ERISdb: a Database of Plant Splice Sites

General
Orthologs
EST
RNA-Seq
PPT, BS, UA-tract
cis-regulatory elements

Sequence

atgc intronic sequence ATGC exonic sequence

gtatgcccaactttgagatgtgatacatcttatatttcctgaggaaattgatacacgtttctttcccttggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCGAGGATTATGTTCATCGTATAGGTCGAACTGGCAGAGCAGGTGCAAAAGG

Basic information

species	Zea mays
transcript	GRMZM2G143246_T01
intron #	8
splice site	3'
intron type	U2

Orthologous splice sites

atgc intronic sequence ATGC exonic sequence

upper sequence: GRMZM2G143246_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 8
lower sequence: LOC_Os01g10050.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 8

gtatgcccaa---ctttgagatgtgatacatcttatatttcctgaggaaattgatacacgtttctttcccttggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCGAGGATTATGTTCATCGTATAGGTCGAACTGGCAGAGCAGGTGCAAAAGG
|||| |  ||   ||   ||||  |||  ||  ||| ||   |  | ||| | || | |  || | ||     | |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||
gtatacaaaaatcctcccagat-cgatgaattatat-ttatttctgtaaactaatgc-cacttatatct----ggaaacagATGTTAAGGATGTTAAATATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGATCATTGGAGGATTATGTTCATCGCATTGGTCGAACTGGCAGAGCTGGAGCAAAAGG

upper sequence: GRMZM2G143246_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 8
lower sequence: GLYMA08G20670.1 (Glycine max), 3'ss of exon 8

----------------------gtatgcccaactttgagatgtgatacatcttatatttcctgaggaaattgatacacgtttctttcccttggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCGAGGATTATGTTCATCGTATAGGTCGAACTGGCAGAGCAGGTGCAAAAGG
                       |||   ||  ||| | |  | ||  ||    |   || ||   |  || || |    | || |    |      ||||||| |||||||| || |||||  | || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || || || || || || |||||||||||
ttgtgatttgatgactttcagtttattgtcagtttttaaagttaatcaatagctttgctcatgtatatcttaatcctttctactatttgattactgtcagATGTGAAGGATGTAAAATATGTTGTAAATTATGACTTCCCGGGGTCACTTGAGGATTATGTTCATCGCATTGGGCGGACAGGGAGGGCTGGTGCAAAAGG

upper sequence: GRMZM2G143246_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 8
lower sequence: GLYMA07G11880.1 (Glycine max), 3'ss of exon 9

-----------------------gtatgcccaactttgagatgtgatacatcttatatttcctgaggaaattgatacacgtttctttcccttggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCGAGGATTATGTTCATCGTATAGGTCGAACTGGCAGAGCAGGTGCAAAAGG
                        | || |    ||| || | | |   ||    |   |  ||   |  || || |    | || |    |      ||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| || || || |  || ||||| || ||||||||
gtgatttgatgactttcagtttactttgtcactttttaaggt-taaccaatagctttgcttatgtatatcttcatcctttctactatttgattactgtcagATGTGAAGGATGTGAAATATGTAATAAATTATGACTTCCGGGGGTCACTTGAGGATTATGTTCATCGCATTGGGCGGATAGGGAGAGCTGGCGCAAAAGG

upper sequence: GRMZM2G143246_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 8
lower sequence: GLYMA07G01260.1 (Glycine max), 3'ss of exon 8

----------------------gtatgcccaactttgagatgtgatacatcttatatttcctgaggaaattgatacacgtttctttcccttggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCGAGGATTATGTTCATCGTATAGGTCGAACTGGCAGAGCAGGTGCAAAAGG
                         |   ||  ||| | |  | |   ||    |   |  ||   |  || || |    | || |    |      ||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || || || || || ||||| |||||||||||
gtgatttgatgactttcagtttactttgtcactttttaaagttaaccaatagctttgcttatgtatatcttaatcctttctactatttgattacggtcagATGTGAAGGATGTGAAATATGTAATAAATTATGACTTCCCGGGGTCACTTGAGGATTATGTTCATCGCATTGGGCGGACAGGGAGAGCTGGTGCAAAAGG

upper sequence: GRMZM2G143246_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 8
lower sequence: AT1G55150.1 (Arabidopsis thaliana), 3'ss of exon 8

