1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
gtacagttataggtttatagccatcgttccctttttcagttttcatgtctgctatggttttagggcataggtattaggtaggcactgacaagatatgtacttttcagGATACTATGGGGCTCCGATCCTTTGTTGCTGGCGGTAAGCTACTACAG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM5G841360_T01 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CTACAAACAGGGACCCCGCTGCTCAGTTCCTTGTTACTTTCAAAAACAAG GATACTATGGGGCTCCGATCCTTTGTTGCTGGCGGTAAGCTACTACAGEST: gi|37385549|gb|CF629921.1|CF629921
genomic: CTACAAACAGGGACCCCGCTGCTCAGTTCCTTGTTACTTTCAAAAACAAGgtacagttat ... tacttttcagGATACTATGGGGCTCCGATCCTTTGTTGCTGGCGGTAAGCTACTACAG
EST: CTACAAACAGGGACCCCGCTGCTCAGTTCCTTGTTACTTTCAAAAACAAG GATACTATGGGGCTCCGATCCTTTGTTGCTGGCGGTAAGCTACTACAGEST: gi|60356242|gb|DN223215.1|DN223215
genomic: CTACAAACAGGGACCCCGCTGCTCAGTTCCTTGTTACTTTCAAAAACAAGgtacagttat ... tacttttcagGATACTATGGGGCTCCGATCCTTTGTTGCTGGCGGTAAGCTACTACAG
EST: CTACAAACAGGGACCCCGCTGCTCAGTTCCTTGTTACTTTCAAAAACAAG GATACTATGGGGCTCCGATCCTTTGTTGCTGGCGGTAAGCTACTACAGEST: gi|18659321|gb|BM500276.1|BM500276
genomic: CTACAAACAGGGACCCCGCTGCTCAGTTCCTTGTTACTTTCAAAAACAAGgtacagttat ... tacttttcagGATACTATGGGGCTCCGATCCTTTGTTGCTGGCGGTAAGCTACTACAG
EST: CTACAAACAGGGACCCCGCTGCTCAGTTCCTTGTTACTTTCAAAAACAAG GATACTATGGGGCTCCGATCCTTTGTTGCTGGCGGTAAGCTACTACAGEST: gi|24768536|gb|CA403665.1|CA403665
genomic: CTACAAACAGGGACCCCGCTGCTCAGTTCCTTGTTACTTTCAAAAACAAGgtacagttat ... tacttttcagGATACTATGGGGCTCCGATCCTTTGTTGCTGGCGGTAAGCTACTACAG
EST: CTACAAACAGGGACCCCGCTGCTCAGTTCCTTGTTACTTTCAAAAACAAG GATACTATGGGGCTCCGATCCTTTGTTGCTGGCGGTAAGCTACTACAG
genomic: CTACAAACAGGGACCCCGCTGCTCAGTTCCTTGTTACTTTCAAAAACAAGgtacagttat ... tacttttcagGATACTATGGGGCTCCGATCCTTTGTTGCTGGCGGTAAGCTACTACAG
tatggttttagggcataggtattaggtaggcactgacaagatatgtacttttcagGATACTATGGGGCTCCGATCCTTTGTTGCTGGCGGTAAGCTACTACAG
cactgac putative branch site (score: 61)
tacttttc putative PPT
aagatat TA-rich tract