1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
...ctgaaacctcttcgtacatcaattattggagttagtatttagggttgatagttgctaattttacttgtcgagcccaatgctatctgtttcatcttctcagGGTCAGCTGCAGTCACCTGGGGCTCAACAAACTTATGGAAGTTCACAACAAGGCGAAGCTAGTGCAGGAAATCAGGGAATGCTATCACCCTATAGATCCA
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G107491_T02 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ACCTCATGGCCTTGTCCAAGTGCCGAGCTGGAATTCATATCCT GGTCAGCTGCAGTCACCTGGGGCTCAACAAACTTATGGAAGTTCACAACAAEST: gi|211087415|gb|FL153990.1|FL153990
genomic: ACCTCATGGCCTTGTCCAAGTGCCGAGCTGGAATTCATATCCTgtaagttcat ... atcttctcagGGTCAGCTGCAGTCACCTGGGGCTCAACAAACTTATGGAAGTTCACAACAA
EST: TGGTTGTACCTCATGGCCTTGTCCAAGTGCCGAGCTGGAATTCATATCCT GGTCAGCTGCAGTCACCTGGGGCTCAACAAACTTATGGAAGTTCACAACAAEST: gi|32839671|gb|CD979352.1|CD979352
genomic: TGGTTGTACCTCATGGCCTTGTCCAAGTGCCGAGCTGGAATTCATATCCTgtaagttcat ... atcttctcagGGTCAGCTGCAGTCACCTGGGGCTCAACAAACTTATGGAAGTTCACAACAA
EST: ACCTCATGGCCTTGTCCAAGTGCCGAGCTGGAATTCATATCCT GGTCAGCTGCAGTCACCTGGGGCTCAACAAACTTATGGAAGTTCACAACAAEST: gi|32920955|gb|CF025767.1|CF025767
genomic: ACCTCATGGCCTTGTCCAAGTGCCGAGCTGGAATTCATATCCTgtaagttcat ... atcttctcagGGTCAGCTGCAGTCACCTGGGGCTCAACAAACTTATGGAAGTTCACAACAA
EST: ACCTCATGGCCTTGTCCAAGTGCCGAGCTGGAATTCATATCCT GGTCAGCTGCAGTCACCTGGGGCTCAACAAACTTATGGAAGTTCACAACAAEST: gi|32842543|gb|CD982224.1|CD982224
genomic: ACCTCATGGCCTTGTCCAAGTGCCGAGCTGGAATTCATATCCTgtaagttcat ... atcttctcagGGTCAGCTGCAGTCACCTGGGGCTCAACAAACTTATGGAAGTTCACAACAA
EST: GTACCTCATGGCCTTGTCCAAGTGCCGAGCTGGAATTCATATCCT GGTCAGCTGCAGTCACCTGGGGCTCAACAAACTTATGGAAGTTCACAACAAEST: gi|24934304|gb|CA452522.1|CA452522
genomic: GTACCTCATGGCCTTGTCCAAGTGCCGAGCTGGAATTCATATCCTgtaagttcat ... atcttctcagGGTCAGCTGCAGTCACCTGGGGCTCAACAAACTTATGGAAGTTCACAACAA
EST: GTACCTCATGGCCTTGTCCAAGTGCCGAGCTGGAATTCATATCCT GGTCAGCTGCAGTCACCTGGGGCTCAACAAACTTATGGAAGTTCACAACAAEST: gi|32921366|gb|CF026178.1|CF026178
genomic: GTACCTCATGGCCTTGTCCAAGTGCCGAGCTGGAATTCATATCCTgtaagttcat ... atcttctcagGGTCAGCTGCAGTCACCTGGGGCTCAACAAACTTATGGAAGTTCACAACAA
EST: ACCTCATGGCCTTGTCCAAGTGCCGAGCTGGAATTCATATCCT GGTCAGCTGCAGTCACCTGGGGCTCAACAAACTTATGGAAGTTCACAACAAEST: gi|76290171|gb|DV029739.1|DV029739
genomic: ACCTCATGGCCTTGTCCAAGTGCCGAGCTGGAATTCATATCCTgtaagttcat ... atcttctcagGGTCAGCTGCAGTCACCTGGGGCTCAACAAACTTATGGAAGTTCACAACAA
EST: TGGTTGTACCTCATGGCCTTGTCCAAGTGCCGAGCTGGAATTCATATCCT GGTCAGCTGCAGTCACCTGGGGCTCAACAAACTTATGGAAGTTCACAACAAEST: gi|32921013|gb|CF025825.1|CF025825
genomic: TGGTTGTACCTCATGGCCTTGTCCAAGTGCCGAGCTGGAATTCATATCCTgtaagttcat ... atcttctcagGGTCAGCTGCAGTCACCTGGGGCTCAACAAACTTATGGAAGTTCACAACAA
EST: GTACCTCATGGCC-TGTCCAAGTGCCGAGCTGGAATTCATATCCT GGTCAGCTGCAGTCACCTGGGGCTCAACAAACTTATGGAAGTTCACAACAAEST: gi|32839512|gb|CD979193.1|CD979193
genomic: GTACCTCATGGCCTTGTCCAAGTGCCGAGCTGGAATTCATATCCTgtaagttcat ... atcttctcagGGTCAGCTGCAGTCACCTGGGGCTCAACAAACTTATGGAAGTTCACAACAA
EST: ACCTCATGGCCTTGTCCAAGTGCCGAGCTGGAATTCATATCCT GGTCAGCTGCAGTCACCTGGGGCTCAACAAACTTATGGAAGTTCACAACAAEST: gi|32920651|gb|CF025463.1|CF025463
genomic: ACCTCATGGCCTTGTCCAAGTGCCGAGCTGGAATTCATATCCTgtaagttcat ... atcttctcagGGTCAGCTGCAGTCACCTGGGGCTCAACAAACTTATGGAAGTTCACAACAA
EST: ACCTCATGGCCTTGTCCAAGTGCCGAGCTGGAATTCATATCCT GGTCAGCTGCAGTCACCTGGGGCTCAACAAACTTATGGAAGTTCACAACAA
genomic: ACCTCATGGCCTTGTCCAAGTGCCGAGCTGGAATTCATATCCTgtaagttcat ... atcttctcagGGTCAGCTGCAGTCACCTGGGGCTCAACAAACTTATGGAAGTTCACAACAA
tgatagttgctaattttacttgtcgagcccaatgctatctgtttcatcttctcagGGTCAGCTGCAGTCACCTGGGGCTCAACAAACTTATGGAAGTTCACAACAAGGCGAAGCTAGTGCAGGAAATCAGGGAATGCTATCACCCTATAGATCCA
tgctaat putative branch site (score: 148)
tctgtttcatcttctc putative PPT
taattttactt TA-rich tract