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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtaaattgggccacgaagttagttagccgttcaattccccaaccactcccacctatctctatttaaatcttcaccaatcttgtttgttattttgtttctgaatctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGTCCGAACTACCAAACTGGACTCGCCAAAATGCGCACCCTAGGCGCCGAAC

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G034083_T02
intron # 9
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G034083_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 9
lower sequence: LOC_Os12g37870.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 9
gtaaattgggccacgaagttagttagccgttcaattccccaaccactcccacctatctctatttaaatcttcaccaatcttgtttgttattttgtttctgaatctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGTCCGAACTACCAAACTGGACTCGCCAAAATGCGCACCCTAGGCGCCGAAC
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-----gcaagtttcga--ttggatcgttgttctgt-ccccaaccactcccacttgttgccattaaaatcttcatccatcttatt-attgtctggcttccaaatctggtggcagGAATCCAAATTGAAGGCTGCACGGATGAACATTTACGTTCGGAGAGGTGGTCCAAACTACCAAACTGGCCTTGCCAAAATGCGTACACTAGGTGCAGAAC
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|16916519|gb|BM072879.1|BM072879
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|67023264|gb|CO452013.1|CO452013
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|40303556|gb|CK347943.1|CK347943
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCTTCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|28983142|gb|BQ538521.2|BQ538521
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|31357444|gb|CD441801.1|CD441801
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|211020092|gb|FL063965.1|FL063965
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|67013475|gb|CO442224.1|CO442224
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|211020101|gb|FL063974.1|FL063974
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCCGGAGAGGTG
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCC-GGAGAGGTG
EST: gi|60353272|gb|DN220245.1|DN220245
EST:     CAGATGTTGCTTTTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|32866830|gb|CF006512.1|CF006512
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|16927003|gb|BM080076.1|BM080076
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|18177201|gb|BM378411.1|BM378411
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|5361093|gb|AI795708.1|AI795708
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|60353107|gb|DN220080.1|DN220080
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|24769705|gb|CA404834.1|CA404834
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|211020102|gb|FL063975.1|FL063975
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGCCTTTATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|32844872|gb|CD984553.1|CD984553
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|67025367|gb|CO454116.1|CO454116
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|5819356|gb|AI987562.1|AI987562
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|148947868|gb|EC893361.2|EC893361
EST:     CAGATGTTGCTTTTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|32845129|gb|CD984810.1|CD984810
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|4217927|gb|AI391923.1|AI391923
EST:     ACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: ACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|32844736|gb|CD984417.1|CD984417
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGGGGCATCATCCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|5740100|gb|AI947790.1|AI947790
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|211020103|gb|FL063976.1|FL063976
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|211020091|gb|FL063964.1|FL063964
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|44901489|gb|CK828034.1|CK828034
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|148986292|gb|EE030027.2|EE030027
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGG
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGT-GG
EST: gi|6101966|gb|AW126436.1|AW126436
EST:     CAGATGTTCCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|32844415|gb|CD984096.1|CD984096
EST:     CAGATATTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|18177874|gb|BM379084.1|BM379084
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|149008522|gb|EE040695.2|EE040695
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|18177582|gb|BM378792.1|BM378792
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|24768435|gb|CA403564.1|CA403564
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|78103680|gb|DV522108.1|DV522108
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|31353311|gb|CD437668.1|CD437668
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|13150060|gb|BG320382.1|BG320382
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|87156899|gb|DY401688.1|DY401688
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|37400570|gb|CF637640.1|CF637640
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|33103007|gb|CF062967.1|CF062967
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|32844999|gb|CD984680.1|CD984680
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|32919518|gb|CF024330.1|CF024330
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
EST: gi|211133979|gb|FL063978.1|FL063978
EST:     CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATMATTCGGGCTTTAAGAGAGAAG                         GAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
genomic: CAGATGTTGCTTCTACATTTAGTGGCATCATTCGGGCTTTAAGAGAGAAGgtaaattggg ... ctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGT
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 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

ctatttaaatcttcaccaatcttgtttgttattttgtttctgaatctgattccagGAGTCCAAATTAAAGGCTGCAAGGATGAACATTTATGTCCGGAGAGGTGGTCCGAACTACCAAACTGGACTCGCCAAAATGCGCACCCTAGGCGCCGAAC
                                           atctgat  putative branch site (score: 4)
                        tttgttattttgttt  TA-rich tract