1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
gtaagtctcgttaacctgaaagcttatcacgcatgttccatcctctggaattattctgagacaactactgaccttttctctacgttctgaatttgatctcttctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGCTAACAAAGGAATCAAGGTTGTAAAGGGCACGGTTGCTGTTGGTTTCGA
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G134708_T01 |
intron # | 6 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTATCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|149089132|gb|EE178315.2|EE178315
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|32839220|gb|CD978901.1|CD978901
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: TACCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTACGAGGGCTACTATGEST: gi|14191042|gb|BG833272.1|BG833272
genomic: TACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTACGAGGGCTACTATGEST: gi|71445023|gb|DR826073.1|DR826073
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|32920310|gb|CF025122.1|CF025122
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTATCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|84980717|gb|DW531066.1|DW531066
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|71422582|gb|DR805773.1|DR805773
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|32922417|gb|CF027229.1|CF027229
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTATCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|19057725|gb|BM736392.1|BM736392
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGCATTGCTCATTTCTACGAGGGCTACTATGEST: gi|50327427|gb|CO522553.1|CO522553
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|76931161|gb|DV172672.1|DV172672
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|32836981|gb|CD976659.1|CD976659
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: TACCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTACGAGGGCTACTATGEST: gi|148931363|gb|EC874265.2|EC874265
genomic: TACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|32923140|gb|CF027952.1|CF027952
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTATCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|44682264|gb|CK787312.1|CK787312
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|32847254|gb|CD986935.1|CD986935
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: ACCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTACGAGGGCTACTATGEST: gi|32923403|gb|CF028215.1|CF028215
genomic: ACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTATCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|32922493|gb|CF027305.1|CF027305
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTATCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|32922136|gb|CF026948.1|CF026948
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTATCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|32921861|gb|CF026673.1|CF026673
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: CTTCGATGTGACCATGGTGTATCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|149111140|gb|EE294635.2|EE294635
genomic: CTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGATGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATEST: gi|71439293|gb|DR820343.1|DR820343
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCAT
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|32920363|gb|CF025175.1|CF025175
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTATCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|32922231|gb|CF027043.1|CF027043
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTATCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCGCTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|32921955|gb|CF026767.1|CF026767
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTATCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|71298889|gb|DR785439.1|DR785439
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|94478914|gb|EB707872.1|EB707872
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|32923263|gb|CF028075.1|CF028075
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTATCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|32923579|gb|CF028391.1|CF028391
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTATCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|67014083|gb|CO442832.1|CO442832
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|32921956|gb|CF026768.1|CF026768
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTATCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|32839119|gb|CD978800.1|CD978800
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: ACCCCGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTACGAGGGCTACTATGEST: gi|32922199|gb|CF027011.1|CF027011
genomic: ACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTATCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|32920482|gb|CF025294.1|CF025294
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTATCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|148939718|gb|EC884396.2|EC884396
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|88751027|gb|DY535168.1|DY535168
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCTATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTEST: gi|149111386|gb|EE294890.2|EE294890
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCT
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|32923589|gb|CF028401.1|CF028401
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTATCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|32837202|gb|CD976880.1|CD976880
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: ACCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTACGAGGGCTACTATGEST: gi|32922933|gb|CF027745.1|CF027745
genomic: ACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTATCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|32923287|gb|CF028099.1|CF028099
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTATCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|32922893|gb|CF027705.1|CF027705
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTATCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|149084652|gb|EE174137.2|EE174137
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|148941238|gb|EC886132.2|EC886132
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|148936977|gb|EC881144.2|EC881144
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|32836497|gb|CD976175.1|CD976175
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: TACCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTACGAGGGCTACTATGEST: gi|148940672|gb|EC885484.2|EC885484
genomic: TACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|32923539|gb|CF028351.1|CF028351
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTATCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|84980996|gb|DW531345.1|DW531345
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATEST: gi|32923175|gb|CF027987.1|CF027987
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTAT
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTATCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|148937253|gb|EC881434.2|EC881434
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|148932994|gb|EE285869.2|EE285869
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|32922583|gb|CF027395.1|CF027395
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTATCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|32922169|gb|CF026981.1|CF026981
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTATCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|32920371|gb|CF025183.1|CF025183
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTATCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATAAGGGCTACTATGEST: gi|24934486|gb|CA452704.1|CA452704
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: ACCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTACGAGGGCTACTATGEST: gi|148934201|gb|EC878222.2|EC878222
genomic: ACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|32923611|gb|CF028423.1|CF028423
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTATCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|32922528|gb|CF027340.1|CF027340
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTATCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|32920307|gb|CF025119.1|CF025119
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTATCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGEST: gi|32923404|gb|CF028216.1|CF028216
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
EST: GANAATCACCACCTTCGATGTGACCATGGTGTATCCTGAACCGTGGTGCA TGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
genomic: GAAAATCAACAACTTCGATGTGACCATGGTGTACCCTGAACCGTGGTGCAgtaagtctcg ... ctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATG
gagacaactactgaccttttctctacgttctgaatttgatctcttctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGCTAACAAAGGAATCAAGGTTGTAAAGGGCACGGTTGCTGTTGGTTTCGA
tctcttctacttct CT-rich tract
aatttgat TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| gtaagtctcgttaacctgaaagcttatcacgcatgttccatcctctggaattattctgagacaactactgaccttttctctacgttctgaatttgatctcttctacttctagTGCCCCGTCTCTTCACTGCTGGTATTGCTCATTTCTATGAGGGCTACTATGCTAACAAAGGAATCAAGGTTGTAAAGGGCACGGTTGCTGTTGGTTTCGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGGAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGTT