Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...gaccgctgctctgtagttgcgtcaactgcagttatttgtcaccgaattttgtgataacatatgggcagtgtcatgatcttgtgatcatttatctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATGCCCATGATTGACCAG

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G104918_T03
intron # 5
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G104918_T03 (Zea mays), 3'ss of exon 5
lower sequence: LOC_Os04g59040.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 5
gaccgctgctctgtagttgcg--tcaactgcagt-tatttgtcaccgaattttgtgataacatatgg-gcagtgtcatgatcttgtgatcattta-tctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATGCCCATGATTGACCAG
       | | | |||||||   ||||   || | | ||| | ||   | | ||  |||   | ||      | || || |  |||| || |||| ||   ||||||||||||| |||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
-----tagttttttagttgcacctcaaaaccattctcttttttactacagtgtggaatatattgtgccattatctcgtggtaatgtgttcttttaatccacacagGAGCCTGTTATTCCTGGTTCCTTCCTCCGTGCTAGAGCAATTGGCCTTATGCCCATGATTGACCAG

upper sequence: GRMZM2G104918_T03 (Zea mays), 3'ss of exon 5
lower sequence: PP1S46_53V6.1 (Physcomitrella patens), 3'ss of exon 6
gaccgctgctctgtagttgcgtcaactgcagttatttgtcaccgaattttgtgataa---catatgggcagtgtcatgatcttgtgatcatttatctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATGCCCATGATTGACCAG
| |    |   || |    | || ||||  | |          ||  ||||   |      | ||||     ||  | ||      ||   ||     | ||||| |||||| | |||||| ||||| |  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || 
gtctatggaaatgaaagctc-tctactgaggatgcactaatgagatctttgcagtgtgtctaaatggttgaggtactcatacaagaatagcttgct--tgcagGAACCTGTTTTGCCTGGTACGTTCGTTCGAGCAAGAGCTATTGGGCTTATGCCCATGATTGATCAA
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|62550351|gb|DN830771.1|DN830771
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|5847381|gb|AW000460.1|AW000460
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211093920|gb|FK999173.1|FK999173
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|19436367|gb|BM952777.1|BM952777
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|32919721|gb|CF024533.1|CF024533
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211089012|gb|FK999151.1|FK999151
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|19057667|gb|BM736334.1|BM736334
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211096405|gb|FK999195.1|FK999195
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTRTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|19057482|gb|BM736149.1|BM736149
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211093922|gb|FK999175.1|FK999175
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTCGAGC
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGC
EST: gi|211101358|gb|FK999222.1|FK999222
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|19436825|gb|BM953235.1|BM953235
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211091463|gb|FK999166.1|FK999166
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|166585021|gb|EG190222.1|EG190222
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTAGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTG
EST: gi|6021306|gb|AW066234.1|AW066234
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211101353|gb|FK999217.1|FK999217
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATT
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATT
EST: gi|211096398|gb|FK999188.1|FK999188
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTAT
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTAT
EST: gi|211309977|gb|FL324776.1|FL324776
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGG
EST: gi|67017181|gb|CO445930.1|CO445930
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211091454|gb|FK999157.1|FK999157
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGARAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211089008|gb|FK999147.1|FK999147
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211101361|gb|FK999225.1|FK999225
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211096399|gb|FK999189.1|FK999189
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211091456|gb|FK999159.1|FK999159
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211103822|gb|FK999231.1|FK999231
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|32937680|gb|CF042499.1|CF042499
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|89106071|gb|DY576288.1|DY576288
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211093926|gb|FK999179.1|FK999179
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATT
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATT
EST: gi|211091450|gb|FK999153.1|FK999153
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTWCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTCGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211096403|gb|FK999193.1|FK999193
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|60393934|gb|DN226804.1|DN226804
EST:     AGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: AGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211091462|gb|FK999165.1|FK999165
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211101359|gb|FK999223.1|FK999223
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211098871|gb|FK999200.1|FK999200
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTRTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAAT
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAAT
EST: gi|19436366|gb|BM952776.1|BM952776
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|67033584|gb|CO462333.1|CO462333
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211091457|gb|FK999160.1|FK999160
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|113703472|gb|EE680976.1|EE680976
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211098881|gb|FK999210.1|FK999210
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211098878|gb|FK999207.1|FK999207
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|67021936|gb|CO450685.1|CO450685
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211091451|gb|FK999154.1|FK999154
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211096404|gb|FK999194.1|FK999194
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211089006|gb|FK999145.1|FK999145
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211093925|gb|FK999178.1|FK999178
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211093924|gb|FK999177.1|FK999177
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATT
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATT
EST: gi|211101349|gb|FK999213.1|FK999213
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211103818|gb|FK999227.1|FK999227
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211098872|gb|FK999201.1|FK999201
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|19436824|gb|BM953234.1|BM953234
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211089010|gb|FK999149.1|FK999149
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCT
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCT
EST: gi|211096394|gb|FK999184.1|FK999184
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGG
EST: gi|211096392|gb|FK999182.1|FK999182
EST:     GACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|15005394|gb|BI325461.1|BI325461
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|213173898|gb|FM195700.1|FM195700
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211101356|gb|FK999220.1|FK999220
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211096396|gb|FK999186.1|FK999186
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTRAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211098879|gb|FK999208.1|FK999208
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGG
EST: gi|18177661|gb|BM378871.1|BM378871
EST:     CCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: CCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|89106562|gb|DY576779.1|DY576779
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211089011|gb|FK999150.1|FK999150
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAR                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211098870|gb|FK999199.1|FK999199
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGG
EST: gi|74034986|gb|DT535476.1|DT535476
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTAGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211098880|gb|FK999209.1|FK999209
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211091452|gb|FK999155.1|FK999155
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCA
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCA
EST: gi|211093919|gb|FK999172.1|FK999172
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCYTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCC
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCC
EST: gi|211101357|gb|FK999221.1|FK999221
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211096397|gb|FK999187.1|FK999187
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTT
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTT
EST: gi|6269966|gb|AW157937.1|AW157937
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|19057483|gb|BM736150.1|BM736150
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211093923|gb|FK999176.1|FK999176
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211103821|gb|FK999230.1|FK999230
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211091458|gb|FK999161.1|FK999161
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|51592318|gb|CV071464.1|CV071464
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211091449|gb|FK999152.1|FK999152
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|32912207|gb|CF017019.1|CF017019
EST:     GGACTCTTTGTGAAGGCAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211098882|gb|FK999211.1|FK999211
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCA-TTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211089007|gb|FK999146.1|FK999146
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211096401|gb|FK999191.1|FK999191
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGC
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGC
EST: gi|211096395|gb|FK999185.1|FK999185
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|71439485|gb|DR820535.1|DR820535
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211096400|gb|FK999190.1|FK999190
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGGCCTTAT
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGG-CCTTAT
EST: gi|211101350|gb|FK999214.1|FK999214
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTTAGAGCAATTGGCCTTAT
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCT-AGAGCAATTGGCCTTAT
EST: gi|60336871|gb|DN203844.1|DN203844
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211093917|gb|FK999170.1|FK999170
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTAT
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTAT
EST: gi|211091453|gb|FK999156.1|FK999156
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGCTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211093916|gb|FK999169.1|FK999169
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211101362|gb|FK999226.1|FK999226
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|22490869|gb|BU050792.1|BU050792
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCGTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCA-TTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|31350632|gb|CD434989.1|CD434989
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|32912997|gb|CF017809.1|CF017809
EST:     GGACTCTTTGTGAAGGCAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211101360|gb|FK999224.1|FK999224
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|67023516|gb|CO452265.1|CO452265
EST:     TGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCACTGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|16916399|gb|BM072828.1|BM072828
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTAT-
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|24765735|gb|CA400894.1|CA400894
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATG
EST: gi|211098875|gb|FK999204.1|FK999204
EST:     GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAG                         GAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTT
genomic: GGACTCTTTGTGAAGACAATGACCCAATGGATGTGTTGGTCCTGATGCAGgttagtcagt ... atctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTT


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

attttgtgataacatatgggcagtgtcatgatcttgtgatcatttatctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATGCCCATGATTGACCAG
      tgataac  putative branch site (score: 2)
                                          tttatctct  putative PPT
        ataacatat  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
gaccgctgctctgtagttgcgtcaactgcagttatttgtcaccgaattttgtgataacatatgggcagtgtcatgatcttgtgatcatttatctctacagGAGCCTGTTGTTCCTGGTTCGTTCCTGAGAGCTAGAGCAATTGGCCTTATGCCCATGATTGACCAG

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AGAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AGAGCA