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Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtaatcatgcttgcacttattgtctgtcataaaattggatttagttacagctggcaatatctgataatgcctaccatctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATCTTGTGAACGAGACTAAGCTTGACAGCGAGATTAAGTCTTGGCTTGCTTT

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G149751_T06
intron # 4
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G149751_T02 (Zea mays), 3'ss of exon 6
lower sequence: LOC_Os12g42884.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 6
----gtaatcatgcttgcacttattgtctgtcataaaattggat--------ttagttacagctggcaatatct-----------------gataatgcctaccatctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATCTTGTGAACGAGACTAAGCTTGACAGCGAGATTAAGTCTTGGCTTGCTTT
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gtaagcaattaagcatgaagttattatatatgttatattttaatgggcacaatttgcagtatccaataatatcctcaatttctgctcatccaacaatacctttcatttctgtagACAAGCTTGTGGTCTCGACTTCCTGCTCACTCATGCACACCGCTGTGGATCTTGTAAATGAGACCAAGCTCGATAGCGAGATTAAGTCATGGCTTGCTTT

upper sequence: GRMZM2G149751_T02 (Zea mays), 3'ss of exon 6
lower sequence: LOC_Os12g42876.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 5
----gtaatcatgcttgcacttattgt--ctgtcataa---aattgg---atttagttacagctggcaatatct-----------------gataatgcctaccatctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATCTTGTGAACGAGACTAAGCTTGACAGCGAGATTAAGTCTTGGCTTGCTTT
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gtaagcaattaagcatgaagttattatatctgttatattttaataggtacaatttgctgtatccaataatatcctcaatttctgcacatccaacaatacctttcatttctgcagACAAGCTTGTGGTCTCGACTTCCTGCTCACTCATGCACACCGCTGTGGATCTTGTAAATGAGACCAAGCTCGATAGCGAGATTAAGTCATGGCTCGCTTT
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|5566727|gb|AI881593.1|AI881593
EST:     CTTGAGGCTGTTGCTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: CTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211083043|gb|FL423995.1|FL423995
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211263537|gb|FL369192.1|FL369192
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211106466|gb|FL269549.1|FL269549
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211214548|gb|FL384289.1|FL384289
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211445887|gb|FL403734.1|FL403734
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|71436763|gb|DR817813.1|DR817813
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211062883|gb|FL385125.1|FL385125
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211059641|gb|FL374513.1|FL374513
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCCGCTGTGGAT
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACC-GCTGTGGAT
EST: gi|211106464|gb|FL269547.1|FL269547
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211392877|gb|FL400615.1|FL400615
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTG
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTG
EST: gi|211199604|gb|FL408267.1|FL408267
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTTGTGGAT
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCT-GTGGAT
EST: gi|67018424|gb|CO447173.1|CO447173
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211106465|gb|FL269548.1|FL269548
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211107368|gb|FL269551.1|FL269551
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|18650007|gb|BM498826.1|BM498826
EST:     CCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: CCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211461646|gb|FL410735.1|FL410735
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211199168|gb|FL385131.1|FL385131
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211300927|gb|FL387927.1|FL387927
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211221450|gb|FL389604.1|FL389604
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTG
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTG
EST: gi|211357841|gb|FL383499.1|FL383499
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGNATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|33101475|gb|CF061435.1|CF061435
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211258668|gb|FL369169.1|FL369169
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211107371|gb|FL269554.1|FL269554
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211156639|gb|FL401279.1|FL401279
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTTGNCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGGCACACCGCTG
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTT-GTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATG-CACACCGCTG
EST: gi|211332405|gb|FL404943.1|FL404943
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211303138|gb|FL392462.1|FL392462
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211020410|gb|FL417359.1|FL417359
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAAG                         ACAAGCTTGTCGNATCAACTTCCTGCTCGCTCATGGACACCG
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCG
EST: gi|211298414|gb|FL370613.1|FL370613
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211374585|gb|FL413736.1|FL413736
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCAGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211019868|gb|FL398175.1|FL398175
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         AAAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCA
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCA
EST: gi|23199684|gb|BU582249.1|BU582249
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|33101251|gb|CF061211.1|CF061211
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211456530|gb|FL403805.1|FL403805
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACA
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACA
EST: gi|9952035|gb|BE638618.1|BE638618
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211168264|gb|FL426160.1|FL426160
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211390246|gb|FL400599.1|FL400599
EST:     GCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGNNAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCCTGCTCGCTCATGCACACC
genomic: GCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGG-AAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCC-TGCTCGCTCATGCACACC
EST: gi|33101222|gb|CF061182.1|CF061182
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211061355|gb|FL332106.1|FL332106
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACT
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACT
EST: gi|211338871|gb|FL392005.1|FL392005
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|33102528|gb|CF062488.1|CF062488
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|33101156|gb|CF061116.1|CF061116
EST:     TCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|18384329|gb|BM417528.1|BM417528
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211107370|gb|FL269553.1|FL269553
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|60358604|gb|DN225577.1|DN225577
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211184472|gb|FL377613.1|FL377613
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211164581|gb|FL395492.1|FL395492
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|148941572|gb|EC886508.2|EC886508
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|211451589|gb|FL371684.1|FL371684
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
EST: gi|32845718|gb|CD985399.1|CD985399
EST:     TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGG                         ACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC
genomic: TGCTACATCTCTCAGCACTCTCCAGTCTCTTGAGGCTGTTGTTGGGAAGGgtaatcatgc ... atctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATC


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

aaaattggatttagttacagctggcaatatctgataatgcctaccatctgttcagACAAGCTTGTCGTATCAACTTCCTGCTCGCTCATGCACACCGCTGTGGATCTTGTGAACGAGACTAAGCTTGACAGCGAGATTAAGTCTTGGCTTGCTTT
                            atctgat  putative branch site (score: 4)
                                              tctgttc  putative PPT
        atttagtta  TA-rich tract