1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
gtatccttttgttttctctctgcagctataacgttcattctaagtgcatattgctacttacaattttaaattattgaagtgcctaaattgtaaattttaagaattattattaaaagaaatgttgcaatgagttcctgaaaattttcctagATACCGGATCAAGATTCACCCTATGGGAAGCTATCCAAGAGTCACAGACATCCAGAATAACACATATGAACT
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G092112_T01 |
intron # | 7 |
splice site | 3' |
intron type | U12 (go to U12 genes for details) |
EST: CACCCCAAAATTCCA ATACCGGATCAAGATTCACCCTATGGGAAGCTATCCAAGAGTCACAGACATEST: gi|71764422|gb|DR962359.1|DR962359
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EST: GCTGCACTGCTGTTGCATACCATGGCTCAGTATTTCACCCCAAAATTCCA ATACCGGATCAAGATTCACCCTATGGGAAGCTATCCAAGAGTCACAGACATEST: gi|29545091|gb|CB605269.1|CB605269
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EST: GCTGCACTGCTGTTGCATACCATGGCTCAGTATTTCACCCCAAAATTCCA ATACCGGATCAAGATTCACCCTATGGGAAGCTATCCAAGAGTCACAGACATEST: gi|67014170|gb|CO442919.1|CO442919
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genomic: CTGCACTGCTGTTGCATACCATGG-CTCAGTATTTCACCCCAAAATTCCAgtatcctttt ... attttcctagATACCGGATCAAGATTCACCCTATGGGAAGCTATCCAAGAGTCACAGACAT
EST: GCTGCACTGCTGTTGCATACCATGGCTCAGTATTTCACCCCAAAATTCCA ATACCGGATCAAGATTCACCCTATGGGAAGCTATCCAAGAGTCACAGACATEST: gi|24767878|gb|CA403013.1|CA403013
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EST: GCTGCACTGCTGTTGCATACCATGGCTCAGTATTTCACCCCAAAATTCCA ATACCGGATCAAGATTCACCCTATGGGAAGCTATCCAAGAGTCACAGACATEST: gi|40303501|gb|CK347888.1|CK347888
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tttaagaattattattaaaagaaatgttgcaatgagttcctgaaaattttcctagATACCGGATCAAGATTCACCCTATGGGAAGCTATCCAAGAGTCACAGACATCCAGAATAACACATATGAACT
ttcctgaaa putative branch site
ttttcct putative PPT
aattattattaaaaga TA-rich tract