Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtaagtcagtctaaagatatatctggtcatgttattaacgtgtttcgactttctgtgttttcccgaaagaaggacacacaacatagaatctctagtttcacatgatatagaactggaaataccagattatacttatatatgtatacaatttgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGCGTAAAGCACTGGTTTACATTCAATGAGCCAAGGATAGTAGCGCTACTT

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G118003_T02
intron # 5
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G118003_T02 (Zea mays), 3'ss of exon 5
lower sequence: LOC_Os03g49600.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 5
gtaagtcagtctaaagatatatctggtcatgttattaacgtgtttcgactttctgtgttttcccgaaagaaggacacacaacatagaatctctagtttcacatgatatagaactggaaataccagattatacttatatatgtatacaatttgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGCGTAAAGCACTGGTTTACATTCAATGAGCCAAGGATAGTAGCGCTACTT
                                                       |||| ||     ||    |  ||  |    | |||||| |  ||||  | | || || |   | |   |  |     |||| |    |||| | ||||| ||||||||  | || || || || || ||||||||||| |||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||
------------------------------------------------------ctgttgtct----agctaaatgcagcatcctgtatctctggcatcactagctgtataagtaacactctgaagtctggattatcttc--atactacttgttctgtagGGATCTATTCACGGAGTACGCGGACTTCTGTTTCAAGACCTTTGGCAATCGTGTCAAGCACTGGTTTACATTTAATGAGCCAAGGATAGTAGCACTTCTT
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|32848755|gb|CD988436.1|CD988436
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|211322178|gb|FK979475.1|FK979475
EST:     CTCTTGCGCTTGAGAAGAA-TATGGAAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTA-GACC
genomic: CTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGA-GGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACC
EST: gi|32928641|gb|CF033453.1|CF033453
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|6826935|gb|AW330578.1|AW330578
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|26558653|gb|CA830888.1|CA830888
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|109179241|gb|EC379886.1|EC379886
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|211192948|gb|FK979444.1|FK979444
EST:     CTCTTGCGCTTGAGAAGATATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATC
genomic: CTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAA-GATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATC
EST: gi|211192942|gb|FK979438.1|FK979438
EST:     CTCTTGCGCTTGAGA-GAAATATGGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTAC
genomic: CTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGG-AGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTAC
EST: gi|60397967|gb|DN230783.1|DN230783
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|211192947|gb|FK979443.1|FK979443
EST:     CCTCTTGCGCTTGANAAGAAATATGGAGGGTGGTTTAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTRTTTTAAGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|148934074|gb|EC878088.2|EC878088
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTT
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTT
EST: gi|149096066|gb|EE181748.2|EE181748
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|67024539|gb|CO453288.1|CO453288
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|211197749|gb|FK979464.1|FK979464
EST:     CTCTTGCGCTTGAGA-GAAATATGGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTT-AAGAACTACGGCGATCG
genomic: CTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGG-AGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|71331060|gb|DR802360.1|DR802360
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|148969028|gb|EE019736.2|EE019736
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|32929351|gb|CF034163.1|CF034163
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|211322184|gb|FK979481.1|FK979481
EST:     CTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGNANGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTA-GACC
genomic: CTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGA-GGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACC
EST: gi|22472597|gb|BU037077.1|BU037077
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|211195352|gb|FK979460.1|FK979460
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTA-GAACTACNGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|211192936|gb|FK979432.1|FK979432
EST:     CTCTTGCGCTTGAGAA-AAATATGGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTA-GAACTACG
genomic: CTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGG-AGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACG
EST: gi|32929206|gb|CF034018.1|CF034018
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|148931885|gb|EC877350.2|EC877350
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|148931067|gb|EC873678.2|EC873678
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGAC
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGAC
EST: gi|32928537|gb|CF033349.1|CF033349
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|6564100|gb|AW231722.1|AW231722
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|21390100|gb|BQ528149.1|BQ528149
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|211192950|gb|FK979446.1|FK979446
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|6636984|gb|AW261256.1|AW261256
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGCTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGNTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|211195346|gb|FK979454.1|FK979454
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAA-TATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTA-GACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|28909524|gb|CB330973.1|CB330973
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTG
EST: gi|32929111|gb|CF033923.1|CF033923
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|32848750|gb|CD988431.1|CD988431
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|32837200|gb|CD976878.1|CD976878
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTTGTT-ACAGACTATGCTGA
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTT-GTTTACAGACTATGCTGA
EST: gi|148996928|gb|EE035737.2|EE035737
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTANGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|67018030|gb|CO446779.1|CO446779
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|32929433|gb|CF034245.1|CF034245
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|32929642|gb|CF034454.1|CF034454
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGCC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|32928848|gb|CF033660.1|CF033660
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGGGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|32847307|gb|CD986988.1|CD986988
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|32837471|gb|CD977149.1|CD977149
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|32929091|gb|CF033903.1|CF033903
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGGAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|32849499|gb|CD989180.1|CD989180
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|32928412|gb|CF033224.1|CF033224
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCG
EST: gi|101393334|gb|EB818598.1|EB818598
EST:     CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGGGGTTAAGCGCGAAGATGGC                         GGACTTGTTTACAGACTATGCTGAC
genomic: CCTCTTGCGCTTGAGAAGAAATATGGAGGGTGGTTAAGCGCGAAGATGGCgtaagtcagt ... tgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGAC


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tatagaactggaaataccagattatacttatatatgtatacaatttgttttgtagGGACTTGTTTACAGACTATGCTGACTTCTGTTTTAAGACCTACGGCGATCGCGTAAAGCACTGGTTTACATTCAATGAGCCAAGGATAGTAGCGCTACTT
                                           tttgtttt  CT-rich tract
                    attatacttatatatg  TA-rich tract