1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
gtgagagcatcaataaaagttcgcttacatgtgtgttgtcaccattattctgcattggaagttcatacatcaataaaagttcacttacagtagcacacttgataggcttttgcatatgtttaactagatgttcttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCGATCATGGCAATGCTGAGGATATGGTGAAAAGGAACAAATCTGGCAAGC
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G003385_T02 |
intron # | 8 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ATATTGAGGCCNCCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGGATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|24765765|gb|CA400924.1|CA400924
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGGATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|60345366|gb|DN212339.1|DN212339
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCCACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGGATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|67024990|gb|CO453739.1|CO453739
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGGATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|67018390|gb|CO447139.1|CO447139
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAATCTGTTAAG ATCATTCTGGATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|31362420|gb|CD446777.1|CD446777
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGGATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|18170490|gb|BM340330.1|BM340330
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: GCTTGCAAGGCAGCTGAT-AAGGCTGTTAAG ATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTGCCTTGTTACTGCEST: gi|61119246|gb|DN560207.1|DN560207
genomic: GCTTGCAAGGCAGCTGATGAA-GCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|67015206|gb|CO443955.1|CO443955
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGGATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|24770211|gb|CA405340.1|CA405340
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGGATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|60394238|gb|DN227108.1|DN227108
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: GTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|113702480|gb|EE679984.1|EE679984
genomic: GTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: GAAGCTGTTAAG ATCATTTTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTCACCTTGTTACTGCCEST: gi|6021846|gb|AW066774.1|AW066774
genomic: GAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|31664103|gb|CD573283.1|CD573283
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|67014111|gb|CO442860.1|CO442860
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGGATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|213192767|gb|FM182154.1|FM182154
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGACGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGGATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTEST: gi|24769554|gb|CA404683.1|CA404683
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACT
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGGATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|60358060|gb|DN225033.1|DN225033
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|33091808|gb|CF051802.1|CF051802
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGACGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGGATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|166633986|gb|EG278785.1|EG278785
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACEST: gi|31359610|gb|CD443967.1|CD443967
genomic: ATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTAC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGGATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|37396131|gb|CF635353.1|CF635353
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|78085787|gb|DV514180.1|DV514180
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|211242237|gb|FL127857.1|FL127857
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|31361690|gb|CD446047.1|CD446047
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGGATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|120481376|gb|EH211274.1|EH211274
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|60356435|gb|DN223408.1|DN223408
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|37395541|gb|CF635051.1|CF635051
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|211242234|gb|FL127854.1|FL127854
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|21810017|gb|BQ668335.1|BQ668335
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: TTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGGATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|31354846|gb|CD439203.1|CD439203
genomic: TTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGGATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|33101922|gb|CF061882.1|CF061882
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGGATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|4647544|gb|AI622619.1|AI622619
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|116818560|gb|EC861602.1|EC861602
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGAATGCTGTCGAGCCAGTTGGTGGTATNTACCTTGTTACTGCCEST: gi|30088165|gb|CB886370.1|CB886370
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|6654085|gb|AW267490.1|AW267490
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: CGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGGATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|31363155|gb|CD447512.1|CD447512
genomic: CGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCTCCCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGGATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|40336839|gb|CK370909.1|CK370909
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|116820113|gb|EC863305.1|EC863305
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATAGAGGCTACCGTAGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGGATGCTGTEST: gi|60394802|gb|DN227672.1|DN227672
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGT
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|31362729|gb|CD447086.1|CD447086
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGGATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|24767470|gb|CA402612.1|CA402612
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGGATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|211240012|gb|FL127852.1|FL127852
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCEST: gi|31355731|gb|CD440088.1|CD440088
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
EST: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAG ATCATTCTGGATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
genomic: ATATTGAGGCTACCGTTGTTGCTTGCAAGGCAGCTGATGAAGCTGTTAAGgtgagagcat ... ttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCC
agtagcacacttgataggcttttgcatatgtttaactagatgttcttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCGATCATGGCAATGCTGAGGATATGGTGAAAAGGAACAAATCTGGCAAGC
gtttaac putative branch site (score: 829)
tgttcttct putative PPT
atatgtttaa TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| gtgagagcatcaataaaagttcgcttacatgtgtgttgtcaccattattctgcattggaagttcatacatcaataaaagttcacttacagtagcacacttgataggcttttgcatatgtttaactagatgttcttctgaacagATCATTCTGAATGCTGTCGAGCAAGTTGGTGGTATTTACCTTGTTACTGCCGATCATGGCAATGCTGAGGATATGGTGAAAAGGAACAAATCTGGCAAGC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ATGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGGAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGGAA