1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
...ttgaagtaaaggagatccatggatctctccacacccatcctaggtgaagcagacctgtgaactttatgattagttgttgatgtactctcttcttttgcagTCCTTTTATCTTCCATGGGCTATGCTCTTATTGGATGTGATATTTGGGTCATCATTAATGCCTGGACTTCTGGGTATCATGGTTGGACATCTCTACTACT
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G117388_T04 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GAGAG-ATCCAAATGCTCAGATAAATATATACGGCCTCGTCCAATTGAGG TCCTTTTATCTTCCATGGGCTATGCTCTTATTGGATGTGATATTTGGGTCAEST: gi|21331882|gb|BQ487263.1|BQ487263
genomic: GAGAGAATCCAAATGCTCAGATAAATATATACGGCCTCGTCCAATTGAGGgtatgtaatt ... tcttttgcagTCCTTTTATCTTCCATGGGCTATGCTCTTATTGGATGTGATATTTGGGTCA
EST: GAGAGAATCCCAATGCTCAGATAAATATATACGGCCTCGTCCAATTGAGG TCCTTTTATCTTCCATGGGCTATGCTCTTATTGGATGTGATATTTGGGTCAEST: gi|211211598|gb|FL477381.1|FL477381
genomic: GAGAGAATCCAAATGCTCAGATAAATATATACGGCCTCGTCCAATTGAGGgtatgtaatt ... tcttttgcagTCCTTTTATCTTCCATGGGCTATGCTCTTATTGGATGTGATATTTGGGTCA
EST: GAGAGAATCCAAATGCTCAGATAAATATATACGGCCTCGTCCAATTGAGG TCCTTTTATCTTCCATGGGCTATGCTCTTATTGGATGTGATATTTGGGTCAEST: gi|211211597|gb|FL477380.1|FL477380
genomic: GAGAGAATCCAAATGCTCAGATAAATATATACGGCCTCGTCCAATTGAGGgtatgtaatt ... tcttttgcagTCCTTTTATCTTCCATGGGCTATGCTCTTATTGGATGTGATATTTGGGTCA
EST: GAATCCAAATGCTCAGATAAATATATACGGCCTCGTCCAATTGAGG TCCTTTTATCTTCCATGGGCTATGCTCTTATTGGATGTGATATTTGGGTCAEST: gi|40336279|gb|CK370349.1|CK370349
genomic: GAATCCAAATGCTCAGATAAATATATACGGCCTCGTCCAATTGAGGgtatgtaatt ... tcttttgcagTCCTTTTATCTTCCATGGGCTATGCTCTTATTGGATGTGATATTTGGGTCA
EST: GAGAGAATCCAAATGCTCAGATAAATATATACGGCCTCGTCCAATTGAGG TCCTTTTATCTTCCATGGGCTATGCTCTTATTGGATGTGATATTTGGGTCAEST: gi|60349033|gb|DN216006.1|DN216006
genomic: GAGAGAATCCAAATGCTCAGATAAATATATACGGCCTCGTCCAATTGAGGgtatgtaatt ... tcttttgcagTCCTTTTATCTTCCATGGGCTATGCTCTTATTGGATGTGATATTTGGGTCA
EST: GAGAGAATCCAAATGCTCAGATAAATATATACGGCCTCGTCCAATTGAGG TCCTTTTATCTTCCATGGGCTATGCTCTTATTGGATGTGATATTTGGGTCAEST: gi|211191572|gb|FL254972.1|FL254972
genomic: GAGAGAATCCAAATGCTCAGATAAATATATACGGCCTCGTCCAATTGAGGgtatgtaatt ... tcttttgcagTCCTTTTATCTTCCATGGGCTATGCTCTTATTGGATGTGATATTTGGGTCA
EST: GAGAGAATCCAAATGCTCAGATAAATATATACGGCCTCGTCCAATTGAGG TCCTTTTATCTTCCATGGGCTATGCTCTTATTGGATGTGATATTTGGGTCAEST: gi|211342720|gb|FL460317.1|FL460317
