1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
ATTGATGAAAATGTTCAGAGGGAGATTATCAATCATAGATCATTGAGACATCCTAATATTGTTAGGTTTAAAGAGgtataatataatacaccttgatgtttcttctgtgtgtgtttgtgtattaagtcagtgtggtttagagtttgttttgtgtgtgtttttgtaatggtttag
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT3G50500.1 |
intron # | 2 |
splice site | 5' |
intron type | U2 |
EST: TTATCAATCATAGATCATTGAGACATCCTAATATTGTTAGGTTTAAAGAG GTGATTTTGACGCCTTCCCATTTGGCTATTGTTATGGAATATGCTGCTGGTEST: gi|116437302|gb|EG479894.1|EG479894
genomic: TTATCAATCATAGATCATTGAGACATCCTAATATTGTTAGGTTTAAAGAGgtataatata ... aatggtttagGTGATTTTGACGCCTTCCCATTTGGCTATTGTTATGGAATATGCTGCTGGT
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genomic: TTATCAATCATAGATCATTGAGACATCCTAATATTGTTAGGTTTAAAGAGgtataatata ... aatggtttagGTGATTTTGACGCCTTCCCATTTGGCTATTGTTATGGAATATGCTGCTGGT
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genomic: TTATCAATCATAGATCATTGAGACATCCTAATATTGTTAGGTTTAAAGAGgtataatata ... aatggtttagGTGATTTTGACGCCTTCCCATTTGGCTATTGTTATGGAATATGCTGCTGGT
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EST: AATCATAGATCATTGAGACATCCTAATATTGTTAGGTTTAAAGAG GTGATTTTGACGCCTTCCCATTTGGCTA
genomic: AATCATAGATCATTGAGACATCCTAATATTGTTAGGTTTAAAGAGgtataatata ... aatggtttagGTGATTTTGACGCCTTCCCATTTGGCTA
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ATTGATGAAAATGTTCAGAGGGAGATTATCAATCATAGATCATTGAGACATCCTAATATTGTTAGGTTTAAAGAGgtataatataatacaccttgatgtttcttctgtgtgtgtttgtgtattaagtcagtgtggtttagagtttgttttgtgtgtgtttttgtaatggtttag
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