1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
gtcggtaaagctgtgaatctttctttctttcttatcctgcgaatcaatttgactgttttactggcttcttaaattaacttccgaaaaaaattgttcctttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGGAGGAGATGTACCTGGAGGAGACAAAGGACCAGGACGCTGGAGGCGGCG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G458728_T07 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|89249475|gb|DY621261.1|DY621261
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|93015843|gb|EB641363.1|EB641363
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|149109652|gb|EE293440.2|EE293440
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|50329068|gb|CO524194.1|CO524194
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|78105639|gb|DV524057.1|DV524057
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|148986387|gb|EE030125.2|EE030125
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|148966560|gb|EE017586.2|EE017586
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|149097969|gb|EE183914.2|EE183914
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|149074574|gb|EE162974.2|EE162974
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|149099651|gb|EE185699.2|EE185699
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|148961404|gb|EE012144.2|EE012144
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|149020750|gb|EE154411.2|EE154411
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|50331343|gb|CO526469.1|CO526469
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|149027244|gb|EE046442.2|EE046442
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|149097019|gb|EE182823.2|EE182823
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|148963370|gb|EE014371.2|EE014371
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGGCTGTGGAAGCCTATGGGEST: gi|50324386|gb|CO519512.1|CO519512
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGC-GGCTGTGGAAGCCTAT-GG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|149042744|gb|EE047262.2|EE047262
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|148970835|gb|EE021605.2|EE021605
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|149105935|gb|EE291560.2|EE291560
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|148993344|gb|EE033760.2|EE033760
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|148939304|gb|EC883813.2|EC883813
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|76020309|gb|DT947479.1|DT947479
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|88754679|gb|DY538820.1|DY538820
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: TTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAACAAACCGGGCTCACCAGGAAGTCAG GTGTCCAAATGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTEST: gi|86474648|gb|DY241018.1|DY241018
genomic: TTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGG-AGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGT
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|91052150|gb|EB162568.1|EB162568
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|148983081|gb|EE028996.2|EE028996
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|76291302|gb|DV030870.1|DV030870
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|88747137|gb|DY531278.1|DY531278
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|149102690|gb|EE288040.2|EE288040
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|78085152|gb|DV513545.1|DV513545
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|148954405|gb|EC899823.2|EC899823
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|76916977|gb|DV166633.1|DV166633
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: TCGGACAAGGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|148970378|gb|EE021236.2|EE021236
genomic: TCGGACAA-GATCATGCTCGCCAAGCAAACC-GGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|148953673|gb|EC899034.2|EC899034
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|101401659|gb|EB822493.1|EB822493
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|149102176|gb|EE188110.2|EE188110
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGATTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|148986585|gb|EE030349.2|EE030349
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|71298538|gb|DR785245.1|DR785245
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|71430238|gb|DR811288.1|DR811288
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|148951929|gb|EC897706.2|EC897706
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: CAGGAGTCAAG GTGTCCATTTGTTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTEST: gi|149090270|gb|EE179573.2|EE179573
genomic: CAGGAGTC-AGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGT
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|78088879|gb|DV517272.1|DV517272
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|149099885|gb|EE185938.2|EE185938
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|148991536|gb|EE033060.2|EE033060
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|78115782|gb|DV534170.1|DV534170
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|86467856|gb|DY234226.1|DY234226
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|50329357|gb|CO524483.1|CO524483
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|74232659|gb|DT640573.1|DT640573
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|148936201|gb|EC880274.2|EC880274
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|149083776|gb|EE173141.2|EE173141
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|149051844|gb|EE155971.2|EE155971
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|76286143|gb|DV025711.1|DV025711
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|110195507|gb|EC877404.1|EC877404
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGEST: gi|88748054|gb|DY532195.1|DY532195
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
EST: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAG GTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
genomic: ATTCGGACAAGATCATGCTCGCCAAGCAAACCGGGCTCACCAGGAGTCAGgtcggtaaag ... tttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTG
ctgttttactggcttcttaaattaacttccgaaaaaaattgttcctttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGGAGGAGATGTACCTGGAGGAGACAAAGGACCAGGACGCTGGAGGCGGCG
aattaac putative branch site (score: 38)
ttgttcctttctgtt putative PPT
ttcttaaattaactt TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| gtcggtaaagctgtgaatctttctttctttcttatcctgcgaatcaatttgactgttttactggcttcttaaattaacttccgaaaaaaattgttcctttctgttagGTGTCCAATTGGTTCATCAATGCGAGGGTGCGGCTGTGGAAGCCTATGGTGGAGGAGATGTACCTGGAGGAGACAAAGGACCAGGACGCTGGAGGCGGCG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGGAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGATG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGGAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGGAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCTGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAGG