1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
...acctttgcgtattttttatgttgcttaacttgcagtttatgtatgtgatagaacagtctgcagcagtgctcacatcttccatgtgtatttgtttttgcagATGGGTTAATGCAGCACCTTGTGACAGCTGTGGGCCGTGAGACATCCAATGTTGGAATGGGCACCCCACTTACCTCAGAAATCAAATTTGGCGCTTCACG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G173416_T02 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AAGCATGCCTTTCTGCTGCAATTGCTTTTTTGGTTTAAGCAATCATTCAG ATGGGTTAATGCAGCACCTTGTGACAGCTGTGG-CCGTGAGACATCCAATGEST: gi|166439809|gb|EG291901.1|EG291901
genomic: AAGCATGCCTTTCTGCTGCAATTGCTTTTTTGGTTTAAGCAATCATTCAGgtcactgaaa ... gtttttgcagATGGGTTAATGCAGCACCTTGTGACAGCTGTGGGCCGTGAGACATCCAATG
EST: AAGCATGCCTTTCTGCTGCAATTGCTTTTTTGGTTTAAGCAATCATTCAG ATGGGTTAATGCAG
genomic: AAGCATGCCTTTCTGCTGCAATTGCTTTTTTGGTTTAAGCAATCATTCAGgtcactgaaa ... gtttttgcagATGGGTTAATGCAG
tgatagaacagtctgcagcagtgctcacatcttccatgtgtatttgtttttgcagATGGGTTAATGCAGCACCTTGTGACAGCTGTGGGCCGTGAGACATCCAATGTTGGAATGGGCACCCCACTTACCTCAGAAATCAAATTTGGCGCTTCACG
tgctcac putative branch site (score: 2)
tttgttttt putative PPT
tatttgttttt TA-rich tract