Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtaagttgtaggctgggaaacttggttcctgtattgttgaacatttactaagttacaatattaaccctttttgtgtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAACACACACCTTGCTTCAAACACATACCTTGTTGGGCATGCTGTTACTCTAG

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G122871_T03
intron # 5
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G122871_T03 (Zea mays), 3'ss of exon 5
lower sequence: LOC_Os06g37440.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 6
gtaagttgtaggctgggaaacttggttcctgtattgttgaacatttactaagttacaatattaaccctttttgtgtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAACACACACCTTGCTTCAAACACATACCTTGTTGGGCATGCTGTTACTCTAG
|||||||| |   | ||    ||   | || |  | |||| | ||  | ||  ||| |||   | |    |  |   | | |||  |||||||   |||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||
gtaagttgaataattggtgtatttccttctct-ctattgagcgttggc-aatctacgata---atctaaatattacatatgcagCTTGAGGAATTTGCTATTACTTCATTGAAGAGGTCATTGGGTGCTCTGAACACACACCTTGCTTCAAACACATACCTTGTTGGGCATTCAGTTACTCTAG
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|211426493|gb|FK950559.1|FK950559
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTAC-TCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGA
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGA
EST: gi|31558780|gb|CD527992.1|CD527992
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCTCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211426494|gb|FK950560.1|FK950560
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTAC-TCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCAT
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCAT
EST: gi|31350268|gb|CD434625.1|CD434625
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ATTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|33093296|gb|CF053290.1|CF053290
EST:     ACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: ACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211066055|gb|FK950643.1|FK950643
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTCAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|33094921|gb|CF054915.1|CF054915
EST:     GGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: GGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|6636966|gb|AW261238.1|AW261238
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTCAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|60352155|gb|DN219128.1|DN219128
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211197062|gb|FK950519.1|FK950519
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|32906833|gb|CF011646.1|CF011646
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211439480|gb|FK950633.1|FK950633
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTAC-TCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAAC
EST: gi|211431692|gb|FK950595.1|FK950595
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTAC-TCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATT
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATT
EST: gi|211431686|gb|FK950589.1|FK950589
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGGAAACAG
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGG-AAACAG
EST: gi|31362772|gb|CD447129.1|CD447129
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ATTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211068802|gb|FK950660.1|FK950660
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTAC-TCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTG
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTG
EST: gi|211439489|gb|FK950642.1|FK950642
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTAC-TCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTT
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTT
EST: gi|211071547|gb|FK950684.1|FK950684
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAA
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATT-GAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAA
EST: gi|13316078|gb|BG410525.1|BG410525
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211423883|gb|FK950550.1|FK950550
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAA
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTT-CTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAA
EST: gi|211439481|gb|FK950634.1|FK950634
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTCAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|31354484|gb|CD438841.1|CD438841
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ATTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|28987514|gb|CB351671.1|CB351671
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|194716822|gb|FK933981.1|FK933981
EST:     GTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: GTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211431690|gb|FK950593.1|FK950593
EST:     TGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCGTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGA
genomic: TGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCC-TTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGA
EST: gi|32830692|gb|CD970370.1|CD970370
EST:     ACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: ACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211429090|gb|FK950582.1|FK950582
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCNAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211423878|gb|FK950545.1|FK950545
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTAC-TCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTC
EST: gi|31354558|gb|CD438915.1|CD438915
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ATTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|33100711|gb|CF060671.1|CF060671
EST:     GGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTACCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: GGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211068803|gb|FK950661.1|FK950661
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTAC-TCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTA
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTA
EST: gi|31354335|gb|CD438692.1|CD438692
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ATTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211068804|gb|FK950662.1|FK950662
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211436878|gb|FK950613.1|FK950613
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211066062|gb|FK950650.1|FK950650
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTCAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|213179581|gb|FM185295.1|FM185295
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|32916089|gb|CF020901.1|CF020901
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|32866655|gb|CF006337.1|CF006337
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211439475|gb|FK950628.1|FK950628
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTAC-TCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAG
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAG
EST: gi|211066067|gb|FK950655.1|FK950655
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTAC-TCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGA
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGA
EST: gi|211436890|gb|FK950625.1|FK950625
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTAC-TCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCA
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCA
EST: gi|60358967|gb|DN225940.1|DN225940
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|31363512|gb|CD447869.1|CD447869
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ATTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211429083|gb|FK950575.1|FK950575
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGARGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211071545|gb|FK950682.1|FK950682
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAA-CAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCG
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCG
EST: gi|211071544|gb|FK950681.1|FK950681
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTAC-TCCCTTATGTTAGCACA                         ACTTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGG
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACT-GAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGG
EST: gi|211426498|gb|FK950564.1|FK950564
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211423879|gb|FK950546.1|FK950546
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|31356172|gb|CD440529.1|CD440529
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ATTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211439486|gb|FK950639.1|FK950639
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGG
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGG
EST: gi|31612138|gb|CD568760.1|CD568760
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211068809|gb|FK950667.1|FK950667
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTCAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCT
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCT
EST: gi|211431689|gb|FK950592.1|FK950592
EST:     TGCATGGTACTTGTATCCAAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTCAGCACA                         ACTGAGGAAACA
genomic: TGCATGGTACTTGTATCCAA-GGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACA
EST: gi|211066064|gb|FK950652.1|FK950652
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|32826305|gb|CD965983.1|CD965983
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|33094929|gb|CF054923.1|CF054923
EST:     GGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: GGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211071539|gb|FK950676.1|FK950676
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAA-CAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCT
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCT
EST: gi|29946823|gb|CB816343.1|CB816343
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211431691|gb|FK950594.1|FK950594
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTAC-TCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTG
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTG
EST: gi|31349012|gb|CD433369.1|CD433369
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ATTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|32935200|gb|CF040012.1|CF040012
EST:     GGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: GGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|60396158|gb|DN229027.1|DN229027
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|5268440|gb|AI770404.1|AI770404
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211421276|gb|FK950529.1|FK950529
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTTCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCANTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCCTGAA
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTC-TGAA
EST: gi|71420134|gb|DR805027.1|DR805027
EST:     TTGCATGGTACT-GTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|33101209|gb|CF061169.1|CF061169
EST:     GGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: GGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|6952635|gb|AW424703.1|AW424703
EST:     TTGCATGGTATTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTCAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAG
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAG
EST: gi|211423880|gb|FK950547.1|FK950547
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGNGTACCTCCCTTATGTCAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|31354276|gb|CD438633.1|CD438633
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ATTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|60355511|gb|DN222484.1|DN222484
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|13316077|gb|BG410524.1|BG410524
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGG
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGG
EST: gi|32865015|gb|CF004697.1|CF004697
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211068807|gb|FK950665.1|FK950665
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTAC-TCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATT
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATT
EST: gi|211436881|gb|FK950616.1|FK950616
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTAC-TCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|32908894|gb|CF013707.1|CF013707
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|20803260|gb|BQ294310.1|BQ294310
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211429079|gb|FK950571.1|FK950571
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTCAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|22935743|gb|BU572018.1|BU572018
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|67040352|gb|CO466607.1|CO466607
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211439485|gb|FK950638.1|FK950638
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTAC-TCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGGAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTT
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTT
EST: gi|211426499|gb|FK950565.1|FK950565
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTCAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTNGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAA
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATT-GAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAA
EST: gi|211431694|gb|FK950597.1|FK950597
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTAC-TCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTG
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTG
EST: gi|32914735|gb|CF019547.1|CF019547
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAAC
EST: gi|211434284|gb|FK950601.1|FK950601
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTCAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211426497|gb|FK950563.1|FK950563
EST:     GCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCCTTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTG
genomic: GCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCC-TT-ATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTG
EST: gi|211434289|gb|FK950606.1|FK950606
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTAC-TCCCTTATGTTAGCACA                         ACTKAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTT
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTT
EST: gi|67041592|gb|CO467847.1|CO467847
EST:     TTGCATGGTATTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTCAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211423872|gb|FK950539.1|FK950539
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTAC-TCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATT
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATT
EST: gi|211439478|gb|FK950631.1|FK950631
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTAC-TCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGA
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGA
EST: gi|31364273|gb|CD448628.1|CD448628
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ATTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|28910541|gb|CB331490.1|CB331490
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGGGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|32846410|gb|CD986091.1|CD986091
EST:     TACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGGAC
genomic: TACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211423873|gb|FK950540.1|FK950540
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTCAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|31356083|gb|CD440440.1|CD440440
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ATTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211421275|gb|FK950528.1|FK950528
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211429080|gb|FK950572.1|FK950572
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTAC-TCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTC
EST: gi|211434294|gb|FK950611.1|FK950611
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTCAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211431684|gb|FK950587.1|FK950587
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211068805|gb|FK950663.1|FK950663
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTCAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTC
EST: gi|31360565|gb|CD444922.1|CD444922
EST:     TTGCATGGGACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ATTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211426501|gb|FK950567.1|FK950567
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACYTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTT
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTT
EST: gi|5566845|gb|AI881756.1|AI881756
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACA
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACA
EST: gi|211434292|gb|FK950609.1|FK950609
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCMAAGGCTTGGGTAC-TCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGTGGAAACAGCTATTTCTTCATTG
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTG
EST: gi|211431693|gb|FK950596.1|FK950596
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTCAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211429088|gb|FK950580.1|FK950580
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211436880|gb|FK950615.1|FK950615
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|31355184|gb|CD439541.1|CD439541
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ATTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211439476|gb|FK950629.1|FK950629
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTG
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTG
EST: gi|211439484|gb|FK950637.1|FK950637
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTG
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTG
EST: gi|22472651|gb|BU037131.1|BU037131
EST:     GCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
genomic: GCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAAC
EST: gi|211426490|gb|FK950556.1|FK950556
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTCAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGA
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGA
EST: gi|211423882|gb|FK950549.1|FK950549
EST:     TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTCAGCACA                         ACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCG
genomic: TTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCG

