Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

GTACCTTTATTGATGAAGGATTCAGATGCACTGAGTTTGGGAGACCTGATTTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgtttcattttctctctttgtttgatgttctgggattagaaatgttatgtttaggaaatattgtatggcatgagtagagtaagttaggaggaagaactttagaaccatatgtgttacttttgaattcagttacttaaagcttactcatttttgttatggaatgtatcag

Basic information

species Arabidopsis thaliana
transcript AT5G19160.1
intron # 1
splice site 5'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: AT5G19160.1 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 1
lower sequence: GLYMA13G27750.1 (Glycine max), 5'ss of exon 1
GTACCTTTATTGATGAAGGATTCAGATGCACTGAGTTTGGGAGACCTGATTTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgtttcattttctctctttgtttgatgttctgggattagaaatgttatgtttaggaaatattgtatggcatgagtagagtaagttaggaggaagaactttagaaccatatgtgttacttttgaattcagttacttaaagcttactcatttttgttatggaatgtatcag
||| |||  |||||| ||||||  | ||| |||||   || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||   |||  | ||||||||||| |  | |  | |  | | ||  ||||   |  |    || | | | ||  ||| |  ||||  |  ||   || |  | |||    ||      |  ||||                                                                      
GTAGCTTCCTTGATGGAGGATTTCGGTGCTCTGAGAACGGAAGACCTGATTTGTTCTACACAAAGTGGAGGTGGCAACCCAAAGCTTGCAACTTGCCCAGgtacacttatgttatgatgttttattttgtcatcatct--ttggcacttttgcgttaaaaaaat--taaattaaattaaaatagtgtaataaagtttaagactt----------------------------------------------------------------------

upper sequence: AT5G19160.1 (Arabidopsis thaliana), 5'ss of exon 1
lower sequence: GLYMA15G11220.1 (Glycine max), 5'ss of exon 1
GTACCTTTATTGATGAAGGATTCAGATGCACTGAGTTTGGGAGACCTGATTTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgtttcattttctctctttgtttgatgttctgggattagaaatgttatgtttaggaaatattgtatggcatgagtagagtaagttaggaggaagaactttagaaccatatgtgttacttttgaattcagttacttaaagcttactcatttttgttatggaatgtatcag
| | |||  |||||| ||||||  | ||  |||||  ||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||   |||  | ||||||||||| |  ||   || |    |||| |||  | || ||   | |    ||  |  ||| | |  ||    |||  || | || |||| |  |     |  || ||                                                                      
GCAGCTTCCTTGATGGAGGATTTCGGTGTTCTGAGAATGGAAGACCTGATTTGTTCTACACAAAGTGGAGGTGGCAACCCAAAGCTTGCAACTTGCCCAGgtacac-ttatgttatgatgctttttttttttttttgtcgtcatctttggcactttt-gcatgtaaaa-atgatataa-taaagtatgaaattcatacaaattt----------------------------------------------------------------------
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|116425734|gb|EG468326.1|EG468326
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116425727|gb|EG468319.1|EG468319
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116425721|gb|EG468313.1|EG468313
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116447271|gb|EG489863.1|EG489863
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGACAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116447282|gb|EG489874.1|EG489874
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGACAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116447138|gb|EG489730.1|EG489730
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116447160|gb|EG489752.1|EG489752
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTCGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116425735|gb|EG468327.1|EG468327
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116447315|gb|EG489907.1|EG489907
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116425722|gb|EG468314.1|EG468314
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116447227|gb|EG489819.1|EG489819
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116447171|gb|EG489763.1|EG489763
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTCGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116447193|gb|EG489785.1|EG489785
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGATCAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116425739|gb|EG468331.1|EG468331
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116425724|gb|EG468316.1|EG468316
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116447249|gb|EG489841.1|EG489841
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116447304|gb|EG489896.1|EG489896
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116447149|gb|EG489741.1|EG489741
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116425731|gb|EG468323.1|EG468323
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116425730|gb|EG468322.1|EG468322
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGC
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGC
EST: gi|116447293|gb|EG489885.1|EG489885
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116447116|gb|EG489708.1|EG489708
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116425741|gb|EG468333.1|EG468333
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116447338|gb|EG489930.1|EG489930
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116447215|gb|EG489807.1|EG489807
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116447326|gb|EG489918.1|EG489918
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116447182|gb|EG489774.1|EG489774
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGATCAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116447060|gb|EG489652.1|EG489652
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116447349|gb|EG489941.1|EG489941
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116425738|gb|EG468330.1|EG468330
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116425725|gb|EG468317.1|EG468317
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116425736|gb|EG468328.1|EG468328
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116447071|gb|EG489663.1|EG489663
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116447204|gb|EG489796.1|EG489796
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116425728|gb|EG468320.1|EG468320
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
EST: gi|116425733|gb|EG468325.1|EG468325
EST:     TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAG                         ATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT
genomic: TTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgttt ... aatgtatcagATTTGATGCTAAGTTGATGTTGGAGAAGCTAAGGAACAAGCGGCTAGTGTT

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
GTACCTTTATTGATGAAGGATTCAGATGCACTGAGTTTGGGAGACCTGATTTGTTCTATACTAAGTGGAGATGGCAACCTAACCATTGTGATTTGCCCAGgtaaatgtttcattttctctctttgtttgatgttctgggattagaaatgttatgtttaggaaatattgtatggcatgagtagagtaagttaggaggaagaactttagaaccatatgtgttacttttgaattcagttacttaaagcttactcatttttgttatggaatgtatcag

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AGTGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GTGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  TGGAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GAGATG