1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
gtatgcagatgtgcagagcaaaagtgacttgacattgcaaaaaacacatctggatcctatacactcatcattcacatttttttgttaacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTGTTGCTGATGGTGGTGAACTTCTCATGGCTCAGAGCTACGCTAAGAACA
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G094712_T04 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|67021032|gb|CO449781.1|CO449781
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAAGTCTTGACAAAGATGCTCANTCANTGCGTATGTTEST: gi|32846387|gb|CD986068.1|CD986068
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAA-GTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|32927251|gb|CF032063.1|CF032063
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|32847897|gb|CD987578.1|CD987578
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|32927820|gb|CF032632.1|CF032632
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|32933760|gb|CF038572.1|CF038572
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCTACATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|32930089|gb|CF034901.1|CF034901
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCANAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGC-TTGNCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTEST: gi|32799409|gb|CD951645.1|CD951645
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTG-CAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|32927942|gb|CF032754.1|CF032754
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|32804106|gb|CD956342.1|CD956342
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|32927133|gb|CF031945.1|CF031945
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|32927818|gb|CF032630.1|CF032630
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|32804249|gb|CD956485.1|CD956485
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|32933150|gb|CF037962.1|CF037962
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|32927166|gb|CF031978.1|CF031978
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|32839101|gb|CD978782.1|CD978782
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|31356146|gb|CD440503.1|CD440503
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGC-TTGCAAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTEST: gi|32866948|gb|CF006630.1|CF006630
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGC-AAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|32927936|gb|CF032748.1|CF032748
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|67039034|gb|CO465289.1|CO465289
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|67016151|gb|CO444900.1|CO444900
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|67024830|gb|CO453579.1|CO453579
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|38502478|gb|CF972338.1|CF972338
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|32804293|gb|CD956529.1|CD956529
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|31352660|gb|CD437017.1|CD437017
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|32927863|gb|CF032675.1|CF032675
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|32803562|gb|CD955798.1|CD955798
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|32927781|gb|CF032593.1|CF032593
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|32927877|gb|CF032689.1|CF032689
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|32799014|gb|CD951250.1|CD951250
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|32848067|gb|CD987748.1|CD987748
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|67030857|gb|CO459606.1|CO459606
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|32927823|gb|CF032635.1|CF032635
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|32927046|gb|CF031858.1|CF031858
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|88758523|gb|DY542892.1|DY542892
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|32927962|gb|CF032774.1|CF032774
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|67016138|gb|CO444887.1|CO444887
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|74052515|gb|DN591123.1|DN591123
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|32826589|gb|CD966267.1|CD966267
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|32827202|gb|CD966880.1|CD966880
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|32927701|gb|CF032513.1|CF032513
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTEST: gi|32927842|gb|CF032654.1|CF032654
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
EST: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAA GGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
genomic: AGCTGATGAGATCAAAATCACTGCTTCCGTTCTTTGACAGTGCCTATCAAgtatgcagat ... aacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTT
aaacacatctggatcctatacactcatcattcacatttttttgttaacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTGTTGCTGATGGTGGTGAACTTCTCATGGCTCAGAGCTACGCTAAGAACA
tgttaac putative branch site (score: 450)
acatttttttgttaa TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| gtatgcagatgtgcagagcaaaagtgacttgacattgcaaaaaacacatctggatcctatacactcatcattcacatttttttgttaacctgacagGGCTTTGCAAGTGGAAGTCTTGACAAAGATGCTCAGTCAGTGCGTATGTTTGTTGCTGATGGTGGTGAACTTCTCATGGCTCAGAGCTACGCTAAGAACA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGTGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGAGCT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAAC