1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
GTACCCATATGTTACTGGAACTTCAATTGTTGCAATCAAGTACAAAGATGGGGTTTTGATGGCTTCTGATATGGGAGgtatgtctcagctcctagtttcagctctttatttggttaagtatttgtattggtttaatgtatgcacaaatttttgcaatgtatgtttagatttacatct...
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT1G56450.1 |
intron # | 3 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TGTTGCAATCAAGTACAAAGATGGGGTTTTGATGGCTTCTGATATGGGAG GTTCATATGGATCAACCTTAAGATACAAGAACATCGAGAGAGTGAAGGCTAEST: gi|124883403|gb|EH962305.1|EH962305
genomic: TGTTGCAATCAAGTACAAAGATGGGGTTTTGATGGCTTCTGATATGGGAGgtatgtctca ... ttgcatgcagGTTCATATGGATCAACCTTAAGATACAAGAACATCGAGAGAGTGAAGGCTA
EST: TTGCAATCAAGTACAAAGATGGGGTTTTGATGGCTTCTGATATGGGAG GTTCATATGGATCAACCTTAAGATACAAGAACATCGAGAGAGTGAAGGCTAEST: gi|116438502|gb|EG481094.1|EG481094
genomic: TTGCAATCAAGTACAAAGATGGGGTTTTGATGGCTTCTGATATGGGAGgtatgtctca ... ttgcatgcagGTTCATATGGATCAACCTTAAGATACAAGAACATCGAGAGAGTGAAGGCTA
EST: TGTTGCAATCAAGTACAAAGATGGGGTTTTGATGGCTTCTGATATGGGAG GTTCATATGGATCAACCTTAAGATACAAGAACATCGAGAGAGTGAAGGCTAEST: gi|86055051|gb|DR350808.1|DR350808
genomic: TGTTGCAATCAAGTACAAAGATGGGGTTTTGATGGCTTCTGATATGGGAGgtatgtctca ... ttgcatgcagGTTCATATGGATCAACCTTAAGATACAAGAACATCGAGAGAGTGAAGGCTA
EST: TGTTGCAATCAAGTACAAAGATGGGGTTTTGATGGCTTCTGATATGGGAG GTTCATATGGATCAACCTTAAGATACAAGAACATCGAGAGAGTGAAGGCTAEST: gi|125150851|gb|EL183285.1|EL183285
genomic: TGTTGCAATCAAGTACAAAGATGGGGTTTTGATGGCTTCTGATATGGGAGgtatgtctca ... ttgcatgcagGTTCATATGGATCAACCTTAAGATACAAGAACATCGAGAGAGTGAAGGCTA
EST: TTTTGATGGCTTCTGATATGGGAG GTTCATATGGATCAACCTTAAGATACAAGAACATCGAGAGAGTAGAAAGGCEST: gi|86055050|gb|DR350807.1|DR350807
genomic: TTTTGATGGCTTCTGATATGGGAGgtatgtctca ... ttgcatgcagGTTCATATGGATCAACCTTAAGATACAAGAACATCGAGAGAGT-GAA-GGC
EST: TGTTGCAATCAAGTACAAAGATGGGGTTTTGATGGCTTCTGATATGGGAG GTTCATATGGATCAACCTTAAGATACAAGAACATCGAGAGAGTGAAGGCTA
genomic: TGTTGCAATCAAGTACAAAGATGGGGTTTTGATGGCTTCTGATATGGGAGgtatgtctca ... ttgcatgcagGTTCATATGGATCAACCTTAAGATACAAGAACATCGAGAGAGTGAAGGCTA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| GTACCCATATGTTACTGGAACTTCAATTGTTGCAATCAAGTACAAAGATGGGGTTTTGATGGCTTCTGATATGGGAGgtatgtctcagctcctagtttcagctctttatttggttaagtatttgtattggtttaatgtatgcacaaatttttgcaatgtatgtttagatttacatct
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGATG