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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CTACTCTGAAGTTGAATACTTCAAGCAAACGTTGCGACAAGGTGCTCCAGCTAAACCTAAAGAGCCTAGAATTCCACGCATGCCCCAATTgtgagtacctcaattgtctccactctgcatttagccttttccctgtcttatttatagtacttttatcgtaaaaatctaatttcttgtccatcctgcag

Basic information

species Arabidopsis thaliana
transcript AT5G18620.2
intron # 17
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: AT5G18620.1 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 17
lower sequence: Vv05s0020g01780.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 17
CTACTCTGAAGTTGAATACTTCAAGCAAACGTTGCGACAAGGTGCTCCAGCTAAACCTAAAGAGCCTAGAATTCCACGCATGCCCCAATTgtgagtacctc----aattgtctccactct------gcatttagccttttc-cctgtcttatttatagtacttttatcgtaaaaatctaatttcttgtccatcctgcag
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TTACTCAGAGTCTGAATACTTTAAGCAAACAATGCGGCAAGGTGCTCCAGCAAAACAAAGAGAGCCTAGAATACCGCGCATGCCCCAGCTgtaagcatctctttgaactgattgctttcttggattgtagttgatgttttcatctgctttatatgttttgcctctgtttttag--------------------------