Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...acaaggccttagtgagttgaagcataactttgcacatgcacaatctgttattatctttcattgtgggcttagtttgttttatctggttcacttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATCTGCTAGAATGGAGTCTGGAACTGGCAACGGTGATAGTGAAGTGCAGCGT

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G137528_T01
intron # 5
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G137528_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 5
lower sequence: LOC_Os02g11050.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 5
--------------------acaaggcct--tagtg-agttgaagcataact---ttgca-catgcacaat----ctgttattatctttcattgtgggcttagtttgttttatctggttcacttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATCTGCTAGAATGGAGTCTGGAACTGGCAACGGTGATAGTGAAGTGCAGCGT
                       ||  ||  || |  |||  |||||| | |   |||||   || || ||    ||     |    |   ||||  |  |||  |   || | ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| 
gtaaactgagcaaaaataccctgagttcttctattatagtgaaagcattattggcttgcaatctgaactatagttctacatatgcactctgttgtcagtgtaggcttaattgtttggttaacatattacagGGAACATGCACCATCCATTATTTTCATGGATGAAATAGACTCCATTGGATCTGCTAGGATGGAGTCTGGAACTGGCAACGGTGACAGTGAAGTCCAGCGA

upper sequence: GRMZM2G137528_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 5
lower sequence: GLYMA07G00420.1 (Glycine max), 3'ss of exon 5
acaaggccttagtgagttgaagcataactttgcacatgcacaatctgttattatctttcattgtgggcttagtttgttttatctggttcacttatt--gcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATCTGCTAGAATGGAGTCTGGAACTGGCAACGGTGATAGTGAAGTGCAGCGT
  ||    ||  |   || |     |  |||           | |  |   || |  | ||| |      |  || |  |       |    |  |   |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||  ||| ||||||||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||
--aactttttgattcattaattttcatgtttatgttatttggagccttgcctaaccattattatatatgaatattatcatggaacacttgtcttcttcacagGGAACATGCTCCATCAATTATCTTCATGGATGAAATTGACAGTATTGGATCTGCTCGGATGGAATCTGGAAGTGGCAACGGTGATAGTGAGGTACAGCGT

upper sequence: GRMZM2G137528_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 5
lower sequence: GLYMA08G24000.1 (Glycine max), 3'ss of exon 5
acaaggccttagtgagttgaagcataactttgcac---atgcacaatctgttattatctttcattgtgggcttagtttgttttatctggttcacttattgc--agGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATCTGCTAGAATGGAGTCTGGAACTGGCAACGGTGATAGTGAAGTGCAGCGT
       ||||     ||||  ||| | ||| ||    ||    |  || |   || |  | ||| |      |  || || |       |    |  | |  ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||  ||| ||||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||
----ttgcttaactttttgattcattaattttcatgttatttggagact-tgcctaaccattattatatatgaatattattatggaacacttgtcttcttcccagGGAACATGCTCCATCAATTATCTTCATGGACGAAATTGACAGTATTGGATCTGCTCGGATGGAATCTGGAAGTGGCAATGGTGATAGTGAGGTACAGCGT

upper sequence: GRMZM2G137528_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 5
lower sequence: Vv09s0002g05800.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 5
acaaggcct-tagtgagttgaagcataactttgcacatgcacaatctgttattatctttcattgtgggcttagtttgttttatctggttcac--ttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATCTGCTAGAATGGAGTCTGGAACTGGCAACGGTGATAGTGAAGTGCAGCGT
  |  |||  |  | |     | || ||    | | |   | ||| |    || | | |   |||  | |||   | |  | | ||    |   || || |||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| | ||||| || |||| |||||| |||||||||||||| ||||| 
gtagagcccatcatcaacaataacaaaaa---ggaaaaaaaaaatgttgctttctttgttgctgtttgtttaaactttactttttgaactatctttcttacagGGAGCATGCACCATCAATAATCTTTATGGATGAGATTGACAGTATTGGATCTGCTCGTATGGAATCAGGAAGTGGCAATGGTGATAGTGAAGTCCAGCGG

upper sequence: GRMZM2G137528_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 5
lower sequence: Vv04s0008g04690.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 5
---------------------------------------------------------------------------------------------acaaggccttagt---gagttgaagcataactttgcacatgcacaatctgttatta-----tctttcattgtgggcttagtttgttttatctggttcacttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATCTGCTAGAATGGAGTCTGGAACTGGCAACGGTGATAGTGAAGTGCAGCGT
                                                                                              |  ||   | ||   ||||   |   |     ||         | | |||| | |      |||| ||  ||  ||||   | | || |||| | |  ||||| |||||| ||||| ||||| || || || |||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| 
gtttgtttaatatctttagtggaaaccatgacttgtgatacacctagaggatttatttttcactcataagataatattttatatgttacctctcctgggtaattgtttagagtcacatttttttcctgggttattgaattttgttttaaatctcccttttatcttgtccttatggtctcttctctgctgc-tttattacagGGAGCATGCTCCATCAATCATCTTCATGGATGAAATTGACAGTATTGGATCTGCTCGAATGGAATCTGGAACTGGAAATGGTGATAGTGAAGTGCAGCGA

upper sequence: GRMZM2G137528_T01 (Zea mays), 3'ss of exon 5
lower sequence: PP1S245_17V6.1 (Physcomitrella patens), 3'ss of exon 5
-acaaggccttagtgagttgaagcataactttgcacatgcacaatctgttattatctttcattgtgggcttagtttgttttatctggttcacttattgc-agGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATCTGCTAGAATGGAGTCTGGAACTGGCAACGGTGATAGTGAAGTGCAGCGT
 |  | |  ||  ||| |   | |  |||    |   |    |    |  | |   | |||     |  | || |  |   |  |  ||    ||| |  ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||   ||| ||||| ||| |  |||||||||| | |||||| || ||||||||||| ||||| 
taagatgtgtttttgattgccatc--aacggaacttgtctctacctggaaacttcatgtcaagaacgtataagatgttaacaagttatttttgtatggttagGGAACATGCACCATCAATCATCTTCATGGATGAAATTGATAGTATTGGATCAGCTCGTGTGGAGTCTGGGAATGGCAATGGAGATAGTGAAGTTCAGCGG

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|211436662|gb|FL284171.1|FL284171
EST:     TATATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: TATATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|32941875|gb|CF046694.1|CF046694
EST:     TATATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATAAAACATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: TATATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|21391089|gb|BQ529138.1|BQ529138
EST:     AACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCACCATCCATTATA-TTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: AACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|6989624|gb|AW447837.1|AW447837
EST:     TATATTGGTGAAGGCTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCACCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: TATATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|211434073|gb|FL284166.1|FL284166
EST:     ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|211434072|gb|FL284165.1|FL284165
EST:     ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|211436664|gb|FL284173.1|FL284173
EST:     TTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: TTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|211436658|gb|FL284167.1|FL284167
EST:     ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|211487779|gb|FL049400.1|FL049400
EST:     ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|211434071|gb|FL284164.1|FL284164
EST:     ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|211436667|gb|FL284176.1|FL284176
EST:     ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|19350715|gb|BM895247.1|BM895247
EST:     TACATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: TATATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|211436671|gb|FL284180.1|FL284180
EST:     ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|211436666|gb|FL284175.1|FL284175
EST:     ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|211070411|gb|FL012986.1|FL012986
EST:     TATATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: TATATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|67024358|gb|CO453107.1|CO453107
EST:     TATATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: TATATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|211434065|gb|FL284158.1|FL284158
EST:     ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|211436670|gb|FL284179.1|FL284179
EST:     ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|211436659|gb|FL284168.1|FL284168
EST:     ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|211436668|gb|FL284177.1|FL284177
EST:     ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|19350732|gb|BM895264.1|BM895264
EST:     TACATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGAGAT
genomic: TATATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCG-GAT
EST: gi|211436663|gb|FL284172.1|FL284172
EST:     ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|211434068|gb|FL284161.1|FL284161
EST:     ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|4776454|gb|AI665457.1|AI665457
EST:     TTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCACCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: TTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|60395128|gb|DN227997.1|DN227997
EST:     TATATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: TATATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|60352642|gb|DN219615.1|DN219615
EST:     TATATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: TATATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|32866277|gb|CF005959.1|CF005959
EST:     TATATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: TATATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|211434062|gb|FL284155.1|FL284155
EST:     ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|211436669|gb|FL284178.1|FL284178
EST:     ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|211431471|gb|FL284150.1|FL284150
EST:     ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|211431470|gb|FL284149.1|FL284149
EST:     ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|211436660|gb|FL284169.1|FL284169
EST:     ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|211434059|gb|FL284152.1|FL284152
EST:     ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|211436661|gb|FL284170.1|FL284170
EST:     ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|32933070|gb|CF037882.1|CF037882
EST:     TATATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: TATATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|211434066|gb|FL284159.1|FL284159
EST:     ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|211487778|gb|FL049399.1|FL049399
EST:     ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCCTATCGGAT
genomic: ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTC-TATCGGAT
EST: gi|211434064|gb|FL284157.1|FL284157
EST:     ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|213167947|gb|FM194936.1|FM194936
EST:     -ATATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: TATATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
EST: gi|211434070|gb|FL284163.1|FL284163
EST:     ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAG                         GGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC
genomic: ATTGGTGAAGGTTCCCGGATGGTTCGGGAACTCTTTGTTATGGCCAGgtaggctgag ... cttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATC


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tgttattatctttcattgtgggcttagtttgttttatctggttcacttattgcagGGAACATGCGCCATCCATTATATTTATGGATGAAATTGACTCTATCGGATCTGCTAGAATGGAGTCTGGAACTGGCAACGGTGATAGTGAAGTGCAGCGT
                                         ttcactt  CT-rich tract
                       ttagtttgttttat  TA-rich tract