1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
...ttctgttatagtgtatgctttgtgttttgtgtagtggatgttgtcttatctgctctcaggacaaaacaggatgagaaaaaactatgttgtctatttgcagTGTCTCAAAGGCTGGGCTTAAGGCTCCTCACAACCTTTATGTGATGACGGCGACACTACTAGCTCGTAGCAACCGTTACGCTGAAATAGCATTGTTTGTG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G444692_T02 |
intron # | 9 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ATGGGTGATCCTGCATATCTTATTGCTGTCATCATAGAGTTTCTACGGAG TGTCTCAAAGGCTGGGCTTAAGGCTCCTCACAACCTTTATGTGATGACGGCEST: gi|211085836|gb|FL083838.1|FL083838
genomic: ATGGGTGATCCTGCATATCTTATTGCTGTCATCATAGAGTTTCTACGGAGgtaatttttg ... ctatttgcagTGTCTCAAAGGCTGGGCTTAAGGCTCCTCACAACCTTTATGTGATGACGGC
EST: ATGGGTGATCCTGCATATCTTATTGCTGTCATCATAGAGTTTCTACGGAG TGTCTCAAAGGCTGGGCTTAAGGCTCCTCACAACCTTTATGTGATGACGGCEST: gi|71433592|gb|DR814642.1|DR814642
genomic: ATGGGTGATCCTGCATATCTTATTGCTGTCATCATAGAGTTTCTACGGAGgtaatttttg ... ctatttgcagTGTCTCAAAGGCTGGGCTTAAGGCTCCTCACAACCTTTATGTGATGACGGC
EST: ATGGGTGATCCTGCATATCTTATTGCTGTCATCATAGAGTTTCTACGGAG TGTCTCAAAGGCTGGGCTTAAGGCTCCTCACAACCTTTATGTGATGACGGCEST: gi|71436759|gb|DR817809.1|DR817809
genomic: ATGGGTGATCCTGCATATCTTATTGCTGTCATCATAGAGTTTCTACGGAGgtaatttttg ... ctatttgcagTGTCTCAAAGGCTGGGCTTAAGGCTCCTCACAACCTTTATGTGATGACGGC
EST: ATGGGTGATCCTGCATATCTTATTGCTGTCATCATAGAGTTTCTACGGAG TGTCTCAAAGGCTGGGCTTAAGGCTCCTCACAACCTTTATGTGATGACGGCEST: gi|116817309|gb|EC860144.1|EC860144
genomic: ATGGGTGATCCTGCATATCTTATTGCTGTCATCATAGAGTTTCTACGGAGgtaatttttg ... ctatttgcagTGTCTCAAAGGCTGGGCTTAAGGCTCCTCACAACCTTTATGTGATGACGGC
EST: ATGGGTGATCCTGCATATCTTA-TGCTGTCATCATAGAGTTTCTACGGAG TGT-TC-AAGGCTGGGCTTAAGGCTCCTCACAACCTTTATGTGATGACGGCEST: gi|33091123|gb|CF051117.1|CF051117
genomic: ATGGGTGATCCTGCATATCTTATTGCTGTCATCATAGAGTTTCTACGGAGgtaatttttg ... ctatttgcagTGTCTCAAAGGCTGGGCTTAAGGCTCCTCACAACCTTTATGTGATGACGGC
EST: ATGGGTGATCCTGCATATCTTATTGCTGTCATCATAGAGTTTCTACGGAG TGTCTCAAAGGCTGGGCTTAAGGCTCCTCACAACCTTTATGTGATGACGGCEST: gi|211085835|gb|FL083837.1|FL083837
genomic: ATGGGTGATCCTGCATATCTTATTGCTGTCATCATAGAGTTTCTACGGAGgtaatttttg ... ctatttgcagTGTCTCAAAGGCTGGGCTTAAGGCTCCTCACAACCTTTATGTGATGACGGC
EST: ATGGGTGATCCTGCATATCTTATTGCTGTCATCATAGAGTTTTTACGGAG TGTCTCAAAGGCTGGGCTTAAGGCTCCTCACAACCTTTATGTGATGACGGCEST: gi|211085832|gb|FL083834.1|FL083834
genomic: ATGGGTGATCCTGCATATCTTATTGCTGTCATCATAGAGTTTCTACGGAGgtaatttttg ... ctatttgcagTGTCTCAAAGGCTGGGCTTAAGGCTCCTCACAACCTTTATGTGATGACGGC
EST: ATGGGTGATCCTGCATATCTTATTGCTGTCATCATAGAGTTTCTACGGAG TGTCTCAAAGGCTGGGCTTAAGGCTCCTCACAACCTTTATGTGATGACGGCEST: gi|71433593|gb|DR814643.1|DR814643
genomic: ATGGGTGATCCTGCATATCTTATTGCTGTCATCATAGAGTTTCTACGGAGgtaatttttg ... ctatttgcagTGTCTCAAAGGCTGGGCTTAAGGCTCCTCACAACCTTTATGTGATGACGGC
EST: ATGGGTGATCCTGCATATCTTATTGCTGTCATCATAGAGTTTCTACGGAG TGTCTCAAAGGCTGGGCTTAAGGCTCCTCACAACCTTTATGTGATGACGGCEST: gi|71428498|gb|DR809548.1|DR809548
genomic: ATGGGTGATCCTGCATATCTTATTGCTGTCATCATAGAGTTTCTACGGAGgtaatttttg ... ctatttgcagTGTCTCAAAGGCTGGGCTTAAGGCTCCTCACAACCTTTATGTGATGACGGC
EST: ATGGGTGATCCTGCATATCTTATTGCTGTCATCATAGAGTTTCTACGGAG TGTCTCAAAGGCTGGGCTTAAGGCTCCTCACAACCTTTATGTGATGACGGCEST: gi|14206626|gb|BG840304.1|BG840304
genomic: ATGGGTGATCCTGCATATCTTATTGCTGTCATCATAGAGTTTCTACGGAGgtaatttttg ... ctatttgcagTGTCTCAAAGGCTGGGCTTAAGGCTCCTCACAACCTTTATGTGATGACGGC
EST: ATGGGTGATCCTGCATATCTTATTGCTGTCATCATAGAGTTTCTACGGAG TGTCTCAAAGGCTGGGCTTAAGGCTCCTCACAACCTTTATGTGATGACGGCEST: gi|33094193|gb|CF054187.1|CF054187
genomic: ATGGGTGATCCTGCATATCTTATTGCTGTCATCATAGAGTTTCTACGGAGgtaatttttg ... ctatttgcagTGTCTCAAAGGCTGGGCTTAAGGCTCCTCACAACCTTTATGTGATGACGGC
EST: ATGGGTGATCCTGCATATCTTATTGCTGTCATCATAGAGTTTCTACGGAG TGTCTCAAAGGCTGGGCTTAAGGCTCCTCACAACCTTTATGTGATGACGGC
genomic: ATGGGTGATCCTGCATATCTTATTGCTGTCATCATAGAGTTTCTACGGAGgtaatttttg ... ctatttgcagTGTCTCAAAGGCTGGGCTTAAGGCTCCTCACAACCTTTATGTGATGACGGC
ttatctgctctcaggacaaaacaggatgagaaaaaactatgttgtctatttgcagTGTCTCAAAGGCTGGGCTTAAGGCTCCTCACAACCTTTATGTGATGACGGCGACACTACTAGCTCGTAGCAACCGTTACGCTGAAATAGCATTGTTTGTG
tctattt CT-rich tract
aaaaaactat TA-rich tract