1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' |
gtatgagcctcattttttttacactctcttttgttgtttttttgcttggaatatattgggttaatttgttgcatctccagACTCTATACCAAATGTTTATTGTCAATGCTGGTCCGGGTTTCCGGCTACTATGGAACACTGTGAAGTCCTTTCTTGATCCCAAAACTACCGCCAAGATAC
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G171354_T01 |
intron # | 6 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GTGAATTAATTCAGCGACTGCAGAAAATTGACAATGATAACTACCCAGAG ACTCTATACCAAATGTTTATTGTCAATGCTGGTCCGGGTTTCCGGCTACTAEST: gi|32933167|gb|CF037979.1|CF037979
genomic: GTGAATTAATTCAGCGACTGCAGAAAATTGACAATGATAACTACCCAGAGgtatgagcct ... gcatctccagACTCTATACCAAATGTTTATTGTCAATGCTGGTCCGGGTTTCCGGCTACTA
EST: GTGAATTAATTCGGCGACTGCAGAAAATTGACAATGATAACTACCCAGAG ACTCTATACCAAATGTTTATTGTCAATGCTGGTCCGGGTTTCCGGCTACTAEST: gi|211297306|gb|FK975033.1|FK975033
genomic: GTGAATTAATTCAGCGACTGCAGAAAATTGACAATGATAACTACCCAGAGgtatgagcct ... gcatctccagACTCTATACCAAATGTTTATTGTCAATGCTGGTCCGGGTTTCCGGCTACTA
EST: GTGAATTAATTCAGCGACTGCAGAAAATTGACAATGATAACTACCCAGAG ACTCTATACCAAATGTTTATTGTCAATGCTGGTCCGGGTTTCCGGCTACTAEST: gi|13178166|gb|BG349424.1|BG349424
genomic: GTGAATTAATTCAGCGACTGCAGAAAATTGACAATGATAACTACCCAGAGgtatgagcct ... gcatctccagACTCTATACCAAATGTTTATTGTCAATGCTGGTCCGGGTTTCCGGCTACTA
EST: GTGAATTAATTCAGCGACTGCAGAAAATTGACAATGATAACTACCCAGAG ACTCTATACCAAATGTTTATTGTCAATGCTGGTCCGGGTTTCEST: gi|6564181|gb|AW231803.1|AW231803
genomic: GTGAATTAATTCAGCGACTGCAGAAAATTGACAATGATAACTACCCAGAGgtatgagcct ... gcatctccagACTCTATACCAAATGTTTATTGTCAATGCTGGTCCGGGTTTC
EST: GTGAATTAATTCAGCGACTGCAGAAAATTGACAATGATAACTACCCAGAG ACTCTATACCAAATGTTTATTGTCAATGCTGGTCCGGGTTTCCGGCTACTAEST: gi|211297305|gb|FK975032.1|FK975032
genomic: GTGAATTAATTCAGCGACTGCAGAAAATTGACAATGATAACTACCCAGAGgtatgagcct ... gcatctccagACTCTATACCAAATGTTTATTGTCAATGCTGGTCCGGGTTTCCGGCTACTA
EST: GTGAATTAATTCAGCGACTGCAGAAAATTGACAATGATAACTACCCAGAG ACTCTATACCAAATGTTTATTGTCAATGCTGGTCCGGGTTTCCGGCTACTA
genomic: GTGAATTAATTCAGCGACTGCAGAAAATTGACAATGATAACTACCCAGAGgtatgagcct ... gcatctccagACTCTATACCAAATGTTTATTGTCAATGCTGGTCCGGGTTTCCGGCTACTA
ctcttttgttgtttttttgcttggaatatattgggttaatttgttgcatctccagACTCTATACCAAATGTTTATTGTCAATGCTGGTCCGGGTTTCCGGCTACTATGGAACACTGTGAAGTCCTTTCTTGATCCCAAAACTACCGCCAAGATAC
ggttaat putative branch site (score: 4)
catctcc putative PPT
ttgttttttt TA-rich tract