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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTGTTTACTTGTCTTGCTTTGTTTAATAGCTTAATCTCTCCATTAAACTCGTTTCCATGGGTCATCAACGGTCTCATTGATgtaagattatctttcgatcatattaagaagcatttttatctaccattttagttatatatcatttttgttaccttgttgcag

Basic information

species Arabidopsis thaliana
transcript AT2G07680.1
intron # 16
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: AT2G07680.1 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 16
lower sequence: Vv09s0018g00310.t01 (Vitis vinifera), 5'ss of exon 8
GTGTTTACTTGTCTTGCTTTGTTTAATAGCTTAATCTCTCCATTAAACTCGTTTCCATGGGTCATCAACGGTCTCATTGATgtaaga---ttatctttcgatc--atattaagaagcatt--tttatctaccattttagttatatatcatttttgt--taccttgttgcag------------------------------------
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GTCTTTACTTGTCTTGCTTTGTTTAATACTTTGATCTCTCCTCTAAATTCATTCCCATGGGTGATCAACGGATTGATTGATgtgagtagtccatgttcatgtttgatacttataagctttgatctttcctctggttaataattataacgtttcaacaataaatggttttggatttaaaagctacatcctctctcatccttatctcag