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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CCTCTCAACATTTGCTCTTATAGGTACTGTCAGTACAATTTCGTTGTGGGCAATAATGCCACTCCTAATACTGTTTTATGCAGCATATCTCTACTATCAGgtaattttctaattcggggcaatgtcagatacatgcacaattgattttaagatatatggtccacttggaattaatatcacttctgtgatttgtag

Basic information

species Arabidopsis thaliana
transcript AT1G30410.1
intron # 24
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: AT1G30410.1 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 24
lower sequence: Vv10s0003g04470.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 23
CCTCTCAACATTTGCTCTTATAGGTACTGTCAGTACAATTTCGTTGTGGGCAATAATGCCACTCCTAATACTGTTTTATGCAGCATATCTCTACTATCAGgtaattttctaattcg--gggcaatgtc--agatacatgcacaattgattttaagatatatggtccacttgga-attaatatcacttctgtgatttgtag
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CCTTTCCACTTTTGTACTGATTGCCATTGTCAGCACCATATCCCTGTGGGCCATAATGCCACTTCTGATATTGTTTTATGCAGCCTATCTATATTACCAGgtaggtttctcacatgtcatgtagtgtctcaactactaaagcttttcttcatttgttttctgatttgcagagataaccataagacctatttgatatccat