genomic: GAGAGAATCCAAATGCTCAGATAAATATATACGGCCTCGTCCAATTGAGGgtatgtaatt ... tcttttgcagTCCTTTTATCTTCCATGGGCTATGCTCTTATTGGATGTGATATTTGGGTCA
EST: AATGCTCAGATAAATATATACGGCCTCGTCCAATTGAGG TCCTTTTATCTTCCATGGGCTATGCTCTTATTGGATGTGATATTTGGGTCAEST: gi|71767311|gb|DR965248.1|DR965248
genomic: AATGCTCAGATAAATATATACGGCCTCGTCCAATTGAGGgtatgtaatt ... tcttttgcagTCCTTTTATCTTCCATGGGCTATGCTCTTATTGGATGTGATATTTGGGTCA
EST: GAGAGAATCCAAATGCTCAGATAAATATATACGGCCTCGTCCAATTGAGG TCCTTTTATCTTCCATGGGCTATGCTCTTATTGGATGTGATATTTGGGTCAEST: gi|211342721|gb|FL460318.1|FL460318
genomic: GAGAGAATCCAAATGCTCAGATAAATATATACGGCCTCGTCCAATTGAGGgtatgtaatt ... tcttttgcagTCCTTTTATCTTCCATGGGCTATGCTCTTATTGGATGTGATATTTGGGTCA
EST: GAGAGAATCCAAATGCTCAGATAAATATATACGGCCTCGTCCAATTGAGG TCCTTTTATCTTCCATGGGCTATGCTCTTATTGGATGTGATATTTGGGTCAEST: gi|211191573|gb|FL254973.1|FL254973
genomic: GAGAGAATCCAAATGCTCAGATAAATATATACGGCCTCGTCCAATTGAGGgtatgtaatt ... tcttttgcagTCCTTTTATCTTCCATGGGCTATGCTCTTATTGGATGTGATATTTGGGTCA
EST: GAGAGAATCCAAATGCTCAGATAAATATATACGGCCTCGTCCAATTGAGG TCCTTTTATCTTCCATGGGCTATGCTCTTATTGGATGTGATATTTGGGTCAEST: gi|67030179|gb|CO458928.1|CO458928
genomic: GAGAGAATCCAAATGCTCAGATAAATATATACGGCCTCGTCCAATTGAGGgtatgtaatt ... tcttttgcagTCCTTTTATCTTCCATGGGCTATGCTCTTATTGGATGTGATATTTGGGTCA
EST: GAGAGAATCCAAATGCTCAGATAAATATATACGGCCTCGTCCAATTGAGG TCCTTTTATCTTCCATGGGCTATGCTCTTATTGGATGTGATATTTGGGTCAEST: gi|16927150|gb|BM080219.1|BM080219
genomic: GAGAGAATCCAAATGCTCAGATAAATATATACGGCCTCGTCCAATTGAGGgtatgtaatt ... tcttttgcagTCCTTTTATCTTCCATGGGCTATGCTCTTATTGGATGTGATATTTGGGTCA
EST: GAGAGAATCCAAATGCTCAGATAAATATATACGGCCTCGTCCAATTGAGG TCCTTTTATCTTCCATGGGCTATGCTCTTATTGGATGTGATATTTGGGTCAEST: gi|37392930|gb|CF633718.1|CF633718
genomic: GAGAGAATCCAAATGCTCAGATAAATATATACGGCCTCGTCCAATTGAGGgtatgtaatt ... tcttttgcagTCCTTTTATCTTCCATGGGCTATGCTCTTATTGGATGTGATATTTGGGTCA
EST: GAGAGAATCCAAATGCTCAGATAAATATATACGGCCTCGTCCAATTGAGG TCCTTTTATCTTCCATGGGCTATGCTCTTATTGGATGTGATATTTGGGTCA
genomic: GAGAGAATCCAAATGCTCAGATAAATATATACGGCCTCGTCCAATTGAGGgtatgtaatt ... tcttttgcagTCCTTTTATCTTCCATGGGCTATGCTCTTATTGGATGTGATATTTGGGTCA
gaagcagacctgtgaactttatgattagttgttgatgtactctcttcttttgcagTCCTTTTATCTTCCATGGGCTATGCTCTTATTGGATGTGATATTTGGGTCATCATTAATGCCTGGACTTCTGGGTATCATGGTTGGACATCTCTACTACT
tgttgat putative branch site (score: 4)
tgtactctcttctttt CT-rich tract
tttatgatta TA-rich tract