1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
...ctctcttagccagtatgaatagtagtcgcacaaatgttcacaattcctagcaccagtttgaagagcaatctgacaaatattcacattttttcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCGAGGTGAGGGAACTCGTGGAGAAGGCCTACTCTAGAGCAAGGCAGATAA
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G126361_T03 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|16920675|gb|BM074773.1|BM074773
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|78027000|gb|DV495387.1|DV495387
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|111190440|gb|EE288576.1|EE288576
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GTTGCGATCGGGGGACCGGGGT-GAAACCCTTTCTTGGGGGCACCAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|149074934|gb|EE163390.2|EE163390
genomic: GTTGCGATCGGGGGACC-GGGTGGAAACCCTTTCTT-GGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|61236821|gb|DN586545.1|DN586545
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCGACTGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|116822651|gb|EC866067.1|EC866067
genomic: GGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCGACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|24934350|gb|CA452568.1|CA452568
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|32832563|gb|CD972241.1|CD972241
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|33090896|gb|CF050890.1|CF050890
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|116824030|gb|EC867613.1|EC867613
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCC-AGTTGC-ATCGGGGGA-CGGGTGGAAA-CCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|18166249|gb|BM336088.1|BM336088
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|16378106|gb|BI992281.1|BI992281
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCCTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|18162277|gb|BM332116.1|BM332116
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|13198172|gb|BG354188.1|BG354188
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTEST: gi|28911358|gb|BM340383.2|BM340383
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTT
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|28911249|gb|BM336639.2|BM336639
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|71759679|gb|DR957616.1|DR957616
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTTTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|18164694|gb|BM334533.1|BM334533
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|18171948|gb|BM347336.1|BM347336
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|116824480|gb|EC868100.1|EC868100
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCAATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|13149600|gb|BG319922.1|BG319922
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|211089719|gb|FL375369.1|FL375369
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|33092826|gb|CF052820.1|CF052820
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|18176274|gb|BM351288.1|BM351288
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|33095834|gb|CF055828.1|CF055828
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGGAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|71299675|gb|DR785845.1|DR785845
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|33096758|gb|CF056732.1|CF056732
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGGAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|24934378|gb|CA452596.1|CA452596
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|211197976|gb|FL446528.1|FL446528
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|32916795|gb|CF021607.1|CF021607
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|18166703|gb|BM336542.1|BM336542
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|13198170|gb|BG354187.1|BG354187
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|86470277|gb|DY236647.1|DY236647
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTTTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|32916856|gb|CF021668.1|CF021668
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: CCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGTAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|18164226|gb|BM334065.1|BM334065
genomic: CCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCC-TTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|32849001|gb|CD988682.1|CD988682
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAGGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|32848890|gb|CD988571.1|CD988571
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|110216144|gb|EC898042.1|EC898042
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGATTACTTTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|110208211|gb|EC890108.1|EC890108
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGGCCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTTTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|18165075|gb|BM334866.1|BM334866
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|148972635|gb|EE023595.2|EE023595
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: TTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTTTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACACCEST: gi|148990798|gb|EE032214.2|EE032214
genomic: TTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTTTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|28911275|gb|BM338697.2|BM338697
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|32844659|gb|CD984340.1|CD984340
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|32849008|gb|CD988689.1|CD988689
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAGGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|71761686|gb|DR959623.1|DR959623
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|9742814|gb|BE518962.1|BE518962
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|18168637|gb|BM338477.1|BM338477
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGGAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|18172028|gb|BM347416.1|BM347416
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|18175217|gb|BM350605.1|BM350605
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|28911216|gb|BM335452.2|BM335452
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|18165923|gb|BM335762.1|BM335762
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|17931504|gb|BM268464.1|BM268464
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|71768955|gb|DR966892.1|DR966892
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTTTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|149096865|gb|EE182659.2|EE182659
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTTTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|78119172|gb|DV537556.1|DV537556
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|18174508|gb|BM349896.1|BM349896
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|33094055|gb|CF054049.1|CF054049
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|32845000|gb|CD984681.1|CD984681
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|18169286|gb|BM339126.1|BM339126
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|149062825|gb|EE157543.2|EE157543
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTTTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|149082728|gb|EE171948.2|EE171948
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGAGTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|110220877|gb|EC902775.1|EC902775
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|18163505|gb|BM333344.1|BM333344
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCEST: gi|18172044|gb|BM347432.1|BM347432
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
EST: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAG ATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
genomic: GCCAAGTTGCGATCGGGGGACCGGGTGGAAACCCTTTCTTGGGGCAACAGgtatgctgct ... tcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCC
cctagcaccagtttgaagagcaatctgacaaatattcacattttttcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCGAGGTGAGGGAACTCGTGGAGAAGGCCTACTCTAGAGCAAGGCAGATAA
atctgac putative branch site (score: 402)
ttcacattttttcccc putative PPT
aaatattcacattttt TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ctctcttagccagtatgaatagtagtcgcacaaatgttcacaattcctagcaccagtttgaagagcaatctgacaaatattcacattttttcccccacagATGTCAAGCCAGAAGGACTACTCTATGGCAACAGCGGATGTTGTGGACGCCGAGGTGAGGGAACTCGTGGAGAAGGCCTACTCTAGAGCAAGGCAGATAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GTGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGAGCA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGCAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCAGAT