1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
gtaattaaccttttttaaacttttgcacatactattttcatctgacccccatctagattatgaataccacttgaatgtgttactgacatgctgctttatcaaagGTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGATGTAGAGAACATCCTTGTTGAAATGGGAACATACTTTCAAGTCCAG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G168681_T02 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCG GTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGATEST: gi|60349036|gb|DN216009.1|DN216009
genomic: TCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCGgtaattaacc ... tttatcaaagGTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGAT
EST: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCG GTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGATEST: gi|60355476|gb|DN222449.1|DN222449
genomic: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCGgtaattaacc ... tttatcaaagGTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGAT
EST: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCG GTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGATEST: gi|74235733|gb|DT643647.1|DT643647
genomic: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCGgtaattaacc ... tttatcaaagGTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGAT
EST: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCG GTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGATEST: gi|67011082|gb|CO439831.1|CO439831
genomic: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCGgtaattaacc ... tttatcaaagGTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGAT
EST: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCG GTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGATEST: gi|31356120|gb|CD440477.1|CD440477
genomic: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCGgtaattaacc ... tttatcaaagGTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGAT
EST: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCG GTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGATEST: gi|31349560|gb|CD433917.1|CD433917
genomic: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCGgtaattaacc ... tttatcaaagGTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGAT
EST: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCG GTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGATEST: gi|32851875|gb|CD991556.1|CD991556
genomic: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCGgtaattaacc ... tttatcaaagGTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGAT
EST: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCG GTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGATEST: gi|31356964|gb|CD441321.1|CD441321
genomic: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCGgtaattaacc ... tttatcaaagGTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGAT
EST: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCG GTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGATEST: gi|31353974|gb|CD438331.1|CD438331
genomic: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCGgtaattaacc ... tttatcaaagGTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGAT
EST: AGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCG GTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGCTCAATTATGGTGATEST: gi|60345209|gb|DN212182.1|DN212182
genomic: AGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCGgtaattaacc ... tttatcaaagGTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGAT
EST: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCG GTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGATEST: gi|24768472|gb|CA403601.1|CA403601
genomic: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCGgtaattaacc ... tttatcaaagGTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGAT
EST: TATTATTCATTTTATCTGCCG GTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGATEST: gi|31356532|gb|CD440889.1|CD440889
genomic: TATTATTCATTTTATCTGCCGgtaattaacc ... tttatcaaagGTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGAT
EST: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCG GTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGATEST: gi|24769591|gb|CA404720.1|CA404720
genomic: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCGgtaattaacc ... tttatcaaagGTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGAT
EST: CTATTATTCATTTTATCTGCCG GTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGATEST: gi|149005405|gb|EE039957.2|EE039957
genomic: CTATTATTCATTTTATCTGCCGgtaattaacc ... tttatcaaagGTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGAT
EST: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCG GTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGATEST: gi|6102050|gb|AW126520.1|AW126520
genomic: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCGgtaattaacc ... tttatcaaagGTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGAT
EST: CGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCG GTTGCATGTGCCCTGCTGCTNTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGATEST: gi|5124143|gb|AI745767.1|AI745767
genomic: CGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCGgtaattaacc ... tttatcaaagGTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGAT
EST: TTTATCTGCCG GTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGCCAATTATGGTGATEST: gi|19351797|gb|BM896329.1|BM896329
genomic: TTTATCTGCCGgtaattaacc ... tttatcaaagGTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGAT
EST: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCG GTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGEST: gi|19351126|gb|BM895658.1|BM895658
genomic: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCGgtaattaacc ... tttatcaaagGTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATG
EST: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCG GTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGEST: gi|211405627|gb|FL391567.1|FL391567
genomic: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCGgtaattaacc ... tttatcaaagGTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATG
EST: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCG GTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGATEST: gi|31356011|gb|CD440368.1|CD440368
genomic: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCGgtaattaacc ... tttatcaaagGTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGAT
EST: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCG GTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGATEST: gi|9254158|gb|BE344626.1|BE344626
genomic: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCGgtaattaacc ... tttatcaaagGTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGAT
EST: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCG GCTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAEST: gi|9254637|gb|BE345105.1|BE345105
genomic: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCGgtaattaacc ... tttatcaaagGTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGA
EST: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCG GTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACATTTTTGTTGATEST: gi|4753535|gb|AI657445.1|AI657445
genomic: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCGgtaattaacc ... tttatcaaagGTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGAT
EST: ATTATTCATTTTATCTGCCG GTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGATEST: gi|71323848|gb|DR798601.1|DR798601
genomic: ATTATTCATTTTATCTGCCGgtaattaacc ... tttatcaaagGTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGAT
EST: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCG GTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGAT
genomic: ACGGTCGAATTGTTCAATACAAGACAGCCTATTATTCATTTTATCTGCCGgtaattaacc ... tttatcaaagGTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGAT
catctagattatgaataccacttgaatgtgttactgacatgctgctttatcaaagGTTGCATGTGCCCTGCTGCTCTCTGGCGAGAATTTGGACAATTATGGTGATGTAGAGAACATCCTTGTTGAAATGGGAACATACTTTCAAGTCCAG
tactgac putative branch site (score: 1)
ctgcttt putative PPT
attatgaata TA-rich tract