1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
gtgagccagtctttagtcaatctagctatgtaaattccttaacatgattttgagctatctcctgaaccctaactattgcaataatattacagGGCTTCAATGGAGCCGATATGCGCAACTTGTGCACAGAAGCCGGCATGGCTGCTATCCGAGCGGAGCGTGACTATGTCATTCACGAGGACTTCATGAAG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G074037_T01 |
intron # | 8 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TCGCAAAGCATGGGGAGATTGACTATGAAGCTGTAGTCAAACTAGCTGAG GGCTTCAATGGAGCCGATATGCGCAACTTGTGCACAGAAGCCGGCATGGCTEST: gi|78022855|gb|DV491242.1|DV491242
genomic: TCGCAAAGCATGGGGAGATTGACTATGAAGCTGTAGTCAAACTAGCTGAGgtgagccagt ... aatattacagGGCTTCAATGGAGCCGATATGCGCAACTTGTGCACAGAAGCCGGCATGGCT
EST: TCGCAAAGCATGGGGAGATTGACTATGAAGCTGTAGTCAAACTAGCTGAG GGCTTCAATGGAGCCGATATGCGCAACTTGTGCACAGAAGCCGGCATGGCTEST: gi|76014726|gb|DT941896.1|DT941896
genomic: TCGCAAAGCATGGGGAGATTGACTATGAAGCTGTAGTCAAACTAGCTGAGgtgagccagt ... aatattacagGGCTTCAATGGAGCCGATATGCGCAACTTGTGCACAGAAGCCGGCATGGCT
EST: TCGCAAAGCATGGGGAGATTGACTATGAAGCTGTAGTCAAACTAGCTGAG GGCTTCAATGGAGCCGATATGCGCAACTTGTGCACAGAAGCCGGCATGGCTEST: gi|18964891|gb|BM661269.1|BM661269
genomic: TCGCAAAGCATGGGGAGATTGACTATGAAGCTGTAGTCAAACTAGCTGAGgtgagccagt ... aatattacagGGCTTCAATGGAGCCGATATGCGCAACTTGTGCACAGAAGCCGGCATGGCT
EST: TCGCAAAGCATGGGGAGATTGACTATGAAGCTGTAGTCAAACTAGCTGAG GGCTTCAATGGAGCCGATATGCGCAACGTGTGCACAGAAGCCGGCATGGCTEST: gi|78112489|gb|DV530883.1|DV530883
genomic: TCGCAAAGCATGGGGAGATTGACTATGAAGCTGTAGTCAAACTAGCTGAGgtgagccagt ... aatattacagGGCTTCAATGGAGCCGATATGCGCAACTTGTGCACAGAAGCCGGCATGGCT
EST: TCGCAAAGCATGGGGAGATTGACTATGAAGCTGTAGTCAAACTAGCTGAG GGCTTCAATGGAGCCGATATGCGCAACTTGTGCACAGAAGCCGGCATGGCTEST: gi|211416916|gb|FL328808.1|FL328808
genomic: TCGCAAAGCATGGGGAGATTGACTATGAAGCTGTAGTCAAACTAGCTGAGgtgagccagt ... aatattacagGGCTTCAATGGAGCCGATATGCGCAACTTGTGCACAGAAGCCGGCATGGCT
EST: TCGCAAAGCATGGGGAGATTGACTATGAAGCTGTAGTCAAACTAGCTGAG GGCTTCAATGGAGCCGATATGCGCAACTTGTGCACAGAA-CCGGCATGGCTEST: gi|6031401|gb|AW076303.1|AW076303
genomic: TCGCAAAGCATGGGGAGATTGACTATGAAGCTGTAGTCAAACTAGCTGAGgtgagccagt ... aatattacagGGCTTCAATGGAGCCGATATGCGCAACTTGTGCACAGAAGCCGGCATGGCT
