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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...ttgtactagcctctattgtctggggcttttaaggtgattagtgaaagcctgagatacgtatatgttaatgagttttacttgtgatccttatttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAATGGCCCACAGTTGTATCAG

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM5G850355_T04
intron # 6
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM5G850355_T02 (Zea mays), 3'ss of exon 7
lower sequence: LOC_Os02g42320.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 5
--ttgtactagcctctattgtctggggcttttaaggtgattagtgaaagcctgagatacgtatatgttaatgagttttacttgtgatc--cttatttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAATGGCCCACAGTTGTATCAG
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upper sequence: GRMZM5G850355_T02 (Zea mays), 3'ss of exon 7
lower sequence: LOC_Os02g42320.4 (Oryza sativa), 3'ss of exon 6
--ttgtactagcctctattgtctggggcttttaaggtgattagtgaaagcctgagatacgtatatgttaatgagttttacttgtgatc--cttatttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAATGGCCCACAGTTGTATCAG------------------------------
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gattggtgaatcctgaagtacagttcactccttaaa-gat--atgaatatatgatgtaaccgaatttctgag-gcatgactcacggccaacttgtttgttgcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCATTATTGATTGCCGGGTACGATGACAATGGCCCACAGCTGTATCAGGTATGCAGATAGCTGCGTGATAGGGGCTCT

upper sequence: GRMZM5G850355_T02 (Zea mays), 3'ss of exon 7
lower sequence: Vv01s0011g01960.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 6
---ttgtactagcctctattgtctggggcttttaaggtgattagtgaaagcctgagatacgtatatgttaatgagttttacttgtgatccttatttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAATGGCCCACAGTTGTATCAG
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attttaagcaatgcataaacctctgaa---ttacagaagcatatagaaaagctcaattatttaaatgaagtttgatatcttttctttcttcttattcctatagTGGTGTAAGGCCCTTTGGAGTATCACTGTTGGTTGCTGGTTTTGATGACAATGGTCCACAATTGTACCAG

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|6031332|gb|AW076189.1|AW076189
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCGCTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|32931645|gb|CF036457.1|CF036457
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCGCTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|6020544|gb|AW065472.1|AW065472
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|5895580|gb|AW036826.1|AW036826
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|6653876|gb|AW267281.1|AW267281
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCNCCCAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCNCTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|60355411|gb|DN222384.1|DN222384
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|32930042|gb|CF034854.1|CF034854
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCGCTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|60346286|gb|DN213259.1|DN213259
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCGCTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|15427202|gb|BI543024.1|BI543024
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACA
EST: gi|211062082|gb|FL465318.1|FL465318
EST:     CAGCTTGTGCGAGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCGCTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|32934694|gb|CF039506.1|CF039506
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGAC
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGAC
EST: gi|56382484|gb|CV985153.1|CV985153
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|32932932|gb|CF037744.1|CF037744
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCGCTGTTGAT-GNCTGGGTACGATGACA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTG-CTGGGTATGATGACA
EST: gi|40337252|gb|CK371322.1|CK371322
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|22520740|gb|BU079551.1|BU079551
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCGCTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|78021721|gb|DV490108.1|DV490108
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGATTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|5566889|gb|AI881800.1|AI881800
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCGCTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|14242859|gb|BG840665.2|BG840665
EST:     CAGCTTGTGCGAGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCGCTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|60341905|gb|DN208878.1|DN208878
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCGCTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|32849719|gb|CD989400.1|CD989400
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCGCTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|32931156|gb|CF035968.1|CF035968
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCGCTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|32908069|gb|CF012882.1|CF012882
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCGCTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|9254141|gb|BE344609.1|BE344609
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|16918711|gb|BM073864.1|BM073864
EST:     CAGCTTG-GCGAGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCGCTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|12967997|gb|BG264944.1|BG264944
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genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|32942863|gb|CF047682.1|CF047682
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCGCTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|87156656|gb|DY401445.1|DY401445
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCGCTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|14203539|gb|BG837216.1|BG837216
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|9461620|gb|BE453822.1|BE453822
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|60354522|gb|DN221495.1|DN221495
EST:     CAGCTTGTGCGAGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCGCTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|14243343|gb|BG841010.2|BG841010
EST:     CAGCTTGTGCGAGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCGCTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|211156517|gb|FL164231.1|FL164231
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGKTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|60359187|gb|DN226160.1|DN226160
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCGCTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|32868632|gb|CF008314.1|CF008314
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCGCTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|5456374|gb|AI834064.1|AI834064
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCGCTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|31355634|gb|CD439991.1|CD439991
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|71331106|gb|DR802380.1|DR802380
EST:     CAGCTTGTGCGAGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCGCTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|29167732|gb|CB410992.1|CB410992
EST:     CAGCTTGTGCGAGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCGCTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|113702959|gb|EE680463.1|EE680463
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCGCTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|211062081|gb|FL465317.1|FL465317
EST:     CAGCTTGTGCGAGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCGCTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAA
EST: gi|8367928|gb|BE050873.1|BE050873
EST:     CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGG                         TGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGAT
genomic: CAGCTTGTGCGGGAGACTGCTGCTGTGATGCAGGAGTTCACACAGTCAGGgtatttaact ... tttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGAT
EST: gi|32865823|gb|CF005505.1|CF005505
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 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

agcctgagatacgtatatgttaatgagttttacttgtgatccttatttgtttcagTGGTGTAAGACCATTTGGAGTATCACTGTTGATTGCTGGGTATGATGACAATGGCCCACAGTTGTATCAG
                 tgttaat  putative branch site (score: 3)
                                       tccttatttgtttc  putative PPT
             tatatgttaat  TA-rich tract