----------gtatgcccaactttg---agatgtgatacatcttatatttcctgaggaaattgatacacgtttctttcccttggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCGAGGATTATGTTCATCGTATAGGTCGAACTGGCAGAGCAGGTGCAAAAGG
           | | | || ||  |   | |  | |    |||||    |  |||  |  |    |||  | | |||   |||   |||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||  | || || ||||| || ||||| || || |||||
gtactaaatctttttctcatctgcgtgcaaacatcaactctcttaaccatggtgacaagctaacaacagttctttttgttttg---aacagACGTGAAAGATGTGAAGTATGTGATAAACTATGACTTCCCTGGATCACTGGAGGATTATGTTCACAGGATTGGACGAACAGGTAGAGCCGGGGCTAAAGG

upper sequence: GRMZM2G143246_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 8
lower sequence: Vv09s0002g02100.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 8

--gtatgcccaacttt-----gagatgtgata-------catcttatatttcctgaggaaattgatacacgtttctttcc--------cttggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCGAGGATTATGTTCATCGTATAGGTCGAACTGGCAGAGCAGGTGCAAAAGG
    ||| | || ||        || |||| |       || |    ||  | | |  |  |  ||     | |  || |         || |    ||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||| ||||| || || || |||||||| || || || |||||||| || || || || || |||||
tgacatggctaaattcttgaaaggaagtgagagcatgtccacccaggatgacttcaaaagctgcatttcaatcttcttacatgttaggttttggttgcagATGTCAAGGATGTGAAATTTGTGATCAACTATGACTTCCCGGGATCTCTTGAAGATTATGTCCACCGCATTGGTCGAACAGGAAGGGCTGGGGCCAAAGG

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments

ATGC    EST sequence
ATGC    genomic sequence (exon)
ATGC    genomic sequence (truncated intron)

EST: gi|33092549|gb|CF052543.1|CF052543

EST:     AGGCAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCTTAG                         ATGTCAAGGATGTGAAGAAAGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG
genomic: AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAGgtatgcccaa ... tggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG

EST: gi|78120998|gb|DV539382.1|DV539382

EST:     AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAG                         ATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG
genomic: AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAGgtatgcccaa ... tggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG

EST: gi|110193219|gb|EC875117.1|EC875117

EST:     AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAG                         ATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG
genomic: AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAGgtatgcccaa ... tggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG

EST: gi|78077832|gb|DV506261.1|DV506261

EST:     AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAG                         ATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG
genomic: AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAGgtatgcccaa ... tggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG

EST: gi|110200617|gb|EC882514.1|EC882514

EST:     AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAG                         ATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG
genomic: AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAGgtatgcccaa ... tggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG

EST: gi|86472665|gb|DY239035.1|DY239035

EST:     AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGTTGCTCGAGGCTTAG                         ATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG
genomic: AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAGgtatgcccaa ... tggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG

EST: gi|4646584|gb|AI491385.2|AI491385

EST:     AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCAAGGCCTAG                         ATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG
genomic: AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAGgtatgcccaa ... tggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG

EST: gi|9255282|gb|BE345750.1|BE345750

EST:     AGGCAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCTTAG                         ATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG
genomic: AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAGgtatgcccaa ... tggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG

EST: gi|60350175|gb|DN217148.1|DN217148

EST:     AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAG                         ATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG
genomic: AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAGgtatgcccaa ... tggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG

EST: gi|32910886|gb|CF015698.1|CF015698

EST:     AGGCAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCTTAG                         ATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG
genomic: AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAGgtatgcccaa ... tggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG

EST: gi|91053058|gb|EB163476.1|EB163476

EST:     AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAG                         ATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG
genomic: AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAGgtatgcccaa ... tggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG

EST: gi|78025496|gb|DV493883.1|DV493883

EST:     AGGCAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCTTAG                         ATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG
genomic: AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAGgtatgcccaa ... tggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG

EST: gi|71774215|gb|DR972093.1|DR972093

EST:     AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAG                         ATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG
genomic: AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAGgtatgcccaa ... tggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG

