1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
gtaagtctttgtggtgcactattacaatgtggatttctagttttcttttctaacataaccttttgcggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAGTACGGGGTAGGGTAATGAAGTTCAATGCAAAACCAGCCCATGGTCACTG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM5G862331_T04 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGG GAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAGEST: gi|74244705|gb|DT652619.1|DT652619
genomic: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGGgtaagtcttt ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAG
EST: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGG GAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAGEST: gi|71427532|gb|DR808582.1|DR808582
genomic: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGGgtaagtcttt ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAG
EST: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGG GAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTTTGAAGEST: gi|71419429|gb|DR804766.1|DR804766
genomic: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGGgtaagtcttt ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAG
EST: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGG GAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAGEST: gi|26559376|gb|CA831611.1|CA831611
genomic: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGGgtaagtcttt ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAG
EST: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGG GAGGGCTCCTAGATTCCGGCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAGEST: gi|8367197|gb|BE050133.1|BE050133
genomic: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGGgtaagtcttt ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAG
EST: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGG GAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAGEST: gi|113701557|gb|EE679061.1|EE679061
genomic: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGGgtaagtcttt ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAG
EST: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGG GAGGGCTCCTAGATTCCGGCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAGEST: gi|91051981|gb|EB162399.1|EB162399
genomic: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGGgtaagtcttt ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAG
EST: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGG GAGGGCTCCTAGATTCCCCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTTCTTCTGAAGEST: gi|71436658|gb|DR817708.1|DR817708
genomic: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGGgtaagtcttt ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAG
EST: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGG GAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGEST: gi|74240413|gb|DT648327.1|DT648327
genomic: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGGgtaagtcttt ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAG
EST: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGG GAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAGEST: gi|28987157|gb|CB351492.1|CB351492
genomic: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGGgtaagtcttt ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAG
EST: ACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTNNNNNNNATATGGTTATGG GAGGGCTCCTAGEST: gi|31911181|gb|CD651796.1|CD651796
genomic: ACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCC-ATATGGTTATGGgtaagtcttt ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAG
EST: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGG GAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAGEST: gi|28361626|gb|CB239982.1|CB239982
genomic: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGGgtaagtcttt ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAG
EST: ACCCCTTATAGATC-TACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGG GAGG-CTCCTAGATTEST: gi|6721087|gb|AW308724.1|AW308724
genomic: ACCC-TTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGGgtaagtcttt ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATT
EST: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGG GAGGGCTCCTAGATTCCGGCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAGEST: gi|101392226|gb|EB818041.1|EB818041
genomic: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGGgtaagtcttt ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAG
EST: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGG GAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTEST: gi|93015249|gb|EB640769.1|EB640769
genomic: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGGgtaagtcttt ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCT
EST: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGG GAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAGEST: gi|74237334|gb|DT645248.1|DT645248
genomic: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGGgtaagtcttt ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAG
EST: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGG GAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAGEST: gi|89759138|gb|DY688052.1|DY688052
genomic: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGGgtaagtcttt ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAG
EST: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGG GAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAGEST: gi|9254701|gb|BE345169.1|BE345169
genomic: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGGgtaagtcttt ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAG
EST: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGG GAGGGCTCCTAGATTCCGGCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAGEST: gi|74234517|gb|DT642431.1|DT642431
genomic: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGGgtaagtcttt ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAG
EST: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGG GAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAGEST: gi|14244084|gb|BG841816.2|BG841816
genomic: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGGgtaagtcttt ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAG
EST: AGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGG GAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAGEST: gi|74244706|gb|DT652620.1|DT652620
genomic: AGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGGgtaagtcttt ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAG
EST: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGG GAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAGEST: gi|60351779|gb|DN218752.1|DN218752
genomic: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGGgtaagtcttt ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAG
EST: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGG GAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAGEST: gi|87156058|gb|DY400847.1|DY400847
genomic: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGGgtaagtcttt ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAG
EST: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGG GAGGGCTCCTAGATTCCGGCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAGEST: gi|71427533|gb|DR808583.1|DR808583
genomic: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGGgtaagtcttt ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAG
EST: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGG GAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAGEST: gi|211216543|gb|FL246888.1|FL246888
genomic: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGGgtaagtcttt ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAG
EST: CTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGG GAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAGEST: gi|22715374|gb|BU197729.1|BU197729
genomic: CTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGGgtaagtcttt ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAG
EST: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGG GAGGGCTCCTAGATTCCGGCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAGEST: gi|86470105|gb|DY236475.1|DY236475
genomic: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGGgtaagtcttt ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAG
EST: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGG GAGGGTTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTATTTTTGAAG
genomic: TACCCTTATAGATCATACGGGGCACCGTATTTCCCCCCATATGGTTATGGgtaagtcttt ... ggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAG
ttacaatgtggatttctagttttcttttctaacataaccttttgcggttttgcagGAGGGCTCCTAGATTCCGCCGCCCTATGCGCTACAGACCTTACTTCTGAAGTACGGGGTAGGGTAATGAAGTTCAATGCAAAACCAGCCCATGGTCACTG
ttttctttt TA-rich tract