1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
gtaatattttgtcccttcctcttggttattgcattagttgtacttaacttattttttggattcagaatgtttattgctgcagctaaaaaagctattgtcttttgacctaaatattggctgcctctgatggatgcgctagttcttttttcgtattgattttgtattggtttttggcagATATGTAGAGCATTGGCTTACATTCATGGTACTATCGGTGTCTGCCACAGAGATATTAAGCCACAAAATCTTCTG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM5G835235_T04 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AGATGCACCAACGCATGCCACTTATTTATGTGAAGCTTTATATGTACCAG ATATGTAGAGCATTGGCTTACATTCATGGTACAATCGGTGTCTGCCACAGAEST: gi|32865481|gb|CF005163.1|CF005163
genomic: AGATGCACCAACGCATGCCACTTATTTATGTGAAGCTTTATATGTACCAGgtaatatttt ... tttttggcagATATGTAGAGCATTGGCTTACATTCATGGTACTATCGGTGTCTGCCACAGA
EST: GCACCAACGCATGCCACTTATTTATGTGAAGCTTTATATGTACCAG ATATGTAGAGCATTGGCTTACATTCATGGGACTATCGGGGTCTGCCACAGAEST: gi|32865499|gb|CF005181.1|CF005181
genomic: GCACCAACGCATGCCACTTATTTATGTGAAGCTTTATATGTACCAGgtaatatttt ... tttttggcagATATGTAGAGCATTGGCTTACATTCATGGTACTATCGGTGTCTGCCACAGA
EST: GCACCAACGCATGCCACTTATTTATGTGAAGCTTTATATGTACCAG ATATGTAGAGCATTGGCTTACATTCATGGTACTATCGGTGTCTGCCACAGAEST: gi|166413835|gb|EG065949.1|EG065949
genomic: GCACCAACGCATGCCACTTATTTATGTGAAGCTTTATATGTACCAGgtaatatttt ... tttttggcagATATGTAGAGCATTGGCTTACATTCATGGTACTATCGGTGTCTGCCACAGA
EST: AGATGCACCAACGCATGCCACTTATTTATGTGAAGCTTTATATGTACCAG ATATGTAGAGCATTGGCTTACATTCEST: gi|211480778|gb|FL342573.1|FL342573
genomic: AGATGCACCAACGCATGCCACTTATTTATGTGAAGCTTTATATGTACCAGgtaatatttt ... tttttggcagATATGTAGAGCATTGGCTTACATTC
EST: AGATGCACCAACGCATGCCACTTATTTATGTGAAGCTTTATATGTACCAG ATATGTAGAGCATTGGCTTACATTCATGGTACTATCGGTGTCTGCCACAGA
genomic: AGATGCACCAACGCATGCCACTTATTTATGTGAAGCTTTATATGTACCAGgtaatatttt ... tttttggcagATATGTAGAGCATTGGCTTACATTCATGGTACTATCGGTGTCTGCCACAGA
tctgatggatgcgctagttcttttttcgtattgattttgtattggtttttggcagATATGTAGAGCATTGGCTTACATTCATGGTACTATCGGTGTCTGCCACAGAGATATTAAGCCACAAAATCTTCTG
tattgat putative branch site (score: 3)
ttttt putative PPT
tattgattttgtatt TA-rich tract