1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' |
...tgcagtgcatatcatctcatggacattatagtcttgtaaatattctcagataggtattttgttgtactacgatggaattactaactgccttagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCATATTCTGCAGAAGATGCTCGAGGTTTGCTGAAAGCAGCAATCAGGGATC
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G043198_T03 |
intron # | 7 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|211087670|gb|FL396337.1|FL396337
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|211325794|gb|FL399616.1|FL399616
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|71432759|gb|DR813809.1|DR813809
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|71310907|gb|DR791756.1|DR791756
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|211063939|gb|FL426137.1|FL426137
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TAGGGGTCCNAATGGTGCTGCTGTTCGGAGT-GGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGEST: gi|31355375|gb|CD439732.1|CD439732
genomic: TAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCT-GGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATG
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|76282096|gb|DV021664.1|DV021664
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|211395332|gb|FL395257.1|FL395257
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGANGT-GGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCT-GGNTATGCACATGTTCCCCGGATTGAAEST: gi|211454584|gb|FL410342.1|FL410342
genomic: TAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGA-GTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGG-TATGCACATGTTCCC-GGATTGAA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|149008831|gb|EE041037.2|EE041037
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|22473034|gb|BU037529.1|BU037529
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|50323851|gb|CO518977.1|CO518977
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|50338477|gb|CO533603.1|CO533603
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|148962973|gb|EE013917.2|EE013917
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|148957039|gb|EC902998.2|EC902998
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TAGGGGGTC-AAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAACTTTGGTATGCACCTGTTCCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCEST: gi|149083342|gb|EE172638.2|EE172638
genomic: TAGGGG-TCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTT-GGTATGCACATGTTCCC-GGATTGAAAGTTCTAGCTC
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|78112129|gb|DV530525.1|DV530525
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCEST: gi|148986266|gb|EE029999.2|EE029999
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGC-AGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCC
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|18964295|gb|BM660923.1|BM660923
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|211493595|gb|FL394896.1|FL394896
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|149083993|gb|EE173384.2|EE173384
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|149008355|gb|EE040508.2|EE040508
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|149080209|gb|EE169232.2|EE169232
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|78092119|gb|DV520493.1|DV520493
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|71431246|gb|DR812296.1|DR812296
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|149060161|gb|EE157129.2|EE157129
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|148995150|gb|EE034430.2|EE034430
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|71316612|gb|DR794981.1|DR794981
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|60672217|gb|DN474985.1|DN474985
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|31354921|gb|CD439278.1|CD439278
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|14206753|gb|BG840431.1|BG840431
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|211231538|gb|FL370980.1|FL370980
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|8367560|gb|BE050505.1|BE050505
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|148945013|gb|EC890191.2|EC890191
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|148933048|gb|EE285947.2|EE285947
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|148936258|gb|EC880337.2|EC880337
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|50338853|gb|CO533979.1|CO533979
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|50322511|gb|CO517637.1|CO517637
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|211275651|gb|FL423569.1|FL423569
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCEST: gi|71442750|gb|DR823800.1|DR823800
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTT-GGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCC
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|211126332|gb|FL371833.1|FL371833
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|93017393|gb|EB642913.1|EB642913
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|149097247|gb|EE183065.2|EE183065
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|93281968|gb|EB674232.1|EB674232
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCCAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCCACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGEST: gi|213187914|gb|FM182663.1|FM182663
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAG
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCAEST: gi|211311674|gb|FL419261.1|FL419261
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCA
EST: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAG TGCTATGCAGCTTGGTA
genomic: TTAGGGGTCCAAATGGTGCTGCTGCTGGAGTTGGTGCCCAACACTCACAGgtttttgcac ... tagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTA
tcagataggtattttgttgtactacgatggaattactaactgccttagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCATATTCTGCAGAAGATGCTCGAGGTTTGCTGAAAGCAGCAATCAGGGATC
tactaac putative branch site (score: 0)
ctgcctt CT-rich tract
tattttgtt TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| tgcagtgcatatcatctcatggacattatagtcttgtaaatattctcagataggtattttgttgtactacgatggaattactaactgccttagtatgcagTGCTATGCAGCTTGGTATGCACATGTTCCCGGATTGAAAGTTCTAGCTCCATATTCTGCAGAAGATGCTCGAGGTTTGCTGAAAGCAGCAATCAGGGATC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - CTGCAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGATG
- - gtgcata
- - - - - - - - -catggac
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -tttgttg