Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

CAGCAGTTCACAGTATTCTTCTTCACAAGAACAAAGAGGACAAGATCATGACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaacttctccgtctctctctctgtctgtgattcagtagtagtagtacatgaatttgatttctgtttttttttggatttactttag

Basic information

species Arabidopsis thaliana
transcript AT4G14800.1
intron # 1
splice site 5'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|86068345|gb|DR364102.1|DR364102
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTTGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068323|gb|DR364080.1|DR364080
EST:     ACTCTTGACTCTCACAANCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|19874922|gb|AU235753.1|AU235753
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|116406713|gb|EG449305.1|EG449305
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86078029|gb|DR373786.1|DR373786
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068313|gb|DR364070.1|DR364070
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068309|gb|DR364066.1|DR364066
EST:     ACTCTTGACTCTCACAANCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068338|gb|DR364095.1|DR364095
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|116476929|gb|EG519521.1|EG519521
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068315|gb|DR364072.1|DR364072
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTTACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAAWTGTGTCACTGTATCAGTTTC
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAA-TGTGTCACTGTATCAGTTTC
EST: gi|86068311|gb|DR364068.1|DR364068
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068340|gb|DR364097.1|DR364097
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068303|gb|DR364060.1|DR364060
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068302|gb|DR364059.1|DR364059
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068347|gb|DR364104.1|DR364104
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068343|gb|DR364100.1|DR364100
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|116442117|gb|EG484709.1|EG484709
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068312|gb|DR364069.1|DR364069
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|116442842|gb|EG485434.1|EG485434
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068310|gb|DR364067.1|DR364067
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068334|gb|DR364091.1|DR364091
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068325|gb|DR364082.1|DR364082
EST:     ACTCTTGACTCTCACAMNCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|116476925|gb|EG519517.1|EG519517
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068339|gb|DR364096.1|DR364096
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068317|gb|DR364074.1|DR364074
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068308|gb|DR364065.1|DR364065
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAACAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068327|gb|DR364084.1|DR364084
EST:     ACTCTTGACTCTCACANNCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTTACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCAMTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068346|gb|DR364103.1|DR364103
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTMGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068331|gb|DR364088.1|DR364088
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAKCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068349|gb|DR364106.1|DR364106
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|116476924|gb|EG519516.1|EG519516
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86081990|gb|DR377749.1|DR377749
EST:     TTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: TTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068320|gb|DR364077.1|DR364077
EST:     ACTCTTGACTCTCACAANCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068321|gb|DR364078.1|DR364078
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068335|gb|DR364092.1|DR364092
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068329|gb|DR364086.1|DR364086
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068344|gb|DR364101.1|DR364101
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068307|gb|DR364064.1|DR364064
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068324|gb|DR364081.1|DR364081
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068314|gb|DR364071.1|DR364071
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068330|gb|DR364087.1|DR364087
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068348|gb|DR364105.1|DR364105
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068332|gb|DR364089.1|DR364089
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGNGTCACTGNATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068316|gb|DR364073.1|DR364073
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAKCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068341|gb|DR364098.1|DR364098
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068305|gb|DR364062.1|DR364062
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068318|gb|DR364075.1|DR364075
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
EST: gi|86068342|gb|DR364099.1|DR364099
EST:     ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCG                         GGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG
genomic: ACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaac ... tttactttagGGTTCAGTTTACGGAGTATGTTCAGAAGAATGTGTCACTGTATCAGTTTCG

Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
CAGCAGTTCACAGTATTCTTCTTCACAAGAACAAAGAGGACAAGATCATGACTCTTGACTCTCACAAGCTCGTCGCCGCTAGTGGTGAGCCTGGTGACCGgtaaaaaaacttctccgtctctctctctgtctgtgattcagtagtagtagtacatgaatttgatttctgtttttttttggatttactttag

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CAAGCT