EST: TCGCAAAGCATGGGGAGATTGACTATGAAGCTGTAGTCAAACTAGCTGAG GGCTTCAATGGAGCCGATATGCGCAACTTGTGCACAGAAGCCGGCATGGCTEST: gi|78112490|gb|DV530884.1|DV530884
genomic: TCGCAAAGCATGGGGAGATTGACTATGAAGCTGTAGTCAAACTAGCTGAGgtgagccagt ... aatattacagGGCTTCAATGGAGCCGATATGCGCAACTTGTGCACAGAAGCCGGCATGGCT
EST: TCGCAAAGCATGGGGAGATTGACTATGAAGCTGTAGTCAAACTAGCTGAG GGCTTCAATGGAGCCGATATGCGCAACTTGTGCACAGAAGCCGGCATGGCTEST: gi|5871518|gb|AW017989.1|AW017989
genomic: TCGCAAAGCATGGGGAGATTGACTATGAAGCTGTAGTCAAACTAGCTGAGgtgagccagt ... aatattacagGGCTTCAATGGAGCCGATATGCGCAACTTGTGCACAGAAGCCGGCATGGCT
EST: TCGCAAAGCATGGGGAGATTGACTATGAAGCTGTAGTCAAACTAGCTGAG GGCTTCAATGGAGCCGATATGCGCAACTTGTGCCCAGAAGCCGGCATGGCTEST: gi|60397395|gb|DN230211.1|DN230211
genomic: TCGCAAAGCATGGGGAGATTGACTATGAAGCTGTAGTCAAACTAGCTGAGgtgagccagt ... aatattacagGGCTTCAATGGAGCCGATATGCGCAACTTGTGCACAGAAGCCGGCATGGCT
EST: TCGCAAAGCATGGGGAGATTGACTATGAAGCTGTAGTCAAACTAGCTGAG GGCTTCAATGGAGCCGATATGCGCAACTTGTGCACAGAAGCCGGCATGGCTEST: gi|32805840|gb|CD958074.1|CD958074
genomic: TCGCAAAGCATGGGGAGATTGACTATGAAGCTGTAGTCAAACTAGCTGAGgtgagccagt ... aatattacagGGCTTCAATGGAGCCGATATGCGCAACTTGTGCACAGAAGCCGGCATGGCT
EST: TCGCAAAGCATGGGGAGATTGACTATGAAGCTGGAGTCAAACTAGCTGAG GGCTTCAATGGAGCCGATATGCGCGACGTGTGCACAGAAGCCGGCATGGCTEST: gi|5607728|gb|AI901395.1|AI901395
genomic: TCGCAAAGCATGGGGAGATTGACTATGAAGCTGTAGTCAAACTAGCTGAGgtgagccagt ... aatattacagGGCTTCAATGGAGCCGATATGCGCAACTTGTGCACAGAAGCCGGCATGGCT
EST: TCGCAAAGCATGGGGAGATTGNCTATGAAGCTGTAGTCAAACTAGCTGAG GGCTTCAATGGAGCCGATATGCGCAACGTGTGCACAGAAGCCGGCATGGCTEST: gi|18180461|gb|BM381671.1|BM381671
genomic: TCGCAAAGCATGGGGAGATTGACTATGAAGCTGTAGTCAAACTAGCTGAGgtgagccagt ... aatattacagGGCTTCAATGGAGCCGATATGCGCAACTTGTGCACAGAAGCCGGCATGGCT
EST: TCGCAAAGCATGGGGAGATTGACTATGAAGCTGTAGTCAAACTAGCTGAG GGCTTCAATGGAGCCGATATGCGCAACTTGTGCACAGAAGCCGGCATGGCT
genomic: TCGCAAAGCATGGGGAGATTGACTATGAAGCTGTAGTCAAACTAGCTGAGgtgagccagt ... aatattacagGGCTTCAATGGAGCCGATATGCGCAACTTGTGCACAGAAGCCGGCATGGCT
cttaacatgattttgagctatctcctgaaccctaactattgcaataatattacagGGCTTCAATGGAGCCGATATGCGCAACTTGTGCACAGAAGCCGGCATGGCTGCTATCCGAGCGGAGCGTGACTATGTCATTCACGAGGACTTCATGAAG
ccctaac putative branch site (score: 83)
tattgcaataatatta TA-rich tract