1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
gtacgggtccggttttattactgttgctttggatggtgttggaatatctgtgcacatctatcacctttttgttacttgtcgctgtctgctacagtcacactgatgttttgtgccgcccctattatttgctagGGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAAGGTTCTCGTCCGGCATGACGCGTTGCTTTCAGTTCATCCGACAACAGCA
species | Zea mays |
transcript | GRMZM5G834205_T01 |
intron # | 7 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAG GGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAAEST: gi|149059924|gb|EE157051.2|EE157051
genomic: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAGgtacgggtcc ... tatttgctagGGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAA
EST: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAG GGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAAEST: gi|149088092|gb|EE287276.2|EE287276
genomic: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAGgtacgggtcc ... tatttgctagGGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAA
EST: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAG GGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAAEST: gi|78107222|gb|DV525640.1|DV525640
genomic: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAGgtacgggtcc ... tatttgctagGGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAA
EST: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAG GGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAAEST: gi|50325446|gb|CO520572.1|CO520572
genomic: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAGgtacgggtcc ... tatttgctagGGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAA
EST: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAG GGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAAEST: gi|74245587|gb|DT653501.1|DT653501
genomic: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAGgtacgggtcc ... tatttgctagGGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAA
EST: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAG GGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAAEST: gi|149105965|gb|EE291598.2|EE291598
genomic: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAGgtacgggtcc ... tatttgctagGGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAA
EST: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAG GGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAAEST: gi|71428013|gb|DR809063.1|DR809063
genomic: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAGgtacgggtcc ... tatttgctagGGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAA
EST: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAG GGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAAEST: gi|211276223|gb|FL230638.1|FL230638
genomic: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAGgtacgggtcc ... tatttgctagGGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAA
EST: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAG GGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAAEST: gi|71326004|gb|DR799684.1|DR799684
genomic: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAGgtacgggtcc ... tatttgctagGGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAA
EST: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAG GGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAA
genomic: CAATGTACGTTTCAGAAGCAACGAATAATGCACCTTGTTATGACATCAAGgtacgggtcc ... tatttgctagGGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAA
gtcgctgtctgctacagtcacactgatgttttgtgccgcccctattatttgctagGGATGAAACACTGGTATCACAAGCTATAGAGCTAAATGAAGAGCTACATAAGGTTCTCGTCCGGCATGACGCGTTGCTTTCAGTTCATCCGACAACAGCA
cactgat putative branch site (score: 3)
cccctatt putative PPT
tattattt TA-rich tract