1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
gtatgctttttaacaattagtttctcatgccgtatatcatacttttggaaatcagcatgtagcatgctaatggctatgcttatctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCTTGTGCTGTGCTTG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G130440_T01 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CGACCAAACCATATGATNGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCEST: gi|211391225|gb|FK985220.1|FK985220
genomic: CGACCAAACCATATGAT-GATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCC
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCTEST: gi|211393849|gb|FK985231.1|FK985231
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCT
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAAEST: gi|149000688|gb|EE037899.2|EE037899
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAA
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCTEST: gi|211522447|gb|FK985268.1|FK985268
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCT
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAA GTGTGGAATCCEST: gi|211396467|gb|FK985242.1|FK985242
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCC
EST: RCGACCAAGCCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCEST: gi|211380677|gb|FK985162.1|FK985162
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCC
EST: ACGACCAAAC-ATATGATGATGGAG GTGTGGA-TCCCCTTGGAGNNTGTGG-TGTTATA-CGGCATTTAATTTCCCEST: gi|211267398|gb|FK985117.1|FK985117
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGT-TGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCC
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCTEST: gi|211380667|gb|FK985152.1|FK985152
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCT
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAC GTGTGGAATCCCCTTGGAGCTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCTEST: gi|149106392|gb|EE292114.2|EE292114
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCT
EST: ACGACCAGCCCATATGATGATGGAG GGGTGGA-TCCCCTTGGAGEST: gi|211393851|gb|FK985233.1|FK985233
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAG
EST: CGACCAAACCATATGATNGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCEST: gi|211267399|gb|FK985118.1|FK985118
genomic: CGACCAAACCATATGAT-GATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCC
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTACTTTCCCTEST: gi|211267391|gb|FK985110.1|FK985110
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCT
EST: CGACCAAACCATATGATGGATGGAG GTGTGGGATCCCCTTGGNNAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTTATTTCEST: gi|211385938|gb|FK985180.1|FK985180
genomic: CGACCAAACCATATGATG-ATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGG--AGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTC
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGANGT-GTGGGTGGTATAACGGCATTTAATTTCCCEST: gi|211380674|gb|FK985159.1|FK985159
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGA-GTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCC
EST: CGACCAAACCATNATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCEST: gi|211262521|gb|FK985084.1|FK985084
genomic: CGACCAAACCAT-ATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGG-AGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCC
EST: CGACCAAACCATNATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCEST: gi|211391219|gb|FK985214.1|FK985214
genomic: CGACCAAACCAT-ATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGG-AGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCC
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGT-ATAACGGGATTTAATTTEST: gi|211269835|gb|FK985128.1|FK985128
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTT
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATA-CGGCATTTAATTTCCCTEST: gi|211264959|gb|FK985097.1|FK985097
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCT
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCEST: gi|149072859|gb|EE161112.2|EE161112
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCC
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCTEST: gi|211388576|gb|FK985197.1|FK985197
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCT
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGANGT-GTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCEST: gi|211383313|gb|FK985176.1|FK985176
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGA-GTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCC
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCTEST: gi|78180622|gb|DV550950.1|DV550950
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCT
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCTEST: gi|211396465|gb|FK985240.1|FK985240
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCT
EST: ACGACCAAAC-ATATGATGATGGAG GGGTGGA-TCCCCTTGGGAGTGGTGG-TGTTATAACGGCATTTAATTTCCCEST: gi|7844452|gb|AW787674.1|AW787674
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGG-AGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCC
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCTEST: gi|211380665|gb|FK985150.1|FK985150
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCT
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGEST: gi|211391213|gb|FK985208.1|FK985208
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTG
EST: CGACCAAACCANTATGATGATGGAG GTGTGGA-TCCCCTTGGNAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCEST: gi|211519446|gb|FK985264.1|FK985264
genomic: CGACCAAACCA-TATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGG-AGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCC
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCTEST: gi|211388582|gb|FK985203.1|FK985203
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCT
EST: CGACCAAACCATATNGATGATGGAG GTGTGGA-TCCCCTTGGAGTTGTGGEST: gi|211519449|gb|FK985267.1|FK985267
genomic: CGACCAAACCATAT-GATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGG
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCEST: gi|211267387|gb|FK985106.1|FK985106
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCC
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGEST: gi|211269838|gb|FK985131.1|FK985131
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGG
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCTEST: gi|211262519|gb|FK985082.1|FK985082
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCT
EST: ACGACCAA-CCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCCTTGGAGTTGTGGGTGCTATAAEST: gi|211396468|gb|FK985243.1|FK985243
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCC-TTGGAGTTGTGGGTGTTATAA
EST: ACGANCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTEST: gi|211378025|gb|FK985147.1|FK985147
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGT
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCTEST: gi|211262517|gb|FK985080.1|FK985080
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCT
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCEST: gi|211393850|gb|FK985232.1|FK985232
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCC
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAEST: gi|211267394|gb|FK985113.1|FK985113
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTA
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGAGEST: gi|211388581|gb|FK985202.1|FK985202
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAG
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATEST: gi|211267389|gb|FK985108.1|FK985108
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTAT
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCTEST: gi|211393854|gb|FK985236.1|FK985236
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCT
EST: CGACCAAACCATATGATTATGGGAG GTGTGGA-TCCCCTTGEST: gi|211391227|gb|FK985222.1|FK985222
genomic: CGACCAAACCATATGATGATGG-AGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTG
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCTEST: gi|211383309|gb|FK985172.1|FK985172
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCT
EST: CGACCAAACCATATGATNGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGNNAGT-GTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCEST: gi|211262524|gb|FK985087.1|FK985087
genomic: CGACCAAACCATATGAT-GATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGG-AGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCC
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCC-TTGGAGEST: gi|211388574|gb|FK985195.1|FK985195
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAG
EST: CGACCAAACCATATGATNGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGNAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCEST: gi|211393847|gb|FK985229.1|FK985229
genomic: CGACCAAACCATATGAT-GATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGG-AGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCC
EST: ACGACCAAAC-ATATGATGATGGAG GTGTGGA-TCCCCTTGGAGEST: gi|211380669|gb|FK985154.1|FK985154
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAG
EST: CGACCAAACCATATNGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCEST: gi|7844027|gb|AW787230.1|AW787230
genomic: CGACCAAACCATAT-GATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGG-AGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCC
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCTEST: gi|211396477|gb|FK985252.1|FK985252
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCT
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCTEST: gi|7844028|gb|AW787231.1|AW787231
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCT
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCTEST: gi|211269832|gb|FK985125.1|FK985125
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCT
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCTEST: gi|211383306|gb|FK985169.1|FK985169
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCT
EST: ACGACCAAACCATATGATTATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTAEST: gi|211519438|gb|FK985256.1|FK985256
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTA
EST: ACGACCAAACCATATGATGATGGAG GTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCT
genomic: ACGACCAAACCATATGATGATGGAGgtatgctttt ... atctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCT
tcatacttttggaaatcagcatgtagcatgctaatggctatgcttatctgagtagGTGTGGAATCCCCTTGGAGTTGTGGGTGTTATAACGGCATTTAATTTCCCTTGTGCTGTGCTTG
tgctaat putative branch site (score: 523)
cttatct putative PPT