1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
gtgagttgctgttgcttcatgtcggtctgttgaggctaaatcaaacttccattttcctgaacaatgtgttgtttctgtcttcagATGCTCATGGATGTCCTGGATTTTCTAAGACTGCCTAAGAGGAAGCTGTTGAGTCGACATGTGAAAATCCACACTAAACGATTGCGTGATCATATTGATA
species | Zea mays |
transcript | GRMZM5G877077_T02 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CTATGAGGATGTTGTCAGGAGTCGGACG ATGCTCATGGATGTCCTGGATTTTCTAAGACTGCCTAAGAGGAAGCTGTTGEST: gi|211272705|gb|FL458991.1|FL458991
genomic: CTATGAGGATGTTGTCAGGAGTCGGACGgtgagttgct ... ctgtcttcagATGCTCATGGATGTCCTGGATTTTCTAAGACTGCCTAAGAGGAAGCTGTTG
EST: ACACCAGGCATGTCGTTCTGTACTATGAGGATGTTGTCAGGAGTCGGACG ATGCTCATGGATGTCCTGGATTTTCTAAGACTGCCTAAGAGGAAGCTGTTGEST: gi|5714176|gb|AI944161.1|AI944161
genomic: ACACCAGGCATGTCGTTCTGTACTATGAGGATGTTGTCAGGAGTCGGACGgtgagttgct ... ctgtcttcagATGCTCATGGATGTCCTGGATTTTCTAAGACTGCCTAAGAGGAAGCTGTTG
EST: ACACCAGGCATGTCGTTCTGTACTATGAGGATGTTGTCAGGAGTCGGACG ATGCTCATGGATGTCCTGGATTTTCTAAGACTGCCTAAGAGGAAGCTGTTG
genomic: ACACCAGGCATGTCGTTCTGTACTATGAGGATGTTGTCAGGAGTCGGACGgtgagttgct ... ctgtcttcagATGCTCATGGATGTCCTGGATTTTCTAAGACTGCCTAAGAGGAAGCTGTTG
ttgaggctaaatcaaacttccattttcctgaacaatgtgttgtttctgtcttcagATGCTCATGGATGTCCTGGATTTTCTAAGACTGCCTAAGAGGAAGCTGTTGAGTCGACATGTGAAAATCCACACTAAACGATTGCGTGATCATATTGATA
ggctaaa putative branch site (score: 3)
ttgtttctgtcttc putative PPT
taaatcaaa TA-rich tract