1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' | 17 5' 3' |
gcatttgcctcgtatatcttgtttgtccttttctttttgtagtgtcaaagtatcataatttgatatcttttgttgttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAGGTGGTTTTGCTCCGAACATCCAG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G048371_T01 |
intron # | 9 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|6021395|gb|AW066323.1|AW066323
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|67011307|gb|CO440056.1|CO440056
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|211377302|gb|FL186755.1|FL186755
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|61118137|gb|DN559098.1|DN559098
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|211377303|gb|FL186756.1|FL186756
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCAGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAEST: gi|32826370|gb|CD966048.1|CD966048
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCC-GTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGA
EST: TAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|76294188|gb|DV033756.1|DV033756
genomic: TAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|67024050|gb|CO452799.1|CO452799
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: ATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCCTGAAG TCCGTT-TCAAAAAGAA-TATGGGCAAGATGC-ACGAATGTTGGTGACGAEST: gi|211425250|gb|FL005768.1|FL005768
genomic: ATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACC-TGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|31354997|gb|CD439354.1|CD439354
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|67026276|gb|CO455025.1|CO455025
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|67023203|gb|CO451952.1|CO451952
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: ATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAAGTT-ATCACCACCTGAAG CCCGT-ATCAAAAAGA-GTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|5268740|gb|AI770704.1|AI770704
genomic: ATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAA-GTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: GGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|67011056|gb|CO439805.1|CO439805
genomic: GGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|31353433|gb|CD437790.1|CD437790
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|31359544|gb|CD443901.1|CD443901
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGAEST: gi|31353535|gb|CD437892.1|CD437892
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|67022401|gb|CO451150.1|CO451150
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|213179295|gb|FM184302.1|FM184302
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|67018108|gb|CO446857.1|CO446857
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: GTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAA-TATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|31361447|gb|CD445804.1|CD445804
genomic: GTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|21987719|gb|BQ779247.1|BQ779247
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|67011708|gb|CO440457.1|CO440457
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|20301520|gb|BQ164463.1|BQ164463
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGEST: gi|67030419|gb|CO459168.1|CO459168
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAG
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|76281562|gb|DV021130.1|DV021130
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|67010780|gb|CO439529.1|CO439529
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCTTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|67040510|gb|CO466765.1|CO466765
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|211131238|gb|FL066390.1|FL066390
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCA-GATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|67021372|gb|CO450121.1|CO450121
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: ATTTAAG-AGGCTATGAAGATGGGTNGT-GAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTTTCAAAAAGA-GTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|74234275|gb|DT642189.1|DT642189
genomic: ATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGT-GTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|14204058|gb|BG837735.1|BG837735
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|33094991|gb|CF054985.1|CF054985
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: GGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|32915417|gb|CF020229.1|CF020229
genomic: GGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|29577151|gb|CB617263.1|CB617263
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|31351690|gb|CD436047.1|CD436047
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|67015783|gb|CO444532.1|CO444532
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|211435191|gb|FK988701.1|FK988701
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: TTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGGTGTTGAAGTTTATCACCANCCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGGACGEST: gi|67016494|gb|CO445243.1|CO445243
genomic: TTTAAGGAGGCTATGAAGATGGG-TGTTGAAGTTTATCACCA-CCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTG-ACG
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|67015750|gb|CO444499.1|CO444499
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|60355296|gb|DN222269.1|DN222269
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|13558380|gb|BG549736.1|BG549736
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATEST: gi|67023954|gb|CO452703.1|CO452703
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAAT
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|6564073|gb|AW231695.1|AW231695
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGEST: gi|21843176|gb|BQ703742.1|BQ703742
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAG
EST: CATTT-TGGAGGCTATGAAGATGGG-GTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGG-GACGAAEST: gi|31349581|gb|CD433938.1|CD433938
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|14204206|gb|BG837883.1|BG837883
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTG-TGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|31358035|gb|CD442392.1|CD442392
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCAEST: gi|84980804|gb|DW531153.1|DW531153
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|31350995|gb|CD435352.1|CD435352
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|32864127|gb|CF003809.1|CF003809
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|211377301|gb|FL186754.1|FL186754
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAG TCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAEST: gi|67038520|gb|CO464838.1|CO464838
genomic: CATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCTGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAA
EST: ATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACCCTGAAG TC-GTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGA
genomic: ATTTAAGGAGGCTATGAAGATGGGTGTTGAAGTTTATCACCACC-TGAAGgcatttgcct ... ttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGA
ttctttttgtagtgtcaaagtatcataatttgatatcttttgttgttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAGGTGGTTTTGCTCCGAACATCCAG
atttgat putative branch site (score: 5)
tcttttgttgttcctt CT-rich tract
tatcataatttgatat TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| gcatttgcctcgtatatcttgtttgtccttttctttttgtagtgtcaaagtatcataatttgatatcttttgttgttccttacagTCCGTTATCAAAAAGAAGTATGGGCAAGATGCCACGAATGTTGGTGACGAAGGTGGTTTTGCTCCGAACATCCAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGATG