1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
gtacgggtccggttttattactgttgctttggatggtgttggaatatctgtgcacatctatcacctttttgttacttgtcgctgtctgctacagtcacactgatgttttgtgccgcccctattatttgctagGGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAAGGTTCTCGTCCGGCATGACGCGTTGCTTTCAGTTCATCCGACAACAGCA
species | Zea mays |
transcript | GRMZM5G834205_T03 |
intron # | 7 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAG GGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAAEST: gi|78077690|gb|DV506124.1|DV506124
genomic: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAGgtacgggtcc ... tatttgctagGGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAA
EST: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAG GGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAAEST: gi|149050347|gb|EE155591.2|EE155591
genomic: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAGgtacgggtcc ... tatttgctagGGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAA
EST: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAG GGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAAEST: gi|84970062|gb|DW468434.1|DW468434
genomic: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAGgtacgggtcc ... tatttgctagGGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAA
EST: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAG GGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAAEST: gi|37375076|gb|CF623952.1|CF623952
genomic: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAGgtacgggtcc ... tatttgctagGGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAA
EST: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAG GGATGAAACGCTGGTATCA-A-GCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAAEST: gi|71302875|gb|DR787549.1|DR787549
genomic: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAGgtacgggtcc ... tatttgctagGGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAA
EST: AATGTACG-TTCAGAAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAG GGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAAEST: gi|71761883|gb|DR959820.1|DR959820
genomic: AATGTACGTTTCAG-AAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAGgtacgggtcc ... tatttgctagGGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAA
EST: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAG GGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAAEST: gi|86472430|gb|DY238800.1|DY238800
genomic: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAGgtacgggtcc ... tatttgctagGGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAA
EST: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAG GGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAAEST: gi|48690727|gb|CO049262.1|CO049262
genomic: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAGgtacgggtcc ... tatttgctagGGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAA
EST: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAG GGATGAAACACTGG-AGTCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAEST: gi|50325059|gb|CO520185.1|CO520185
genomic: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAGgtacgggtcc ... tatttgctagGGATGAAACACTGGTA-TCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATA
EST: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAG GGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAAEST: gi|211390578|gb|FL303487.1|FL303487
genomic: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAGgtacgggtcc ... tatttgctagGGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAA
EST: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAG GGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAAEST: gi|37394180|gb|CF634361.1|CF634361
genomic: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAGgtacgggtcc ... tatttgctagGGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAA
EST: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAG GGATGAAACGCTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAAEST: gi|76291817|gb|DV031385.1|DV031385
genomic: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAGgtacgggtcc ... tatttgctagGGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAA
EST: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAG GGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAA
genomic: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAGgtacgggtcc ... tatttgctagGGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAA
gtcgctgtctgctacagtcacactgatgttttgtgccgcccctattatttgctagGGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAAGGTTCTCGTCCGGCATGACGCGTTGCTTTCAGTTCATCCGACAACAGCA
cactgat putative branch site (score: 3)
cccctatt putative PPT
tattattt TA-rich tract