Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtcagttatttttactttttgcatttacaatttcaaatttgaccaaaccaagggacattctagaacttttactaaacttgtatacaactctgtattgcttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATGGTCAGCATGCTCCTTTATGTCTGGAGCCGAGAGAATCCAAATGCTCAGA

Basic information

species Zea mays
transcript GRMZM2G117388_T01
intron # 4
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: GRMZM2G117388_T04 (Zea mays), 3'ss of exon 4
lower sequence: LOC_Os05g09550.3 (Oryza sativa), 3'ss of exon 3
gtcagttatttttactttttgcatttacaatttcaaatttgaccaaaccaagggacattctagaacttttactaaact--tgtatacaactctgtattgcttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATGGTCAGCATGCTCCTTTATGTCTGGAGCCGAGAGAATCCAAATGCTCAGA
    || | |  ||  || | | | ||   ||   |  || | || |||     | |||| |    ||  ||| |  |  |  ||| || ||| | ||||||| ||||||  |||||   ||||||| |  |  ||  || |||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||
----gtcagtgctagcttgtac-tgtatttttagcagcttaatcagaccttaaaa-attcaattcattggactcacatactacatataaatctttcttgcttggatcagGCATTGTCAGCTATTCCCTTCCTGGATATTTATTTCTTGGGAGTACCCATGGTCAGCATGCTTCTTTATGTCTGGAGCAGAGAATATCCGAATTCTCAGA
















Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|211262952|gb|FL116383.1|FL116383
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTA
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTA
EST: gi|60672357|gb|DN475118.1|DN475118
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCCATG
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|32945665|gb|CF050484.1|CF050484
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|24934294|gb|CA452512.1|CA452512
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCCTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|211262954|gb|FL116385.1|FL116385
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATCATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATT
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATT
EST: gi|33102075|gb|CF062035.1|CF062035
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|211028976|gb|FL127255.1|FL127255
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|211028975|gb|FL127254.1|FL127254
EST:     ACTGCAGATTNCTTACNKGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATA
genomic: ACTGCAGATTTCTTAT--GGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATA
EST: gi|211028980|gb|FL127259.1|FL127259
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|211267823|gb|FL116411.1|FL116411
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|67040755|gb|CO467010.1|CO467010
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|211262955|gb|FL116386.1|FL116386
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTA
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTA
EST: gi|211211598|gb|FL477381.1|FL477381
EST:     TATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATCCCCCTATTCAA-TCTTTTTTCTTAGGAATACNTATG
genomic: TATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|211267821|gb|FL116409.1|FL116409
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|211265387|gb|FL116393.1|FL116393
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|211267816|gb|FL116404.1|FL116404
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|211267827|gb|FL116415.1|FL116415
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTT
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTT
EST: gi|211028978|gb|FL127257.1|FL127257
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|40336279|gb|CK370349.1|CK370349
EST:     TATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: TATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|211267822|gb|FL116410.1|FL116410
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATT
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATT
EST: gi|32932771|gb|CF037583.1|CF037583
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|211265385|gb|FL116391.1|FL116391
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTC
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTC
EST: gi|211262956|gb|FL116387.1|FL116387
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTT
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTT
EST: gi|71767312|gb|DR965249.1|DR965249
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|60349033|gb|DN216006.1|DN216006
EST:     GGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|211267828|gb|FL116416.1|FL116416
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|211028983|gb|FL127262.1|FL127262
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|211028979|gb|FL127258.1|FL127258
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|93012514|gb|EB638034.1|EB638034
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|67029845|gb|CO458594.1|CO458594
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|211267824|gb|FL116412.1|FL116412
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTNTTCTTAGGAATACCTAT
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTT-TTCTTAGGAATACCTAT
EST: gi|211028981|gb|FL127260.1|FL127260
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|67018558|gb|CO447307.1|CO447307
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|71438420|gb|DR819470.1|DR819470
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|211265388|gb|FL116394.1|FL116394
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GNGGNTGGCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCCTA
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGT-TGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACC-TA
EST: gi|211028977|gb|FL127256.1|FL127256
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATAC
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATAC
EST: gi|93015533|gb|EB641053.1|EB641053
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|71767311|gb|DR965248.1|DR965248
EST:     AGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|211267819|gb|FL116407.1|FL116407
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGNTGGCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|71438460|gb|DR819510.1|DR819510
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|16927150|gb|BM080219.1|BM080219
EST:     TGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: TGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|211265393|gb|FL116399.1|FL116399
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAAWTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|211267825|gb|FL116413.1|FL116413
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|211265383|gb|FL116389.1|FL116389
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|21389975|gb|BQ528024.1|BQ528024
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|111145818|gb|EE257958.1|EE257958
EST:     GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GGACTGCAGATTTCTTATGGATGATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
EST: gi|37392930|gb|CF633718.1|CF633718
EST:     GATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTG                         GTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG
genomic: GATGATATTTGGTGCCATCTCACTATTGgtcagttatt ... cttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATG


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

ggacattctagaacttttactaaacttgtatacaactctgtattgcttgaatcagGTGTTGTCTATTATTCCCCTATTCAATTCTTTTTTCTTAGGAATACCTATGGTCAGCATGCTCCTTTATGTCTGGAGCCGAGAGAATCCAAATGCTCAGA
                 tactaaa  putative branch site (score: 1)
              ttttactaaa  TA-rich tract