1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' |
gtttgcatgacttcatctctactcaggatttctgtttcatttgtaactggttcctgaatgtatgctctttatgtcagGGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCCACCATTGGCATTCACCCCACATCCGCTGAGGAATTCGTCACAATGAGGA
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G172322_T02 |
intron # | 8 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AAGTTGTAGGAGTGCACATGTGTGGTGATGATGCACCTGAGATAATTCAG GGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCCEST: gi|211393001|gb|FL405406.1|FL405406
genomic: AAGTTGTAGGAGTGCACATGTGTGGTGATGATGCACCTGAGATAATTCAGgtttgcatga ... tttatgtcagGGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCC
EST: AAGTTGTAGGAGTGCACATGTGTGGTGATGATGCACCTGAGATAATTCAG GGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCCEST: gi|60359695|gb|DN226668.1|DN226668
genomic: AAGTTGTAGGAGTGCACATGTGTGGTGATGATGCACCTGAGATAATTCAGgtttgcatga ... tttatgtcagGGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCC
EST: AAGTTGTAGGAGTGCACATGTGTGGTGATGATGCACCTGAGATAATTCAG GGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCCEST: gi|211356738|gb|FL440505.1|FL440505
genomic: AAGTTGTAGGAGTGCACATGTGTGGTGATGATGCACCTGAGATAATTCAGgtttgcatga ... tttatgtcagGGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCC
EST: AAGTTGTAGGAGTGCACATGTGTGGTGATGATGCACCTGAGATAATTCAG GGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCCEST: gi|148956137|gb|EC901907.2|EC901907
genomic: AAGTTGTAGGAGTGCACATGTGTGGTGATGATGCACCTGAGATAATTCAGgtttgcatga ... tttatgtcagGGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCC
EST: AAGTTGTAGGAGTGCACATGTGTGGTGATGATGCCCCTGAGATAATTCAG GGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCCEST: gi|149101004|gb|EE187101.2|EE187101
genomic: AAGTTGTAGGAGTGCACATGTGTGGTGATGATGCACCTGAGATAATTCAGgtttgcatga ... tttatgtcagGGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCC
EST: AAGTTGTAGGAGTGCACATGTGTGGTGATGATGCACCTGAGATAATTCAG GGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCCEST: gi|71319218|gb|DR796369.1|DR796369
genomic: AAGTTGTAGGAGTGCACATGTGTGGTGATGATGCACCTGAGATAATTCAGgtttgcatga ... tttatgtcagGGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCC
EST: AAGTTGTAGGAGTGCACATGTGTGGTGATGATGCACCTGAGATAATTCAG GGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCCEST: gi|76285084|gb|DV024652.1|DV024652
genomic: AAGTTGTAGGAGTGCACATGTGTGGTGATGATGCACCTGAGATAATTCAGgtttgcatga ... tttatgtcagGGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCC
EST: AAGTTGTAGGAGTGCACATGTGTGGTGATGATGCACCTGAGATAATTCAG GGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCCEST: gi|93017205|gb|EB642725.1|EB642725
genomic: AAGTTGTAGGAGTGCACATGTGTGGTGATGATGCACCTGAGATAATTCAGgtttgcatga ... tttatgtcagGGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCC
EST: AAGTTGTAGGAGTGCACATGTGTGGTGATGATGCACCTGAGATAATTCAG GGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCCEST: gi|211356737|gb|FL440504.1|FL440504
genomic: AAGTTGTAGGAGTGCACATGTGTGGTGATGATGCACCTGAGATAATTCAGgtttgcatga ... tttatgtcagGGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCC
EST: AAGTTGTAGGAGTGCACATGTGTGGTGATGATGCACCTGAGATAATTCAG GGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCCEST: gi|211484881|gb|FL392986.1|FL392986
genomic: AAGTTGTAGGAGTGCACATGTGTGGTGATGATGCACCTGAGATAATTCAGgtttgcatga ... tttatgtcagGGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCC
EST: AAGTTGTAGGAGTGCACATGTGTGGTGATGATGCACCTGAGATAATTCAG GGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACSAAGCAAGATTTTGATGCCEST: gi|211428017|gb|FL465135.1|FL465135
genomic: AAGTTGTAGGAGTGCACATGTGTGGTGATGATGCACCTGAGATAATTCAGgtttgcatga ... tttatgtcagGGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCC
EST: AAGTTGTAGGAGTGCACATGTGTGGTGATGATGCACCTGAGATAATTCAG GGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCCEST: gi|211428077|gb|FL466325.1|FL466325
genomic: AAGTTGTAGGAGTGCACATGTGTGGTGATGATGCACCTGAGATAATTCAGgtttgcatga ... tttatgtcagGGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCC
EST: AAGTTGTAGGAGTGCACATGTGTGGTGATGATGCACCTGAGATAATTCAG GGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCCEST: gi|76932106|gb|DV172946.1|DV172946
genomic: AAGTTGTAGGAGTGCACATGTGTGGTGATGATGCACCTGAGATAATTCAGgtttgcatga ... tttatgtcagGGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCC
EST: AAGTTGTAGGAGTGCACATGTGTGGTGATGATGCACCTGAGATAATTCAG GGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCCEST: gi|166444235|gb|EG193721.1|EG193721
genomic: AAGTTGTAGGAGTGCACATGTGTGGTGATGATGCACCTGAGATAATTCAGgtttgcatga ... tttatgtcagGGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCC
EST: AGATAATTCAG GGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCCEST: gi|60398346|gb|DN231162.1|DN231162
genomic: AGATAATTCAGgtttgcatga ... tttatgtcagGGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCC
EST: AAGTTGTAGGAGTGCACATGTGTGGTGATGATGCACCTGAGATAATTCAG GGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCC
genomic: AAGTTGTAGGAGTGCACATGTGTGGTGATGATGCACCTGAGATAATTCAGgtttgcatga ... tttatgtcagGGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCC
tcaggatttctgtttcatttgtaactggttcctgaatgtatgctctttatgtcagGGAATTGCAATTGCTGTTAAAGCTGGATTGACGAAGCAAGATTTTGATGCCACCATTGGCATTCACCCCACATCCGCTGAGGAATTCGTCACAATGAGGA
ttgtaac putative branch site (score: 2)
tgctcttt putative PPT
tttcattt TA-rich tract