Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTAGAGTGAAGAATCAAGAGTTCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttttcttcctcatcacacccacaagaattaaaatctgccggtgaaaacgatgataaaatctggaaaatgatattgatacaaacag

Basic information

species Arabidopsis thaliana
transcript AT5G66170.1
intron # 3
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|86063025|gb|DR358782.1|DR358782
EST:     CTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: CTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATG-ATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063042|gb|DR358799.1|DR358799
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063006|gb|DR358763.1|DR358763
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86087471|gb|DR383230.1|DR383230
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063036|gb|DR358793.1|DR358793
EST:     CTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCNGATCCTTAAAAGCCACNACTGAACTTGTTGC
genomic: CTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCC-TTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGC
EST: gi|152037864|gb|BP800677.2|BP800677
EST:     CTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGCTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGC
genomic: CTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTG-TGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGC
EST: gi|86063026|gb|DR358783.1|DR358783
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063037|gb|DR358794.1|DR358794
EST:     CTTGGAGCAAGTATCTTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: CTTGGAGCAAGTATCTT-CTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063032|gb|DR358789.1|DR358789
EST:     TNTTGGAGCAAGTATNTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGNGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063041|gb|DR358798.1|DR358798
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063021|gb|DR358778.1|DR358778
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86072845|gb|DR368602.1|DR368602
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063015|gb|DR358772.1|DR358772
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063023|gb|DR358780.1|DR358780
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTTTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063005|gb|DR358762.1|DR358762
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063010|gb|DR358767.1|DR358767
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063020|gb|DR358777.1|DR358777
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063044|gb|DR358801.1|DR358801
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063008|gb|DR358765.1|DR358765
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86018801|gb|DR314547.1|DR314547
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAARAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063039|gb|DR358796.1|DR358796
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063035|gb|DR358792.1|DR358792
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063038|gb|DR358795.1|DR358795
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063013|gb|DR358770.1|DR358770
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063048|gb|DR358805.1|DR358805
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063016|gb|DR358773.1|DR358773
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063017|gb|DR358774.1|DR358774
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063022|gb|DR358779.1|DR358779
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGT--AGCCAGATCCTTAARAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|301502023|gb|HO207563.1|HO207563
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063043|gb|DR358800.1|DR358800
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|47832061|gb|CK121745.1|CK121745
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063024|gb|DR358781.1|DR358781
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063027|gb|DR358784.1|DR358784
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063018|gb|DR358775.1|DR358775
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063031|gb|DR358788.1|DR358788
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063045|gb|DR358802.1|DR358802
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063009|gb|DR358766.1|DR358766
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTNTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063033|gb|DR358790.1|DR358790
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063046|gb|DR358803.1|DR358803
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063014|gb|DR358771.1|DR358771
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063040|gb|DR358797.1|DR358797
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063034|gb|DR358791.1|DR358791
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
EST: gi|86063019|gb|DR358776.1|DR358776
EST:     TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTG                         GGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAARAGCCACAACTGAACTTGTTGCT
genomic: TCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttt ... atacaaacagGGTTGTCAGAGTGGAGCCAGATCCTTAAAAGCCACAACTGAACTTGTTGCT

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
GTAGAGTGAAGAATCAAGAGTTCTTGGAGCAAGTATCTTCTCTTCTAAACCCAGCTGATGATATCCTTGTGgtaactcttttcttcctcatcacacccacaagaattaaaatctgccggtgaaaacgatgataaaatctggaaaatgatattgatacaaacag

- - - - - - - - - - -  TTGGAG
- - - - - - - - - - - -  GGAGCA
- - - - - - - - - - - - -  AGCAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  CAGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCTGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GCTGAT