1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
gtatattacctcagttttcacacacacagaattttgtgaatcacacatttgtttgaccatttagttatgtttctgatgcgaacatttactgccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGACCATTGTCGATGACCTTGTCTCTGTTGACACTCTCATCGAGGACCATCT
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G153569_T02 |
intron # | 6 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCAT CCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGAEST: gi|31357004|gb|CD441361.1|CD441361
genomic: GAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacc ... ccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGA
EST: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCAT CCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGAEST: gi|4730768|gb|AI649934.1|AI649934
genomic: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacc ... ccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGA
EST: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCAT CCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGAEST: gi|60339257|gb|DN206230.1|DN206230
genomic: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacc ... ccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGA
EST: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCAT CCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGAEST: gi|76285318|gb|DV024886.1|DV024886
genomic: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacc ... ccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGA
EST: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCAT CCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGAEST: gi|211291797|gb|FL131040.1|FL131040
genomic: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacc ... ccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGA
EST: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCAT CCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGAEST: gi|32839749|gb|CD979430.1|CD979430
genomic: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacc ... ccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGA
EST: AGGAAGCTGTTAGGAGTGGCCAGATGGAAGGGCTGCTTTGGGGCGCAT CCAAGCTTGTGCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGAEST: gi|6056800|gb|AW091205.1|AW091205
genomic: AGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacc ... ccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGA
EST: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCAT CCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGAEST: gi|32840968|gb|CD980649.1|CD980649
genomic: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacc ... ccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGA
EST: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCAT CCAAGCTAGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGAEST: gi|4804538|gb|AI665411.2|AI665411
genomic: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacc ... ccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGA
EST: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCAT CCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGAEST: gi|67012865|gb|CO441614.1|CO441614
genomic: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacc ... ccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGA
EST: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCAT CCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGAEST: gi|84969889|gb|DW468295.1|DW468295
genomic: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacc ... ccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGA
EST: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCAT CCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGAEST: gi|31405963|gb|CD484695.1|CD484695
genomic: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacc ... ccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGA
EST: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCAT CCAAGCTCGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGAEST: gi|4827437|gb|AI668129.1|AI668129
genomic: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacc ... ccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGA
EST: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCAT CCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGAEST: gi|33093219|gb|CF053213.1|CF053213
genomic: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacc ... ccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGA
EST: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCAT CCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGAEST: gi|6695529|gb|AW288637.1|AW288637
genomic: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacc ... ccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGA
EST: GAAGGACTGCTTTGGGGCGCAT CCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGAEST: gi|89106046|gb|DY576263.1|DY576263
genomic: GAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacc ... ccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGA
EST: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCAT CCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGAEST: gi|32846492|gb|CD986173.1|CD986173
genomic: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacc ... ccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGA
EST: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCAT CCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGAEST: gi|6021987|gb|AW066915.1|AW066915
genomic: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacc ... ccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGA
EST: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGGCTGCTTTGGGGCGCAT CCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGAEST: gi|67037468|gb|CO464282.1|CO464282
genomic: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacc ... ccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGA
EST: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCAT CCAAGCTTGTCCCAGNTGGATATGGGCATCA-GAAGCTGNCAA-TCATGATEST: gi|60398710|gb|DN231526.1|DN231526
genomic: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacc ... ccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGG-CATCAAGAAGCTG-CAAATCATGAT
EST: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCAT CCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGAEST: gi|113848064|gb|DW962767.1|DW962767
genomic: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacc ... ccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGA
EST: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCAT CCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCAEST: gi|116815743|gb|EC858430.1|EC858430
genomic: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacc ... ccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCA
EST: CGA-GAAGCTGTTAGGAGT-T-CAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCAT -CAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGAEST: gi|16378152|gb|BI992294.1|BI992294
genomic: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacc ... ccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGA
EST: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCAT CCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGAEST: gi|67016304|gb|CO445053.1|CO445053
genomic: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacc ... ccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGA
EST: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCAT CCAAGCTTGTCCCAGNTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGAEST: gi|8273074|gb|BE012169.1|BE012169
genomic: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacc ... ccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGA
EST: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCAT CCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGAEST: gi|84977404|gb|DW475826.1|DW475826
genomic: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacc ... ccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGA
EST: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCAT CCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGAEST: gi|31406066|gb|CD484798.1|CD484798
genomic: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacc ... ccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGA
EST: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCAT CCAAGCTCGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGAEST: gi|31440896|gb|CD510327.1|CD510327
genomic: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacc ... ccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGA
EST: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCAT CCAAGCTCGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGAEST: gi|71315076|gb|DR794166.1|DR794166
genomic: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacc ... ccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGA
EST: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCAT CCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGAEST: gi|33093139|gb|CF053133.1|CF053133
genomic: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacc ... ccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGA
EST: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCAT CCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGA
genomic: CGAGGAAGCTGTTAGGAGTGTCCAGATGGAAGGACTGCTTTGGGGCGCATgtatattacc ... ccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGA
atttgtttgaccatttagttatgtttctgatgcgaacatttactgccctttgcagCCAAGCTTGTCCCAGTTGGATATGGCATCAAGAAGCTGCAAATCATGATGACCATTGTCGATGACCTTGTCTCTGTTGACACTCTCATCGAGGACCATCT
ttctgat putative branch site (score: 3)
ctgcccttt putative PPT
atttagttatgttt TA-rich tract