Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...tactatgttatcctttatttcaaatgttagcctttaactgttctctttaaatgtgaccttcacaagaaaacatggaatttaatttttaaaattattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGGCAGAG

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G106427_T03
intron # 6
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G106427_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 5
lower sequence: LOC_Os09g07320.2 (Oryza sativa), 3'ss of exon 5
tactatgttatcctttatttcaaatgttagcctttaactgttctctttaaat--gtgaccttcacaagaaaacatggaatttaatttttaaaattattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGGCAGAG
 | |   | |    | | |    |||||| ||| ||  | ||    ||   |    || |   | | ||||| ||| ||   ||| |||  | |  ||||||||||| ||||||||||| || || || || |||||| ||||||||| ||||||| |
gattcattaagttgtaaatattgatgtta-cctatatttattaatattgctttaaagaacaatataggaaaatatgaaacc-aatatttccattacttgcagGTTCTTTGGAAAGGTCTAGGGCTTGATGAAGGAAATACTGTTGGAAGTTGGCAGGG
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|101395722|gb|EB819789.1|EB819789
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTTTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|89764268|gb|DY691136.1|DY691136
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|87155475|gb|DY400264.1|DY400264
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         TTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|211222555|gb|FL103716.1|FL103716
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|31361026|gb|CD445383.1|CD445383
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGGAATGCTGTTGGAACTTG-
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|71772737|gb|DR970664.1|DR970664
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|60355367|gb|DN222340.1|DN222340
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|78085144|gb|DV513537.1|DV513537
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|78124578|gb|DV542962.1|DV542962
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTTTA                         GTTTTATGGAAAGGTCTTGGTTTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|76929933|gb|DV172225.1|DV172225
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|31355615|gb|CD439972.1|CD439972
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|71764615|gb|DR962552.1|DR962552
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|22472874|gb|BU037354.1|BU037354
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         TTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTG
EST: gi|76282655|gb|DV022223.1|DV022223
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|76017530|gb|DT944700.1|DT944700
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|87156227|gb|DY401016.1|DY401016
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         TTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|78090250|gb|DV518624.1|DV518624
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|67011429|gb|CO440178.1|CO440178
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|5123996|gb|AI745837.1|AI745837
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|76291547|gb|DV031115.1|DV031115
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|76282654|gb|DV022222.1|DV022222
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|148935625|gb|EC879669.2|EC879669
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|74232848|gb|DT640762.1|DT640762
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|76929934|gb|DV172226.1|DV172226
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|149074981|gb|EE163447.2|EE163447
EST:     TACAGAAGACCCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGT
genomic: TACAGAAGACC-ACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTT-GGTCTGGAGGATGGAAATGCTGT
EST: gi|76280900|gb|DV020468.1|DV020468
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|101395724|gb|EB819790.1|EB819790
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTC-TGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTG
EST: gi|74232847|gb|DT640761.1|DT640761
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|101392862|gb|EB818362.1|EB818362
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|71764614|gb|DR962551.1|DR962551
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|71427683|gb|DR808733.1|DR808733
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|101392090|gb|EB817972.1|EB817972
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGGAACTTG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGG-AACTTG
EST: gi|76280901|gb|DV020469.1|DV020469
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|50331775|gb|CO526901.1|CO526901
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|101394322|gb|EB819096.1|EB819096
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGG
EST: gi|60339837|gb|DN206810.1|DN206810
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|78090251|gb|DV518625.1|DV518625
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|148969161|gb|EE019904.2|EE019904
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
EST: gi|149074980|gb|EE163446.2|EE163446
EST:     GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTA                         GTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG
genomic: GTACAGAAGACCACTGGGGTCGACAAGATGCTGCACAGGCAATTGCTCTAgtgagctctc ... attattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGG


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tttaaatgtgaccttcacaagaaaacatggaatttaatttttaaaattattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGGCAGAG
                               atttaat  putative branch site (score: 4)
                acaagaaaacatggaa  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
tactatgttatcctttatttcaaatgttagcctttaactgttctctttaaatgtgaccttcacaagaaaacatggaatttaatttttaaaattattgcagGTTCTATGGAAAGGTCTTGGTCTGGAGGATGGAAATGCTGTTGGAACTTGGCAGAG

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GGAGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGGAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AGGATG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GATGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - ATGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGTT