1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' |
...tactgtaaggtcaacattcatatggagcattgtgtattaatgtatgctttacatgtctaaatatggcttaatcactgcttctgatttttgtaacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACATGGAAACAGCTCAATTCTTCAAACGTGATTTTGAAGAGAATGGTTCCA
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G094497_T01 |
intron # | 7 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACEST: gi|211466590|gb|FL062041.1|FL062041
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGGTGAAGATAACAACTTTGGCTATTGGGGTTTGCCGCTATGGGAEST: gi|211459011|gb|FL062002.1|FL062002
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGG-TGAAGATGACAACTTTG-CTATTGTG-TTTGCTGCTATGGGA
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAA-GCATGCTGAA GGTGGGTGAAAATGACA-CTTTTGCTAEST: gi|4681248|gb|AI629918.1|AI629918
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGG-TGAAGATGACAACTTT-GCTA
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACEST: gi|32829975|gb|CD969653.1|CD969653
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACEST: gi|31358862|gb|CD443219.1|CD443219
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGAATGACA-CTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAEST: gi|211474177|gb|FL062085.1|FL062085
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGA-TGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAA
EST: TCGTCAAGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAG-AAAGCATGCTGAAG GGTGGTGAAGATGAACA-CTTTGCTATTGEST: gi|211042620|gb|FL062102.1|FL062102
genomic: TCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGA-Ggtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGA-CAACTTTGCTATTG
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGGAGACATTGGAGAAAGGAAA-CATGCTGAG GGTGGTGAAGATGAACA-CTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAEST: gi|32838409|gb|CD978087.1|CD978087
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGA-CAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAA
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACEST: gi|13150538|gb|BG320860.1|BG320860
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAA-GCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGAEST: gi|32831681|gb|CD971359.1|CD971359
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGA
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACEST: gi|32910787|gb|CF015599.1|CF015599
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACEST: gi|13125954|gb|BG316629.1|BG316629
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: TGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACEST: gi|211459001|gb|FL061992.1|FL061992
genomic: TGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: TCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAAGGAA-GCATGCTGAG GGTGGGTGA-GATGACAACTTTGCTAATGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAEST: gi|31355490|gb|CD439847.1|CD439847
genomic: TCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAA-GGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGG-TGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAA
EST: GTCGACAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACEST: gi|211466591|gb|FL062042.1|FL062042
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGGAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAAACTTTTGCTAT-GTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAEST: gi|32929168|gb|CF033980.1|CF033980
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAA-CTTT-GCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGA
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACEST: gi|33101985|gb|CF061945.1|CF061945
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACEST: gi|32928560|gb|CF033372.1|CF033372
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACEST: gi|31349484|gb|CD433841.1|CD433841
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACEST: gi|31351385|gb|CD435742.1|CD435742
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACEST: gi|211042631|gb|FL062113.1|FL062113
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAA-CATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACEST: gi|31351754|gb|CD436111.1|CD436111
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACEST: gi|211474179|gb|FL062087.1|FL062087
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAA-GCATGCTGAG GGTGGTGA-GATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAATGAACEST: gi|33094782|gb|CF054776.1|CF054776
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACEST: gi|211471645|gb|FL062070.1|FL062070
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: TCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAAGGAA-GCATGCTGAG GGGTGGTGAAGATGACEST: gi|33102163|gb|CF062123.1|CF062123
genomic: TCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAA-GGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGG-TGGTGAAGATGAC
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACEST: gi|67020067|gb|CO448816.1|CO448816
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACEST: gi|32850751|gb|CD990432.1|CD990432
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACEST: gi|211469119|gb|FL062057.1|FL062057
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAA-GCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACA-CTTTGCTAT-GTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACEST: gi|32850726|gb|CD990407.1|CD990407
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACEST: gi|13490658|gb|BG517422.1|BG517422
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACEST: gi|33101471|gb|CF061431.1|CF061431
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACEST: gi|211469111|gb|FL062049.1|FL062049
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: TCGTCAGGCTGGTCTTGTTGA-GACATTGGAAAAAGGAA-GCATGCTGAG GGTGGTGGAGATGACAACTTTGCTATTGEST: gi|33102084|gb|CF062044.1|CF062044
genomic: TCGTCAGGCTGGTCTTGT-GAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTG
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACEST: gi|13125942|gb|BG316617.1|BG316617
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: TGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACEST: gi|211474175|gb|FL062083.1|FL062083
genomic: TGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACEST: gi|32831612|gb|CD971290.1|CD971290
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACEST: gi|211459003|gb|FL061994.1|FL061994
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTT-GCCTGCTATGGGAGTGAAEST: gi|31358847|gb|CD443204.1|CD443204
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGC-TGCTATGGGAGTGAA
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACA-CTTTGCTATTGTGTT-GCTGC-ATGGGAGTGA-CEST: gi|33102277|gb|CF062237.1|CF062237
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACEST: gi|13125963|gb|BG316638.1|BG316638
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: ATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGCTGAAEST: gi|13125933|gb|BG316608.1|BG316608
genomic: ATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAG-TGAA
EST: GACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACEST: gi|211466585|gb|FL062036.1|FL062036
genomic: GACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAA-CATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACA-CTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACEST: gi|31351755|gb|CD436112.1|CD436112
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
EST: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAG GGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
genomic: GTCGTCAGGCTGGTCTTGTGAAGACATTGGAGAAAGGAAAGCATGCTGAGgtagctaatg ... taacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAAC
gctttacatgtctaaatatggcttaatcactgcttctgatttttgtaacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACATGGAAACAGCTCAATTCTTCAAACGTGATTTTGAAGAGAATGGTTCCA
ttgtaac putative branch site (score: 1621)
tttttgt CT-rich tract
atttttgtaa TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| tactgtaaggtcaacattcatatggagcattgtgtattaatgtatgctttacatgtctaaatatggcttaatcactgcttctgatttttgtaacctgcagGGTGGTGAAGATGACAACTTTGCTATTGTGTTTGCTGCTATGGGAGTGAACATGGAAACAGCTCAATTCTTCAAACGTGATTTTGAAGAGAATGGTTCCA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CATGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CAGCTC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCTCA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TTGAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGAAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAGA
- - - - - - -acattca
- - - - - - - - - - - tggagca
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - tgtatgc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -tacatgt