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 4 RNA-Seq libraries.


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 1190

CCACGTTGAGCAATGGATGGATTTTGCCGCAACAGAAGTTGATCCTGGTGTTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAACACACACCTTGCTTCAAACACATACCTTGTTGGGCATGCTGTTACTCTAG


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 798

CCACGTTGAGCAATGGATGGATTTTGCCGCAACAGAAGTTGATCCTGGTGTTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAACACACACCTTGCTTCAAACACATACCTTGTTGGGCATGCTGTTACTCTAG


Block sizes: 49 (upstream exon), 49 (downstream exon)
Score: 1031

CCACGTTGAGCAATGGATGGATTTTGCCGCAACAGAAGTTGATCCTGGTGTTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAACACACACCTTGCTTCAAACACATACCTTGTTGGGCATGCTGTTACTCTAG


Block sizes: 48 (upstream exon), 48 (downstream exon)
Score: 556

CCACGTTGAGCAATGGATGGATTTTGCCGCAACAGAAGTTGATCCTGGTGTTGCATGGTACTTGTATCCAAGGCTTGGGTACCTCCCTTATGTTAGCACAgtaagttgta ... gtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAACACACACCTTGCTTCAAACACATACCTTGTTGGGCATGCTGTTACTCTAG




 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tgtattgttgaacatttactaagttacaatattaaccctttttgtgtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAACACACACCTTGCTTCAAACACATACCTTGTTGGGCATGCTGTTACTCTAG
                             tattaac  putative branch site (score: 556)
             atttactaagttacaa  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
gtaagttgtaggctgggaaacttggttcctgtattgttgaacatttactaagttacaatattaaccctttttgtgtgtgtacagACTGAGGAAACAGCTATTTCTTCATTGAAGAGGTCGCTTGGTGCTCTGAACACACACCTTGCTTCAAACACATACCTTGTTGGGCATGCTGTTACTCTAG

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  ATGCTG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GCTGTT