Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   		12  
 5'  3'   		13  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtaaagcacaaggtcttgttgtctctctactcctaaatttctctgaatttgcttatgtttgattgcagGTGGGTGCTTCAGTTGGATTCTTCTGGATCAGTCTTTTACTCAACTGCTCCTAGATGGGTGAGACAATCCAGTGGTGTCGATTTACCACAATATGCCAAT

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G037624_T01
intron # 5
splice site 3'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|71449425|gb|DR830475.1|DR830475
EST:     CAGCTGATGGGCATGCTCATGCTATTGTTTCATG                         GTGGGTGCTTCAGTTGGATTCTTCTGGATCAGTCTTTTACTCAACTGCTCC
genomic: CAGCTGATGGGCATGCTCATGCTATTGTTTCATGgtaaagcaca ... ttgattgcagGTGGGTGCTTCAGTTGGATTCTTCTGGATCAGTCTTTTACTCAACTGCTCC
EST: gi|5566862|gb|AI881773.1|AI881773
EST:     ATTGAGATAAAAGCAACAGCTGATGGGCATGCTCATGCTATTGGTTCATG                         GTGGGTGCTTCAGCTGGATTCTTCT
genomic: ATTGAGATAAAAGCAACAGCTGATGGGCATGCTCATGCTATTGTTTCATGgtaaagcaca ... ttgattgcagGTGGGTGCTTCAGTTGGATTCTTCT


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tcttgttgtctctctactcctaaatttctctgaatttgcttatgtttgattgcagGTGGGTGCTTCAGTTGGATTCTTCTGGATCAGTCTTTTACTCAACTGCTCCTAGATGGGTGAGACAATCCAGTGGTGTCGATTTACCACAATATGCCAAT
                    taaatttct  TA-rich tract