1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
gtacataattatggcccatgatatgtcaaatgaaagattatagatgtacatatctttgtatgcttctgacagctattagcatttggttaaatattggccgtttgaattgaagatataacttgttgctgatatatattttttgtcaaattgtcattcagGTTGAGGACCCCTGTGGACAATGCCCTTAGAGATGCGAAGTTGCAGTTCAAAGATATTGATGAGGTTATTCTTGTCGGTGGCTCAACTAGAATACCAGCC
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G111475_T01 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ACTCTTACCAGGGCTAAATTTGAAGAGCTATGCTCAGATCTCCTTGACAG GTTGAGGACCCCTGTGGACAATGCCCTTAGAGATGCGAAGTTGCAGTTCAAEST: gi|26558488|gb|CA830723.1|CA830723
genomic: ACTCTTACCAGGGCTAAATTTGAAGAGCTATGCTCAGATCTCCTTGACAGgtacataatt ... tgtcattcagGTTGAGGACCCCTGTGGACAATGCCCTTAGAGATGCGAAGTTGCAGTTCAA
EST: ACTCTTACCAGGGCTAAATTTGAAGAGCTATGCTCAGATCTCCTTGACAG GTTGAGGACCCCTGTGGACAATGCCCTTAGAGATGCGAAGTTGCAGTTCAAEST: gi|22133613|gb|BQ833805.1|BQ833805
genomic: ACTCTTACCAGGGCTAAATTTGAAGAGCTATGCTCAGATCTCCTTGACAGgtacataatt ... tgtcattcagGTTGAGGACCCCTGTGGACAATGCCCTTAGAGATGCGAAGTTGCAGTTCAA
EST: ACTCTTACCAGGGCTAAATTTGAAGAGCTATGCTCAGATCTCCTTGACAG GTTGAGGACCCCTGTGGACAATGCCCTT
genomic: ACTCTTACCAGGGCTAAATTTGAAGAGCTATGCTCAGATCTCCTTGACAGgtacataatt ... tgtcattcagGTTGAGGACCCCTGTGGACAATGCCCTT
gaattgaagatataacttgttgctgatatatattttttgtcaaattgtcattcagGTTGAGGACCCCTGTGGACAATGCCCTTAGAGATGCGAAGTTGCAGTTCAAAGATATTGATGAGGTTATTCTTGTCGGTGGCTCAACTAGAATACCAGCC
tgctgat putative branch site (score: 104)
atatatattttttgtc TA-rich tract