EST: gi|18177031|gb|BM378241.1|BM378241

EST:     AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAG                         ATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG
genomic: AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAGgtatgcccaa ... tggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG

EST: gi|31349821|gb|CD434178.1|CD434178

EST:     AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAG                         ATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG
genomic: AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAGgtatgcccaa ... tggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG

EST: gi|24767383|gb|CA402526.1|CA402526

EST:     CTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAG                         ATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG
genomic: CTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAGgtatgcccaa ... tggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG

EST: gi|76287086|gb|DV026654.1|DV026654

EST:     AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAG                         ATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG
genomic: AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAGgtatgcccaa ... tggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG

EST: gi|5152766|gb|AI759064.1|AI759064

EST:     AGGCAAAAGTCCTATTATGACGGCCNCTGATGTTGCTGCTCGAGGCTTAG                         ATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG
genomic: AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAGgtatgcccaa ... tggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG

EST: gi|149105514|gb|EE291039.2|EE291039

EST:     AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAG                         ATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG
genomic: AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAGgtatgcccaa ... tggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG

EST: gi|8930468|gb|BE225232.1|BE225232

EST:     GGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCTTAG                         ATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG
genomic: GGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAGgtatgcccaa ... tggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG

EST: gi|9255412|gb|BE345880.1|BE345880

EST:     AGGCAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCTTAG                         ATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG
genomic: AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAGgtatgcccaa ... tggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG

EST: gi|33942270|gb|CF348870.1|CF348870

EST:     AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCTTAG                         ATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG
genomic: AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAGgtatgcccaa ... tggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG

EST: gi|60352200|gb|DN219173.1|DN219173

EST:     AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAG                         ATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG
genomic: AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAGgtatgcccaa ... tggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG

EST: gi|101382045|gb|EB813078.1|EB813078

EST:     AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGTTGCTCGAGGCCTAG                         ATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG
genomic: AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAGgtatgcccaa ... tggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG

EST: gi|37396781|gb|CF635684.1|CF635684

EST:     AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCTTAG                         ATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG
genomic: AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAGgtatgcccaa ... tggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG

EST: gi|93017516|gb|EB643036.1|EB643036

EST:     AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAG                         ATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG
genomic: AGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAGgtatgcccaa ... tggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG

EST: gi|211031786|gb|FL480600.1|FL480600

EST:     CACTGATGTTGCTGCTCGAGGCTTAG                         ATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG
genomic: CACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAGgtatgcccaa ... tggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCG

RNA-Seq data

ATGC Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

atgs Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.

Found data for 4 RNA-Seq libraries.

Block sizes: 49 (upstream exon), 48 (downstream exon)
Score: 102

GGTGACAAGAGCCAAGCAGAACGGGATTGGGTCCTTTCTGAATTTAAGTCAGGGAAAAGTCCTATTATGACGGCCACTGATGTTGCTGCTCGAGGCCTAGgtatgcccaa ... tggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCGAGGATTATGTTCATCGTATAGGTCGAACTGGCAGAGCAGGTGCAAAAGG

Block sizes: 49 (upstream exon), 48 (downstream exon)
Score: 67

Block sizes: 49 (upstream exon), 48 (downstream exon)
Score: 99

Block sizes: 49 (upstream exon), 47 (downstream exon)
Score: 76

atgc intronic sequence ATGC exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tacatcttatatttcctgaggaaattgatacacgtttctttcccttggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCGAGGATTATGTTCATCGTATAGGTCGAACTGGCAGAGCAGGTGCAAAAGG

                      aattgat  putative branch site (score: 76)
                              cacgtttctttccctt  CT-rich tract
      ttatattt  TA-rich tract

Putative cis-regulatory sequences

atgc	intron	ATGC	exonic elements by Pertea et al.
ATGC	exon	atgc	putative intronic elements
		ATGC	putative exonic elements identified for retained introns

        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
gtatgcccaactttgagatgtgatacatcttatatttcctgaggaaattgatacacgtttctttcccttggaaaacagATGTCAAGGATGTGAAGTATGTCATTAACTATGACTTTCCGGGGTCACTCGAGGATTATGTTCATCGTATAGGTCGAACTGGCAGAGCAGGTGCAAAAGG

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGGAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AGAGCA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGCAG