1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
...tctctgctggtttctggataaaaaaattattcatgcttaagtcattggtcaagatccacattcttcttctgctaactctgcatcttcttcaataatgcagCTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTGCCCCTAATATTGTTCTTAGCGCAGTCATTGACTAAGGCTATAGTCCAGGATTTTT
species | Zea mays |
transcript | GRMZM5G896082_T01 |
intron # | 7 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTATTCCAG CTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTGCCCCTAEST: gi|71325794|gb|DR799576.1|DR799576
genomic: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAGgtcagtgtct ... aataatgcagCTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTGCCCCTA
EST: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAG CTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCEST: gi|148959398|gb|EC905432.2|EC905432
genomic: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAGgtcagtgtct ... aataatgcagCTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGC
EST: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAG CTGCCAAAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTGGCTGEST: gi|78092904|gb|DV521278.1|DV521278
genomic: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAGgtcagtgtct ... aataatgcagCTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTG
EST: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAG CTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTGCCCCTAEST: gi|71449206|gb|DR830256.1|DR830256
genomic: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAGgtcagtgtct ... aataatgcagCTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTGCCCCTA
EST: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAG CTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTGCCCCTAEST: gi|78092903|gb|DV521277.1|DV521277
genomic: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAGgtcagtgtct ... aataatgcagCTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTGCCCCTA
EST: TTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAG CTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTGCCCCTAEST: gi|74239749|gb|DT647663.1|DT647663
genomic: TTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAGgtcagtgtct ... aataatgcagCTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTGCCCCTA
EST: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAG CTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTGCCCCTAEST: gi|93014353|gb|EB639873.1|EB639873
genomic: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAGgtcagtgtct ... aataatgcagCTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTGCCCCTA
EST: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAG CTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTGCCCCTAEST: gi|71773101|gb|DR971019.1|DR971019
genomic: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAGgtcagtgtct ... aataatgcagCTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTGCCCCTA
EST: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAG CTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTGCCCCTAEST: gi|149097127|gb|EE182939.2|EE182939
genomic: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAGgtcagtgtct ... aataatgcagCTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTGCCCCTA
EST: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAG CTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTTGCCCCTEST: gi|13316197|gb|BG410644.1|BG410644
genomic: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAGgtcagtgtct ... aataatgcagCTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTT-GCCCCT
EST: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAG CTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTGCCCCTAEST: gi|149058763|gb|EE156781.2|EE156781
genomic: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAGgtcagtgtct ... aataatgcagCTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTGCCCCTA
EST: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAG CTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGEST: gi|71322554|gb|DR797954.1|DR797954
genomic: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAGgtcagtgtct ... aataatgcagCTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTG
EST: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAG CTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTGCCCTCTEST: gi|71775245|gb|DR973123.1|DR973123
genomic: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAGgtcagtgtct ... aataatgcagCTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTGCCC-CT
EST: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAG CTGCCAGAGCCTTTCGGAATCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTGCCCEST: gi|71763483|gb|DR961420.1|DR961420
genomic: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAGgtcagtgtct ... aataatgcagCTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTGCCC
EST: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAG CTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTGCCCCTAEST: gi|13516143|gb|BG518419.1|BG518419
genomic: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAGgtcagtgtct ... aataatgcagCTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTGCCCCTA
EST: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAG CTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTGCCCCTAEST: gi|149058762|gb|EE156780.2|EE156780
genomic: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAGgtcagtgtct ... aataatgcagCTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTGCCCCTA
EST: TCAAGGTGTTCCAG CTGCCCGGAG-CTTTCGGAATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTGCCCCEST: gi|149011246|gb|EE042332.2|EE042332
genomic: TCAATGTGTTCCAGgtcagtgtct ... aataatgcagCTG-CCAGAGCCTTTCGG-ATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTGCCCC
EST: GTTCTTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAG CTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCEST: gi|78107802|gb|DV526220.1|DV526220
genomic: GTTCTTTTT-CATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAGgtcagtgtct ... aataatgcagCTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGC
EST: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAG CTGCCAGAGCCTTTCGGAATCATTTTCACATGTTTTGCTGCTTTGCCCCTAEST: gi|148949267|gb|EC894710.2|EC894710
genomic: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAGgtcagtgtct ... aataatgcagCTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTGCCCCTA
EST: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAG CTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTGCCCCTA
genomic: GTTCTTTTTCATTGATGAATTGACTGGTTTTGAGATCAATGTGTTCCAGgtcagtgtct ... aataatgcagCTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTGCCCCTA
tggtcaagatccacattcttcttctgctaactctgcatcttcttcaataatgcagCTGCCAGAGCCTTTCGGATTCATTTTCACATGGTTTGCTGCTTTGCCCCTAATATTGTTCTTAGCGCAGTCATTGACTAAGGCTATAGTCCAGGATTTTT
tgctaac putative branch site (score: 1)
tcttcttca putative PPT
ttcaataat TA-rich tract