1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
gtacttctgtcgagaattcaattgacgtgaaagtttatgtttcagttcctattcatctattgaaattattgatctatttatctcctttgttcagGAGAGAGATTCAGTTGACGTTTTAGAACTTCTCTTGCCTATTATGCTTGGTCTGGTTGACACCATTACTCTCTCACAAACATATGTGCGCATGTTTGTGG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM5G828278_T01 |
intron # | 7 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AATTGCTTGTTCCCTCAGTACTTATCGAATGGCTATCTAACCAACTCCAG GAGAGAGATTCAGTTGACGTTTTAGAACTTCTCTTGCCTATTATGCTTGGTEST: gi|71320211|gb|DR796861.1|DR796861
genomic: AATTGCTTGTTCCCTCAGTACTTATCGAATGGCTATCTAACCAACTCCAGgtacttctgt ... ctttgttcagGAGAGAGATTCAGTTGACGTTTTAGAACTTCTCTTGCCTATTATGCTTGGT
EST: AATTGCTTGTTCCCTCAGTACTTATCGAATGGCTATCTAACCAACTCCAG GAGAGAGATTCAGTTGACGTTTTAGAACTTCTCTTGCCTATTATGCTTGGTEST: gi|88755756|gb|DY539897.1|DY539897
genomic: AATTGCTTGTTCCCTCAGTACTTATCGAATGGCTATCTAACCAACTCCAGgtacttctgt ... ctttgttcagGAGAGAGATTCAGTTGACGTTTTAGAACTTCTCTTGCCTATTATGCTTGGT
EST: AATTGCTTGTTCCCTCAGTACTTATCGAATGGCTATCTAACCAACTCCAG GAGAGAGATTCAGTTGACGTTTTAGAACTTCTCTTGCCTATTATGCTTGGT
genomic: AATTGCTTGTTCCCTCAGTACTTATCGAATGGCTATCTAACCAACTCCAGgtacttctgt ... ctttgttcagGAGAGAGATTCAGTTGACGTTTTAGAACTTCTCTTGCCTATTATGCTTGGT
tttcagttcctattcatctattgaaattattgatctatttatctcctttgttcagGAGAGAGATTCAGTTGACGTTTTAGAACTTCTCTTGCCTATTATGCTTGGTCTGGTTGACACCATTACTCTCTCACAAACATATGTGCGCATGTTTGTGG
tattgat putative branch site (score: 21)
tctatttatctccttt CT-rich tract
atctattgaaattatt TA-rich tract