagGGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
EST: gi|116451178|gb|EG493770.1|EG493770
EST:     AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACAT                         GGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
genomic: AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACATgtaagtttac ... aaaactacagGGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
EST: gi|116451183|gb|EG493775.1|EG493775
EST:     AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCCTACAT                         GGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
genomic: AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACATgtaagtttac ... aaaactacagGGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
EST: gi|116451175|gb|EG493767.1|EG493767
EST:     AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACAT                         GGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
genomic: AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACATgtaagtttac ... aaaactacagGGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
EST: gi|116451173|gb|EG493765.1|EG493765
EST:     AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACAT                         GGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
genomic: AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACATgtaagtttac ... aaaactacagGGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
EST: gi|116451185|gb|EG493777.1|EG493777
EST:     AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACAT                         GGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
genomic: AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACATgtaagtttac ... aaaactacagGGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
EST: gi|116451181|gb|EG493773.1|EG493773
EST:     AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCCTACAT                         GGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
genomic: AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACATgtaagtttac ... aaaactacagGGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
EST: gi|116451189|gb|EG493781.1|EG493781
EST:     AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACAT                         GGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
genomic: AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACATgtaagtttac ... aaaactacagGGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
EST: gi|116451172|gb|EG493764.1|EG493764
EST:     AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACAT                         GGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
genomic: AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACATgtaagtttac ... aaaactacagGGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
EST: gi|116451179|gb|EG493771.1|EG493771
EST:     AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCCTACAT                         GGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
genomic: AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACATgtaagtttac ... aaaactacagGGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
EST: gi|116451177|gb|EG493769.1|EG493769
EST:     AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACAT                         GGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
genomic: AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACATgtaagtttac ... aaaactacagGGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
EST: gi|116451176|gb|EG493768.1|EG493768
EST:     AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACAT                         GGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
genomic: AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACATgtaagtttac ... aaaactacagGGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
EST: gi|116451187|gb|EG493779.1|EG493779
EST:     AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACAT                         GGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA
genomic: AACATTGACAAGATACGCCATGTAACATGCCCTGTTCTTGTCATACATgtaagtttac ... aaaactacagGGAACAAAAGATGATATTGTGAATATGTCACATGGGAAGCGATTGTGGGAA